MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Thermus oshimai JL-2 plasmid pTHEOS02

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019388	GGGCT	2	10	360	369	0 %	20 %	60 %	20 %	410731196
2	NC_019388	GGCGG	2	10	531	540	0 %	0 %	80 %	20 %	410731196
3	NC_019388	AGGGC	2	10	964	973	20 %	0 %	60 %	20 %	410731197
4	NC_019388	TCCCC	2	10	3515	3524	0 %	20 %	0 %	80 %	410731201
5	NC_019388	ACCCC	3	15	4690	4704	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
6	NC_019388	AGGGG	2	10	4826	4835	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019388	GAGCG	2	10	7180	7189	20 %	0 %	60 %	20 %	410731205
8	NC_019388	AGGGG	2	10	8133	8142	20 %	0 %	80 %	0 %	410731205
9	NC_019388	ACCTC	2	10	9193	9202	20 %	20 %	0 %	60 %	410731206
10	NC_019388	TTCCT	2	10	9409	9418	0 %	60 %	0 %	40 %	410731207
11	NC_019388	TGGCC	2	10	10020	10029	0 %	20 %	40 %	40 %	410731208
12	NC_019388	GCGGA	2	10	12010	12019	20 %	0 %	60 %	20 %	410731214
13	NC_019388	GCCCT	2	10	13087	13096	0 %	20 %	20 %	60 %	410731216
14	NC_019388	AGGCG	2	10	16060	16069	20 %	0 %	60 %	20 %	410731224
15	NC_019388	TCCAG	2	10	16751	16760	20 %	20 %	20 %	40 %	410731226
16	NC_019388	CCTCC	2	10	16941	16950	0 %	20 %	0 %	80 %	410731226
17	NC_019388	CCCAG	2	10	20994	21003	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
18	NC_019388	GGCCC	2	10	21594	21603	0 %	0 %	40 %	60 %	410731230
19	NC_019388	TGACC	2	10	25106	25115	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_019388	GTGGC	2	10	25951	25960	0 %	20 %	60 %	20 %	410731234
21	NC_019388	CCTCC	2	10	27500	27509	0 %	20 %	0 %	80 %	410731237
22	NC_019388	CCTCC	2	10	27635	27644	0 %	20 %	0 %	80 %	410731237
23	NC_019388	GCGGG	2	10	29116	29125	0 %	0 %	80 %	20 %	410731239
24	NC_019388	ACGCC	2	10	29521	29530	20 %	0 %	20 %	60 %	410731241
25	NC_019388	CCGGG	2	10	30296	30305	0 %	0 %	60 %	40 %	410731242
26	NC_019388	TAGCC	2	10	31257	31266	20 %	20 %	20 %	40 %	410731244
27	NC_019388	GTGCG	2	10	32146	32155	0 %	20 %	60 %	20 %	410731246
28	NC_019388	GGCGG	2	10	36378	36387	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
29	NC_019388	GGGGC	2	10	39619	39628	0 %	0 %	80 %	20 %	410731252
30	NC_019388	CGGGG	2	10	40785	40794	0 %	0 %	80 %	20 %	410731254
31	NC_019388	TCCCT	2	10	43159	43168	0 %	40 %	0 %	60 %	410731256
32	NC_019388	CAGGT	2	10	44159	44168	20 %	20 %	40 %	20 %	410731257
33	NC_019388	GCCCC	2	10	44694	44703	0 %	0 %	20 %	80 %	410731258
34	NC_019388	TCCCC	2	10	47118	47127	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
35	NC_019388	GGAGC	2	10	47595	47604	20 %	0 %	60 %	20 %	410731261
36	NC_019388	CCCTC	2	10	49377	49386	0 %	20 %	0 %	80 %	410731263
37	NC_019388	AGGGC	2	10	51305	51314	20 %	0 %	60 %	20 %	410731264
38	NC_019388	GAACC	2	10	54235	54244	40 %	0 %	20 %	40 %	410731266

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.