MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermus oshimai JL-2

Total Repeats: 141

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019386	GCGAA	2	10	40484	40493	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_019386	GGCGC	2	10	47140	47149	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3	NC_019386	ACCCC	2	10	86075	86084	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
4	NC_019386	GGGTA	2	10	91395	91404	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019386	TGGGC	2	10	105997	106006	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6	NC_019386	GCCCC	2	10	124862	124871	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
7	NC_019386	TCCCT	2	10	140838	140847	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
8	NC_019386	GGGGC	2	10	143879	143888	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
9	NC_019386	CCCGA	2	10	153076	153085	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
10	NC_019386	CCCGC	2	10	162149	162158	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
11	NC_019386	TGACT	2	10	198653	198662	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_019386	CACGA	2	10	220021	220030	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_019386	GGGAG	2	10	259845	259854	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019386	TGCTA	2	10	274618	274627	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_019386	TACTC	2	10	299742	299751	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_019386	GCCTC	2	10	302617	302626	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
17	NC_019386	AGGGG	2	10	311803	311812	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019386	CGCCC	2	10	342454	342463	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
19	NC_019386	GCCTG	2	10	365745	365754	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_019386	ATAGC	2	10	397231	397240	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_019386	GCCCT	2	10	397291	397300	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
22	NC_019386	CGGGG	2	10	419125	419134	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
23	NC_019386	CCTCC	2	10	427058	427067	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
24	NC_019386	ACTAG	2	10	427200	427209	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_019386	GCTAC	2	10	427563	427572	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_019386	CTACC	2	10	441874	441883	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
27	NC_019386	AAGCC	2	10	467597	467606	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_019386	TACCC	2	10	481435	481444	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
29	NC_019386	CCTTT	2	10	507119	507128	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_019386	TGGGG	2	10	526179	526188	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019386	GGCGG	2	10	526257	526266	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
32	NC_019386	TGCTA	2	10	526931	526940	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_019386	GTAGG	2	10	552223	552232	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019386	GGGGC	2	10	554538	554547	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
35	NC_019386	GCCCA	2	10	636424	636433	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
36	NC_019386	AAAAG	2	10	679400	679409	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019386	AGGGG	2	10	693340	693349	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019386	CGGGG	2	10	694978	694987	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
39	NC_019386	AAGGG	2	10	745665	745674	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019386	TGGGG	2	10	745727	745736	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019386	GCCCT	2	10	763537	763546	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
42	NC_019386	TGGGG	2	10	763550	763559	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019386	AGGGG	2	10	775344	775353	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019386	CCCCT	2	10	778664	778673	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
45	NC_019386	CCAGG	2	10	779144	779153	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
46	NC_019386	CTTTT	2	10	780229	780238	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_019386	TGGCC	2	10	782843	782852	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
48	NC_019386	GGGCC	2	10	817439	817448	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
49	NC_019386	AGGAG	2	10	831742	831751	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019386	TCCTT	2	10	835464	835473	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
51	NC_019386	GGAAA	2	10	878610	878619	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019386	TGGCC	2	10	879526	879535	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
53	NC_019386	CTACG	2	10	880179	880188	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
54	NC_019386	GGACC	2	10	894576	894585	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
55	NC_019386	CTTTA	2	10	902244	902253	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_019386	CTGGC	2	10	902648	902657	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
57	NC_019386	GTGTA	2	10	914687	914696	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019386	GGCCT	2	10	921415	921424	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
59	NC_019386	CCCCG	2	10	929779	929788	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
60	NC_019386	TCCCT	2	10	945680	945689	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
61	NC_019386	CTAAC	2	10	945699	945708	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_019386	GGCCC	2	10	976597	976606	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
63	NC_019386	GCCCC	2	10	978377	978386	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
64	NC_019386	AGAGG	2	10	988220	988229	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019386	TTCCC	2	10	989640	989649	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
66	NC_019386	GCTAG	2	10	1046945	1046954	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_019386	AGAGA	2	10	1076090	1076099	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019386	GCCTG	2	10	1076161	1076170	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
69	NC_019386	GCCCG	2	10	1076232	1076241	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
70	NC_019386	GGGGA	2	10	1091715	1091724	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019386	CTGGG	2	10	1093836	1093845	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
72	NC_019386	TCCCC	2	10	1110128	1110137	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
73	NC_019386	CCCCG	2	10	1119342	1119351	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
74	NC_019386	AGGCG	2	10	1119437	1119446	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
75	NC_019386	CCGGG	2	10	1121688	1121697	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
76	NC_019386	CCCCA	2	10	1123825	1123834	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
77	NC_019386	CACCC	2	10	1140870	1140879	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
78	NC_019386	CGGGG	2	10	1189112	1189121	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
79	NC_019386	GCCAA	2	10	1189527	1189536	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_019386	CCCAC	2	10	1189613	1189622	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
81	NC_019386	CGGGG	2	10	1208512	1208521	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
82	NC_019386	TCTAG	2	10	1238085	1238094	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_019386	ACTAG	2	10	1249463	1249472	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_019386	GCTAC	2	10	1249826	1249835	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
85	NC_019386	CAGAA	2	10	1252461	1252470	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_019386	TCTCC	2	10	1259391	1259400	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
87	NC_019386	AGGCG	2	10	1266911	1266920	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
88	NC_019386	GCCTG	2	10	1272979	1272988	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
89	NC_019386	CAAGC	2	10	1319512	1319521	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
90	NC_019386	ACCCC	2	10	1329110	1329119	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
91	NC_019386	CCACC	2	10	1371596	1371605	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
92	NC_019386	GGGAA	2	10	1371624	1371633	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019386	GGGAC	2	10	1374439	1374448	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
94	NC_019386	TACAC	2	10	1397760	1397769	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_019386	CCTCC	2	10	1403260	1403269	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
96	NC_019386	CCAGG	2	10	1405695	1405704	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
97	NC_019386	GGGGC	2	10	1447734	1447743	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
98	NC_019386	CGAAG	2	10	1460921	1460930	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_019386	TCCTT	2	10	1461386	1461395	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
100	NC_019386	CCCTA	2	10	1470115	1470124	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
101	NC_019386	TACAC	2	10	1491234	1491243	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
102	NC_019386	GGGGC	2	10	1518732	1518741	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
103	NC_019386	AAAAC	2	10	1572453	1572462	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_019386	GCCCC	2	10	1620915	1620924	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
105	NC_019386	CCTTC	2	10	1629009	1629018	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
106	NC_019386	GGGGC	2	10	1635815	1635824	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
107	NC_019386	GCCTG	2	10	1644398	1644407	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
108	NC_019386	TTAGC	2	10	1664820	1664829	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_019386	CCCTG	2	10	1665345	1665354	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
110	NC_019386	CAAGC	2	10	1678857	1678866	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
111	NC_019386	GCCTT	2	10	1678930	1678939	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
112	NC_019386	TAGGC	2	10	1692199	1692208	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_019386	ACCCC	2	10	1728794	1728803	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
114	NC_019386	AGGAT	2	10	1738921	1738930	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019386	CCCTT	2	10	1781957	1781966	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
116	NC_019386	CCCCT	2	10	1805570	1805579	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
117	NC_019386	TACGG	2	10	1805798	1805807	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
118	NC_019386	CTCCC	2	10	1806910	1806919	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
119	NC_019386	TCCTC	2	10	1807223	1807232	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
120	NC_019386	CAAAA	2	10	1818661	1818670	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_019386	GGAAG	2	10	1819831	1819840	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019386	GTGGG	2	10	1824317	1824326	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019386	CTACC	2	10	1847997	1848006	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
124	NC_019386	TTACC	2	10	1848874	1848883	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
125	NC_019386	CCCCT	2	10	1872404	1872413	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
126	NC_019386	TACGG	2	10	1872632	1872641	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
127	NC_019386	CTCCC	2	10	1873744	1873753	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
128	NC_019386	TCCTC	2	10	1874057	1874066	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
129	NC_019386	CTTAC	2	10	1887761	1887770	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
130	NC_019386	TCGTG	2	10	1919919	1919928	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
131	NC_019386	GCTTG	2	10	1926263	1926272	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_019386	TACAC	2	10	1944102	1944111	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
133	NC_019386	GCCAG	2	10	1955173	1955182	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
134	NC_019386	CCCCT	2	10	1957470	1957479	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
135	NC_019386	AGGGG	2	10	1957669	1957678	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019386	CCCTT	2	10	2014103	2014112	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
137	NC_019386	GCCCC	2	10	2025504	2025513	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
138	NC_019386	GTGTA	2	10	2025527	2025536	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019386	CGCCC	2	10	2034202	2034211	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
140	NC_019386	CGGGG	2	10	2034220	2034229	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
141	NC_019386	AAAGG	2	10	2038223	2038232	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.