MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermus oshimai JL-2

Total Repeats: 109

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019386	GT	3	6	21944	21949	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019386	GA	3	6	57195	57200	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019386	GC	3	6	62771	62776	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_019386	TA	3	6	72009	72014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019386	GC	3	6	91450	91455	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_019386	GC	3	6	107510	107515	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_019386	AG	3	6	161913	161918	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019386	GA	4	8	185142	185149	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019386	GT	3	6	219701	219706	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019386	GT	3	6	219871	219876	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019386	GC	3	6	220224	220229	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_019386	GC	3	6	220271	220276	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_019386	GT	3	6	221098	221103	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019386	GC	3	6	227343	227348	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_019386	GC	3	6	239341	239346	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_019386	GA	3	6	264505	264510	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019386	GC	3	6	379399	379404	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_019386	GC	3	6	383535	383540	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_019386	AC	3	6	401699	401704	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_019386	GT	3	6	402315	402320	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019386	CT	3	6	412822	412827	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_019386	GA	3	6	429669	429674	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019386	CT	3	6	439023	439028	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_019386	GC	3	6	507612	507617	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_019386	GA	3	6	525698	525703	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019386	AG	3	6	544519	544524	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019386	GA	3	6	552187	552192	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019386	GC	3	6	554645	554650	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_019386	CG	3	6	590985	590990	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_019386	TC	3	6	596441	596446	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_019386	CT	3	6	626956	626961	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_019386	GC	3	6	662319	662324	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_019386	GC	3	6	677102	677107	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_019386	CG	4	8	677117	677124	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_019386	CG	3	6	677258	677263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_019386	GC	3	6	677420	677425	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_019386	AC	3	6	697554	697559	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_019386	GC	3	6	769562	769567	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_019386	GC	3	6	818826	818831	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_019386	GC	3	6	835727	835732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_019386	GC	3	6	880083	880088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_019386	GC	3	6	880857	880862	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_019386	CG	3	6	882390	882395	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_019386	GA	3	6	883875	883880	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019386	CG	3	6	903079	903084	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_019386	GA	3	6	940895	940900	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019386	CT	3	6	978371	978376	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_019386	GC	3	6	987944	987949	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_019386	AT	3	6	988556	988561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019386	GA	4	8	1041076	1041083	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019386	AC	3	6	1044486	1044491	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_019386	GC	3	6	1054421	1054426	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_019386	GC	3	6	1075905	1075910	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_019386	GC	3	6	1075981	1075986	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_019386	AG	3	6	1076291	1076296	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019386	CG	3	6	1119525	1119530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_019386	GC	3	6	1119771	1119776	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_019386	TG	3	6	1119819	1119824	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019386	CT	3	6	1172808	1172813	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_019386	AC	3	6	1192872	1192877	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_019386	TC	3	6	1253276	1253281	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_019386	CG	3	6	1259421	1259426	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_019386	TC	3	6	1259474	1259479	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_019386	GC	3	6	1266502	1266507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_019386	GC	3	6	1272472	1272477	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_019386	GC	3	6	1275903	1275908	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_019386	GT	3	6	1304593	1304598	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019386	TC	3	6	1319634	1319639	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_019386	TG	3	6	1341016	1341021	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019386	TA	3	6	1341044	1341049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019386	TA	3	6	1363285	1363290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019386	GC	3	6	1416513	1416518	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_019386	GC	3	6	1437281	1437286	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_019386	GC	3	6	1598766	1598771	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_019386	GC	3	6	1601752	1601757	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_019386	AG	3	6	1605096	1605101	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019386	GT	3	6	1615480	1615485	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019386	AG	3	6	1628304	1628309	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019386	CA	3	6	1629520	1629525	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_019386	AC	3	6	1638310	1638315	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_019386	GC	3	6	1665225	1665230	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_019386	TG	3	6	1804257	1804262	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019386	GA	3	6	1804750	1804755	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019386	CA	3	6	1805044	1805049	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_019386	AG	3	6	1805635	1805640	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019386	CG	3	6	1805756	1805761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_019386	TC	3	6	1807215	1807220	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_019386	AC	3	6	1855657	1855662	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_019386	GA	3	6	1871584	1871589	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019386	CA	3	6	1871878	1871883	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_019386	AG	3	6	1872469	1872474	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019386	CG	3	6	1872590	1872595	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_019386	TC	3	6	1874049	1874054	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_019386	AT	3	6	1906387	1906392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019386	CG	3	6	1915920	1915925	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_019386	GC	3	6	1919673	1919678	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_019386	GC	3	6	1919720	1919725	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_019386	AC	3	6	1920073	1920078	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_019386	AC	3	6	1920243	1920248	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_019386	GC	4	8	1935497	1935504	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_019386	CA	3	6	1944071	1944076	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_019386	GC	3	6	1944191	1944196	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_019386	GT	3	6	1945227	1945232	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019386	AC	3	6	1955521	1955526	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_019386	AG	3	6	1957659	1957664	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019386	AC	3	6	1958717	1958722	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_019386	AC	3	6	1964131	1964136	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_019386	GC	3	6	2036164	2036169	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_019386	GC	3	6	2057968	2057973	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.