MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bordetella bronchiseptica 253

Total Repeats: 5429

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019382	CAGCG	2	10	399	408	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2	NC_019382	GATCC	2	10	485	494	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_019382	CGCGG	2	10	1699	1708	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4	NC_019382	AACGC	2	10	2218	2227	40 %	0 %	20 %	40 %	412337341
5	NC_019382	CGGGT	2	10	2435	2444	0 %	20 %	60 %	20 %	412337341
6	NC_019382	GGCAC	2	10	6239	6248	20 %	0 %	40 %	40 %	412337349
7	NC_019382	ATCCG	2	10	7513	7522	20 %	20 %	20 %	40 %	412337351
8	NC_019382	GCCAG	2	10	7765	7774	20 %	0 %	40 %	40 %	412337351
9	NC_019382	CCGAT	2	10	8205	8214	20 %	20 %	20 %	40 %	412337352
10	NC_019382	GGGCA	2	10	8533	8542	20 %	0 %	60 %	20 %	412337353
11	NC_019382	GGGGA	2	10	8551	8560	20 %	0 %	80 %	0 %	412337353
12	NC_019382	TTTGC	2	10	8908	8917	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_019382	CTGGC	2	10	9907	9916	0 %	20 %	40 %	40 %	412337355
14	NC_019382	GGCAG	2	10	10913	10922	20 %	0 %	60 %	20 %	412337356
15	NC_019382	CCGGC	2	10	12148	12157	0 %	0 %	40 %	60 %	412337356
16	NC_019382	AAAGC	2	10	15272	15281	60 %	0 %	20 %	20 %	412337361
17	NC_019382	TGGCC	2	10	15678	15687	0 %	20 %	40 %	40 %	412337362
18	NC_019382	CGTGG	2	10	17137	17146	0 %	20 %	60 %	20 %	412337366
19	NC_019382	TCGGG	2	10	17286	17295	0 %	20 %	60 %	20 %	412337366
20	NC_019382	TCAGC	2	10	20815	20824	20 %	20 %	20 %	40 %	412337371
21	NC_019382	TGTCA	2	10	22303	22312	20 %	40 %	20 %	20 %	412337373
22	NC_019382	GGGCG	2	10	23143	23152	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
23	NC_019382	CCCAC	2	10	27960	27969	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
24	NC_019382	ATTCC	2	10	29859	29868	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_019382	ACAGA	2	10	31482	31491	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_019382	AAGTG	2	10	33891	33900	40 %	20 %	40 %	0 %	412337385
27	NC_019382	GAACC	2	10	35261	35270	40 %	0 %	20 %	40 %	412337388
28	NC_019382	TGCGC	2	10	35936	35945	0 %	20 %	40 %	40 %	412337388
29	NC_019382	CGACC	2	10	36131	36140	20 %	0 %	20 %	60 %	412337388
30	NC_019382	CCGGC	2	10	36806	36815	0 %	0 %	40 %	60 %	412337389
31	NC_019382	GCCCG	2	10	37970	37979	0 %	0 %	40 %	60 %	412337392
32	NC_019382	TCGTT	2	10	39105	39114	0 %	60 %	20 %	20 %	412337392
33	NC_019382	GCAGC	2	10	39280	39289	20 %	0 %	40 %	40 %	412337392
34	NC_019382	GTCCA	2	10	39429	39438	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_019382	GGCGT	2	10	39998	40007	0 %	20 %	60 %	20 %	412337394
36	NC_019382	GGCGC	2	10	44032	44041	0 %	0 %	60 %	40 %	412337399
37	NC_019382	GCAGC	2	10	45219	45228	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
38	NC_019382	TGGCA	2	10	45609	45618	20 %	20 %	40 %	20 %	412337400
39	NC_019382	GATTG	2	10	46429	46438	20 %	40 %	40 %	0 %	412337400
40	NC_019382	CGGCG	2	10	48215	48224	0 %	0 %	60 %	40 %	412337401
41	NC_019382	ATGGG	2	10	48945	48954	20 %	20 %	60 %	0 %	412337401
42	NC_019382	GCCGT	2	10	53754	53763	0 %	20 %	40 %	40 %	412337406
43	NC_019382	GCGGG	2	10	56567	56576	0 %	0 %	80 %	20 %	412337411
44	NC_019382	CGGCG	2	10	58406	58415	0 %	0 %	60 %	40 %	412337412
45	NC_019382	GCCGC	2	10	58529	58538	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
46	NC_019382	GTGCC	2	10	59445	59454	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
47	NC_019382	GGATG	2	10	61596	61605	20 %	20 %	60 %	0 %	412337418
48	NC_019382	GCGCC	2	10	65767	65776	0 %	0 %	40 %	60 %	412337422
49	NC_019382	GATGT	2	10	66767	66776	20 %	40 %	40 %	0 %	412337422
50	NC_019382	GAAGA	2	10	66860	66869	60 %	0 %	40 %	0 %	412337422
51	NC_019382	GGATG	2	10	69077	69086	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019382	ACGCC	2	10	69982	69991	20 %	0 %	20 %	60 %	412337424
53	NC_019382	GGGCA	2	10	72091	72100	20 %	0 %	60 %	20 %	412337427
54	NC_019382	GCCGC	2	10	72804	72813	0 %	0 %	40 %	60 %	412337428
55	NC_019382	CAGCG	2	10	73448	73457	20 %	0 %	40 %	40 %	412337429
56	NC_019382	CGGGG	2	10	74329	74338	0 %	0 %	80 %	20 %	412337430
57	NC_019382	GCGCG	2	10	74808	74817	0 %	0 %	60 %	40 %	412337430
58	NC_019382	GCGCA	2	10	75400	75409	20 %	0 %	40 %	40 %	412337431
59	NC_019382	CGCGC	2	10	75512	75521	0 %	0 %	40 %	60 %	412337431
60	NC_019382	TGCGC	2	10	76476	76485	0 %	20 %	40 %	40 %	412337432
61	NC_019382	CACGC	2	10	78163	78172	20 %	0 %	20 %	60 %	412337434
62	NC_019382	GCGCG	2	10	81027	81036	0 %	0 %	60 %	40 %	412337436
63	NC_019382	AGCTG	2	10	81293	81302	20 %	20 %	40 %	20 %	412337436
64	NC_019382	GCGGG	2	10	81366	81375	0 %	0 %	80 %	20 %	412337436
65	NC_019382	AAAAG	2	10	82361	82370	80 %	0 %	20 %	0 %	412337437
66	NC_019382	CCATG	2	10	84181	84190	20 %	20 %	20 %	40 %	412337439
67	NC_019382	CGGCG	2	10	84661	84670	0 %	0 %	60 %	40 %	412337439
68	NC_019382	CGATC	2	10	84973	84982	20 %	20 %	20 %	40 %	412337439
69	NC_019382	GGCCG	2	10	85334	85343	0 %	0 %	60 %	40 %	412337439
70	NC_019382	GCTGC	2	10	87630	87639	0 %	20 %	40 %	40 %	412337442
71	NC_019382	CGCGC	2	10	90648	90657	0 %	0 %	40 %	60 %	412337446
72	NC_019382	GCGCG	2	10	91246	91255	0 %	0 %	60 %	40 %	412337446
73	NC_019382	GAGCA	2	10	91311	91320	40 %	0 %	40 %	20 %	412337446
74	NC_019382	CCGCG	2	10	91664	91673	0 %	0 %	40 %	60 %	412337446
75	NC_019382	CGCGG	2	10	92825	92834	0 %	0 %	60 %	40 %	412337449
76	NC_019382	CCTGG	2	10	92984	92993	0 %	20 %	40 %	40 %	412337449
77	NC_019382	GCGGG	2	10	93307	93316	0 %	0 %	80 %	20 %	412337450
78	NC_019382	GCGCG	2	10	94749	94758	0 %	0 %	60 %	40 %	412337451
79	NC_019382	CGATC	2	10	97703	97712	20 %	20 %	20 %	40 %	412337454
80	NC_019382	GCGCC	3	15	97814	97828	0 %	0 %	40 %	60 %	412337454
81	NC_019382	GCCCA	2	10	98827	98836	20 %	0 %	20 %	60 %	412337455
82	NC_019382	GGCGC	2	10	99239	99248	0 %	0 %	60 %	40 %	412337456
83	NC_019382	CGGCG	2	10	100262	100271	0 %	0 %	60 %	40 %	412337456
84	NC_019382	TGCGC	2	10	101534	101543	0 %	20 %	40 %	40 %	412337457
85	NC_019382	CGCGG	2	10	101967	101976	0 %	0 %	60 %	40 %	412337458
86	NC_019382	AACGC	2	10	103495	103504	40 %	0 %	20 %	40 %	412337459
87	NC_019382	CGCGC	2	10	104208	104217	0 %	0 %	40 %	60 %	412337460
88	NC_019382	CAGGG	2	10	104370	104379	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
89	NC_019382	CGGCG	2	10	107365	107374	0 %	0 %	60 %	40 %	412337462
90	NC_019382	CGGCG	2	10	107594	107603	0 %	0 %	60 %	40 %	412337462
91	NC_019382	CGCGC	2	10	108838	108847	0 %	0 %	40 %	60 %	412337463
92	NC_019382	CCGGC	2	10	109555	109564	0 %	0 %	40 %	60 %	412337464
93	NC_019382	CAGGG	2	10	111069	111078	20 %	0 %	60 %	20 %	412337465
94	NC_019382	GCGGG	2	10	111154	111163	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
95	NC_019382	ATTCC	2	10	111332	111341	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
96	NC_019382	CGGCG	2	10	111444	111453	0 %	0 %	60 %	40 %	412337466
97	NC_019382	GGGCG	2	10	113898	113907	0 %	0 %	80 %	20 %	412337466
98	NC_019382	GGCCT	2	10	114199	114208	0 %	20 %	40 %	40 %	412337466
99	NC_019382	GGGCT	2	10	114361	114370	0 %	20 %	60 %	20 %	412337466
100	NC_019382	GGCCT	2	10	114526	114535	0 %	20 %	40 %	40 %	412337466
101	NC_019382	CAGCG	2	10	115606	115615	20 %	0 %	40 %	40 %	412337467
102	NC_019382	CGCTG	2	10	115865	115874	0 %	20 %	40 %	40 %	412337467
103	NC_019382	CGCGG	2	10	117352	117361	0 %	0 %	60 %	40 %	412337468
104	NC_019382	GGCGC	2	10	118442	118451	0 %	0 %	60 %	40 %	412337469
105	NC_019382	CGCGC	2	10	118671	118680	0 %	0 %	40 %	60 %	412337469
106	NC_019382	CGCGG	2	10	118917	118926	0 %	0 %	60 %	40 %	412337469
107	NC_019382	GTTGG	2	10	119953	119962	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019382	TCGTG	2	10	121063	121072	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
109	NC_019382	ACGGC	2	10	123212	123221	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
110	NC_019382	GCCGC	2	10	123846	123855	0 %	0 %	40 %	60 %	412337474
111	NC_019382	TCGCC	2	10	124449	124458	0 %	20 %	20 %	60 %	412337474
112	NC_019382	GGCGC	2	10	126451	126460	0 %	0 %	60 %	40 %	412337474
113	NC_019382	TGGGC	2	10	126639	126648	0 %	20 %	60 %	20 %	412337474
114	NC_019382	CTTCG	2	10	127370	127379	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_019382	GCACG	2	10	128009	128018	20 %	0 %	40 %	40 %	412337475
116	NC_019382	ACGGC	2	10	128398	128407	20 %	0 %	40 %	40 %	412337475
117	NC_019382	AGCGC	2	10	129174	129183	20 %	0 %	40 %	40 %	412337475
118	NC_019382	GCGCA	2	10	131319	131328	20 %	0 %	40 %	40 %	412337475
119	NC_019382	GACCT	2	10	131700	131709	20 %	20 %	20 %	40 %	412337475
120	NC_019382	GACGC	2	10	132399	132408	20 %	0 %	40 %	40 %	412337475
121	NC_019382	GCGCG	2	10	133901	133910	0 %	0 %	60 %	40 %	412337475
122	NC_019382	CAGGC	2	10	134223	134232	20 %	0 %	40 %	40 %	412337475
123	NC_019382	GGCGG	2	10	134403	134412	0 %	0 %	80 %	20 %	412337475
124	NC_019382	CGGCG	2	10	135659	135668	0 %	0 %	60 %	40 %	412337475
125	NC_019382	GAGCA	2	10	135708	135717	40 %	0 %	40 %	20 %	412337475
126	NC_019382	GGCAG	2	10	136822	136831	20 %	0 %	60 %	20 %	412337475
127	NC_019382	CCCCG	2	10	140092	140101	0 %	0 %	20 %	80 %	412337478
128	NC_019382	CAGCG	2	10	140157	140166	20 %	0 %	40 %	40 %	412337478
129	NC_019382	GCGCG	2	10	140269	140278	0 %	0 %	60 %	40 %	412337478
130	NC_019382	GACCA	2	10	140544	140553	40 %	0 %	20 %	40 %	412337478
131	NC_019382	AGGGC	2	10	141735	141744	20 %	0 %	60 %	20 %	412337479
132	NC_019382	CGCGG	2	10	142067	142076	0 %	0 %	60 %	40 %	412337480
133	NC_019382	CGCGC	2	10	143807	143816	0 %	0 %	40 %	60 %	412337481
134	NC_019382	ACGCC	2	10	144968	144977	20 %	0 %	20 %	60 %	412337483
135	NC_019382	CGGCG	2	10	145128	145137	0 %	0 %	60 %	40 %	412337483
136	NC_019382	AAGGC	2	10	145271	145280	40 %	0 %	40 %	20 %	412337483
137	NC_019382	CCGGG	2	10	146585	146594	0 %	0 %	60 %	40 %	412337485
138	NC_019382	CTGGC	2	10	146889	146898	0 %	20 %	40 %	40 %	412337485
139	NC_019382	GTGCG	2	10	147447	147456	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
140	NC_019382	GCGCC	2	10	147520	147529	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
141	NC_019382	GGCAG	2	10	148287	148296	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
142	NC_019382	CGCGC	2	10	150095	150104	0 %	0 %	40 %	60 %	412337486
143	NC_019382	CTTGG	2	10	154318	154327	0 %	40 %	40 %	20 %	412337489
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150	NC_019382	GACCA	2	10	158246	158255	40 %	0 %	20 %	40 %	412337492
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175	NC_019382	CTGGA	2	10	184524	184533	20 %	20 %	40 %	20 %	412337514
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216	NC_019382	CGCGG	2	10	225012	225021	0 %	0 %	60 %	40 %	412337550
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251	NC_019382	CGGCG	2	10	250455	250464	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
252	NC_019382	TGCGC	2	10	251249	251258	0 %	20 %	40 %	40 %	412337579
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