MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bordetella bronchiseptica 253

Total Repeats: 1955

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019382	GATT	2	8	165	172	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019382	AGCA	2	8	239	246	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_019382	CAAG	2	8	472	479	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_019382	CAGA	2	8	527	534	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_019382	GCCG	2	8	1594	1601	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_019382	CTGG	2	8	3064	3071	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_019382	CGCA	2	8	3350	3357	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_019382	TCGA	2	8	5130	5137	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_019382	GGCG	2	8	8855	8862	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10	NC_019382	CGTC	2	8	8868	8875	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_019382	GCTC	2	8	9054	9061	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_019382	AGGC	2	8	18225	18232	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_019382	TGGG	2	8	22883	22890	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019382	AGCA	2	8	22982	22989	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_019382	ATTT	2	8	24205	24212	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019382	GGCG	2	8	24285	24292	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17	NC_019382	ATCG	2	8	24642	24649	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_019382	ATCT	2	8	27086	27093	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_019382	GATG	2	8	27340	27347	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019382	CGGC	2	8	28342	28349	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_019382	GATG	2	8	29062	29069	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019382	CATG	2	8	29671	29678	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_019382	GTTG	2	8	29956	29963	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019382	TGGT	2	8	29964	29971	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019382	GCAC	2	8	30872	30879	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_019382	TTGC	2	8	31134	31141	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_019382	CTGG	2	8	31733	31740	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_019382	GGCT	2	8	31777	31784	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_019382	AGGA	2	8	33758	33765	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019382	CTTA	2	8	34813	34820	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_019382	ACCG	2	8	36402	36409	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_019382	GGTC	2	8	45133	45140	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_019382	GGTC	2	8	45383	45390	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_019382	CATC	2	8	56449	56456	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_019382	CCGT	2	8	56467	56474	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_019382	GCCG	2	8	56533	56540	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_019382	GCCG	2	8	56549	56556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_019382	TGTT	2	8	59435	59442	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019382	TTGA	2	8	59492	59499	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019382	CGGG	2	8	61643	61650	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
41	NC_019382	GCCG	2	8	82397	82404	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_019382	GGGT	2	8	83628	83635	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019382	AATT	2	8	85869	85876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019382	CCGA	2	8	86566	86573	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_019382	CAGG	3	12	101022	101033	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_019382	CTTG	2	8	104395	104402	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_019382	GCGT	2	8	104688	104695	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_019382	TGAT	2	8	105491	105498	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019382	GGCG	2	8	105540	105547	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
50	NC_019382	CGGC	2	8	105554	105561	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_019382	GCCG	2	8	107226	107233	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_019382	GCCT	2	8	111171	111178	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_019382	CCGG	2	8	114762	114769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_019382	GGCG	2	8	121090	121097	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
55	NC_019382	TGGA	2	8	123177	123184	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019382	ATTG	2	8	127458	127465	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019382	GGGT	2	8	127485	127492	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019382	GGGT	2	8	127524	127531	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019382	CGGC	2	8	141823	141830	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_019382	GCCG	2	8	142897	142904	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_019382	GTCC	2	8	144737	144744	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_019382	CATC	2	8	147224	147231	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_019382	ACGG	2	8	147846	147853	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_019382	CCGT	2	8	147938	147945	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_019382	GGCG	2	8	148245	148252	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
66	NC_019382	CAGG	2	8	148399	148406	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_019382	GCAC	2	8	148543	148550	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_019382	CAGC	2	8	148626	148633	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_019382	CTGG	2	8	149547	149554	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_019382	GGGC	2	8	150295	150302	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
71	NC_019382	GCCG	2	8	156407	156414	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_019382	GCGG	2	8	157721	157728	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
73	NC_019382	TGCG	2	8	157799	157806	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_019382	CGTG	2	8	161316	161323	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_019382	CTGC	2	8	170004	170011	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_019382	GGGC	2	8	173460	173467	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
77	NC_019382	ATCA	2	8	174852	174859	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_019382	GGCG	2	8	184869	184876	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
79	NC_019382	CGGC	2	8	185973	185980	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_019382	CGGC	2	8	190872	190879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_019382	GCCG	2	8	195372	195379	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_019382	CGGG	2	8	197864	197871	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
83	NC_019382	GGAC	2	8	199069	199076	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_019382	GCCG	2	8	200043	200050	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_019382	GCCG	2	8	200066	200073	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_019382	CGGG	2	8	200349	200356	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
87	NC_019382	GGCA	2	8	204892	204899	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_019382	TGGC	2	8	208363	208370	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_019382	GAAG	2	8	210092	210099	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019382	GCAA	2	8	222685	222692	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_019382	TGGG	2	8	225091	225098	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019382	GGGC	2	8	225392	225399	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
93	NC_019382	GCTG	2	8	225838	225845	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_019382	CGGC	2	8	233605	233612	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_019382	CGGG	2	8	236187	236194	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
96	NC_019382	CTGC	2	8	236815	236822	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_019382	GGGC	2	8	243600	243607	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
98	NC_019382	TTCC	2	8	249861	249868	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_019382	CACG	2	8	254505	254512	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_019382	GCAA	2	8	254564	254571	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_019382	CAAC	2	8	256033	256040	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_019382	GGCG	2	8	256056	256063	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
103	NC_019382	GGCC	2	8	256102	256109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_019382	GGCG	2	8	259095	259102	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
105	NC_019382	GGGC	2	8	261234	261241	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
106	NC_019382	GCCG	2	8	261268	261275	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_019382	CGTG	2	8	267279	267286	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_019382	GCCA	2	8	269171	269178	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_019382	TGAT	2	8	269196	269203	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019382	GGCA	2	8	278170	278177	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_019382	ATCA	2	8	280788	280795	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_019382	AGCG	2	8	280822	280829	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_019382	GGCA	2	8	286217	286224	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_019382	GCAT	2	8	289157	289164	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_019382	CGCC	2	8	290039	290046	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
116	NC_019382	GCAC	2	8	293882	293889	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_019382	AATT	2	8	297260	297267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019382	AAAG	2	8	297544	297551	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019382	GGCC	2	8	299637	299644	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_019382	CGGG	2	8	299677	299684	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
121	NC_019382	GGCC	2	8	302713	302720	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_019382	CGGA	2	8	305377	305384	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_019382	AGGG	2	8	309015	309022	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019382	TGGC	2	8	309164	309171	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_019382	GGCC	2	8	309239	309246	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_019382	CGGC	2	8	315555	315562	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_019382	GGAA	2	8	320124	320131	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019382	GCGG	2	8	321991	321998	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
129	NC_019382	GGCC	3	12	325973	325984	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_019382	TTTC	2	8	329574	329581	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_019382	GCCG	2	8	344826	344833	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_019382	GCCG	2	8	344894	344901	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_019382	GCCG	2	8	345039	345046	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_019382	GCCG	3	12	345092	345103	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_019382	GGCC	2	8	345369	345376	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_019382	GCCG	2	8	345483	345490	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_019382	GCCC	2	8	345603	345610	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
138	NC_019382	GGCT	2	8	345630	345637	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_019382	CCGC	2	8	345772	345779	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
140	NC_019382	AGGC	2	8	346393	346400	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_019382	GCCG	2	8	348256	348263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_019382	ACAG	2	8	354232	354239	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_019382	CTGT	2	8	354257	354264	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_019382	GACG	2	8	357588	357595	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_019382	CGTA	2	8	367498	367505	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_019382	CGGG	2	8	367518	367525	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
147	NC_019382	GCCC	2	8	367530	367537	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
148	NC_019382	GGGC	2	8	369101	369108	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
149	NC_019382	GCAG	2	8	369114	369121	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_019382	TCTG	2	8	369890	369897	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_019382	TTTA	2	8	370067	370074	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_019382	CCAT	2	8	370181	370188	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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155	NC_019382	GGCC	2	8	386841	386848	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
156	NC_019382	GCCG	2	8	390270	390277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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274	NC_019382	GCCG	2	8	780671	780678	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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282	NC_019382	TTGT	2	8	787216	787223	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
283	NC_019382	AATT	2	8	791552	791559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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297	NC_019382	GCTC	2	8	849836	849843	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
298	NC_019382	GTCA	2	8	850005	850012	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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481	NC_019382	CTTC	2	8	1353812	1353819	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
482	NC_019382	GCCG	2	8	1353846	1353853	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
483	NC_019382	GTGC	2	8	1356603	1356610	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
484	NC_019382	TGCG	2	8	1356792	1356799	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
485	NC_019382	CAAG	2	8	1365945	1365952	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
486	NC_019382	CGGA	2	8	1371202	1371209	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
487	NC_019382	GCCG	2	8	1371225	1371232	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
488	NC_019382	GCTT	2	8	1376268	1376275	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
489	NC_019382	CGGC	2	8	1378653	1378660	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
490	NC_019382	TCCA	2	8	1378706	1378713	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
491	NC_019382	CGCC	2	8	1378832	1378839	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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495	NC_019382	GACC	2	8	1398550	1398557	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
496	NC_019382	CGGT	2	8	1399542	1399549	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
497	NC_019382	TAAG	2	8	1401131	1401138	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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499	NC_019382	AGCC	2	8	1404209	1404216	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
500	NC_019382	GCAA	2	8	1404810	1404817	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding

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