MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Bordetella bronchiseptica 253

Total Repeats: 100627

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019382	GCA	2	6	135	140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019382	GCC	2	6	146	151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_019382	CAT	2	6	222	227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019382	TCG	2	6	298	303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019382	CAC	2	6	334	339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_019382	GCG	2	6	437	442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_019382	GCG	2	6	451	456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_019382	CTG	3	9	461	469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_019382	CGC	2	6	759	764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337339
10	NC_019382	GAT	2	6	789	794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412337339
11	NC_019382	ATC	2	6	863	868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337339
12	NC_019382	CGG	2	6	1043	1048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337339
13	NC_019382	CGC	2	6	1102	1107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337339
14	NC_019382	GCC	2	6	1246	1251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337339
15	NC_019382	CGC	2	6	1272	1277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337339
16	NC_019382	CCG	2	6	1299	1304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_019382	GCA	2	6	1349	1354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_019382	GAC	2	6	1523	1528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_019382	GCC	2	6	1535	1540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_019382	GCG	2	6	1633	1638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_019382	ATC	2	6	1658	1663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019382	GCC	2	6	1736	1741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_019382	CTT	2	6	1743	1748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_019382	ATT	2	6	1788	1793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	412337340
25	NC_019382	CCA	2	6	1876	1881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412337340
26	NC_019382	TGC	2	6	1883	1888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337340
27	NC_019382	GCC	2	6	1945	1950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337340
28	NC_019382	CGG	2	6	1994	1999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337340
29	NC_019382	GCC	2	6	2008	2013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337340
30	NC_019382	GCC	2	6	2058	2063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337340
31	NC_019382	CAG	2	6	2070	2075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337340
32	NC_019382	AGC	2	6	2228	2233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337341
33	NC_019382	CTG	2	6	2257	2262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337341
34	NC_019382	CAG	2	6	2353	2358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337341
35	NC_019382	TGT	2	6	2409	2414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	412337341
36	NC_019382	CGG	2	6	2553	2558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337341
37	NC_019382	GCG	2	6	2582	2587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337341
38	NC_019382	AGC	2	6	2660	2665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337341
39	NC_019382	AAG	2	6	2683	2688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	412337341
40	NC_019382	CCG	2	6	2744	2749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337341
41	NC_019382	GCA	2	6	2757	2762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337341
42	NC_019382	GGC	2	6	2766	2771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337341
43	NC_019382	GCT	2	6	2890	2895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337342
44	NC_019382	CCA	2	6	2984	2989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412337342
45	NC_019382	GAG	2	6	3096	3101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019382	CGG	2	6	3150	3155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337343
47	NC_019382	CGG	2	6	3176	3181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337343
48	NC_019382	TCG	2	6	3200	3205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337343
49	NC_019382	CAG	2	6	3274	3279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337343
50	NC_019382	GCC	2	6	3320	3325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_019382	GAC	2	6	3502	3507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337344
52	NC_019382	TGG	2	6	3587	3592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337344
53	NC_019382	CGC	2	6	3775	3780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337345
54	NC_019382	GGT	2	6	3908	3913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337345
55	NC_019382	GGC	2	6	3944	3949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337345
56	NC_019382	TGA	2	6	4101	4106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412337345
57	NC_019382	GCT	2	6	4149	4154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337346
58	NC_019382	AAG	2	6	4172	4177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	412337346
59	NC_019382	CTG	2	6	4244	4249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337346
60	NC_019382	CAT	2	6	4403	4408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337346
61	NC_019382	CGG	2	6	4454	4459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337346
62	NC_019382	GCC	2	6	4460	4465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337346
63	NC_019382	GAA	2	6	4641	4646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	412337347
64	NC_019382	TGC	2	6	4696	4701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337347
65	NC_019382	GTC	2	6	4976	4981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_019382	GTC	2	6	5042	5047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_019382	GGT	2	6	5146	5151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019382	CGC	2	6	5398	5403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337348
69	NC_019382	GGT	3	9	5428	5436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337348
70	NC_019382	CAA	2	6	5492	5497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	412337348
71	NC_019382	GCA	2	6	5503	5508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337348
72	NC_019382	GTA	2	6	5520	5525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412337348
73	NC_019382	ACC	2	6	5552	5557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412337348
74	NC_019382	GGT	2	6	5569	5574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337348
75	NC_019382	GCA	2	6	5602	5607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337348
76	NC_019382	AAC	2	6	5618	5623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	412337348
77	NC_019382	AAC	2	6	5628	5633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	412337348
78	NC_019382	AAC	2	6	5640	5645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	412337348
79	NC_019382	AAC	2	6	5650	5655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	412337348
80	NC_019382	CAG	2	6	5801	5806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337348
81	NC_019382	GAC	2	6	5849	5854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337348
82	NC_019382	CGC	2	6	5951	5956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337348
83	NC_019382	GGC	2	6	5987	5992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337348
84	NC_019382	GCT	2	6	6060	6065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337349
85	NC_019382	GCC	2	6	6096	6101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337349
86	NC_019382	CCG	2	6	6205	6210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337349
87	NC_019382	GCT	2	6	6231	6236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337349
88	NC_019382	GGT	2	6	6318	6323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337349
89	NC_019382	CGA	2	6	6381	6386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337349
90	NC_019382	TGG	2	6	6428	6433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337349
91	NC_019382	CCG	2	6	6495	6500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337349
92	NC_019382	CCG	3	9	6515	6523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337349
93	NC_019382	CGC	2	6	6555	6560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337349
94	NC_019382	GCT	2	6	6561	6566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337349
95	NC_019382	GCC	3	9	6567	6575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337349
96	NC_019382	GGT	2	6	6586	6591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337349
97	NC_019382	CGC	2	6	6609	6614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337349
98	NC_019382	CGC	3	9	6673	6681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337349
99	NC_019382	CGG	2	6	6740	6745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337349
100	NC_019382	AGC	2	6	6783	6788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337349
101	NC_019382	GCC	2	6	6804	6809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337350
102	NC_019382	GGC	2	6	6813	6818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337350
103	NC_019382	GCT	2	6	6856	6861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337350
104	NC_019382	GGC	2	6	6894	6899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337350
105	NC_019382	GCC	2	6	6913	6918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337350
106	NC_019382	CGA	2	6	6947	6952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337350
107	NC_019382	CTG	2	6	7080	7085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337350
108	NC_019382	GCG	2	6	7105	7110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337350
109	NC_019382	ACC	2	6	7120	7125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412337350
110	NC_019382	CGA	2	6	7154	7159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337350
111	NC_019382	GCC	2	6	7162	7167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337350
112	NC_019382	CAC	2	6	7211	7216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412337350
113	NC_019382	GTG	2	6	7464	7469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337351
114	NC_019382	CGC	2	6	7582	7587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337351
115	NC_019382	CAC	2	6	7600	7605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412337351
116	NC_019382	CGC	2	6	7746	7751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337351
117	NC_019382	GGC	2	6	7895	7900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337351
118	NC_019382	TGG	2	6	7920	7925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337351
119	NC_019382	AAG	2	6	7973	7978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	412337351
120	NC_019382	AAG	2	6	8003	8008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	412337351
121	NC_019382	GAC	2	6	8009	8014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337351
122	NC_019382	GAC	2	6	8054	8059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337351
123	NC_019382	AAC	2	6	8060	8065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	412337351
124	NC_019382	CCG	2	6	8126	8131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337351
125	NC_019382	GCC	2	6	8243	8248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337352
126	NC_019382	GCC	3	9	8253	8261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337352
127	NC_019382	GAG	2	6	8377	8382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	412337352
128	NC_019382	GAC	2	6	8396	8401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337352
129	NC_019382	TGC	2	6	8410	8415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337353
130	NC_019382	CGA	2	6	8579	8584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337353
131	NC_019382	TGC	2	6	8635	8640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337353
132	NC_019382	ACG	3	9	8731	8739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337353
133	NC_019382	TTG	2	6	8773	8778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	412337353
134	NC_019382	GTT	2	6	8790	8795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	412337353
135	NC_019382	TCG	2	6	9015	9020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_019382	GCG	2	6	9122	9127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_019382	GAA	2	6	9164	9169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	412337354
138	NC_019382	CGC	2	6	9267	9272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337354
139	NC_019382	GGC	2	6	9299	9304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337354
140	NC_019382	GTC	2	6	9341	9346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337354
141	NC_019382	TCT	2	6	9391	9396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	412337354
142	NC_019382	GAA	2	6	9401	9406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	412337354
143	NC_019382	CGC	3	9	9460	9468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337354
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145	NC_019382	TCT	2	6	9695	9700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	412337355
146	NC_019382	CGA	2	6	9704	9709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337355
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149	NC_019382	CGA	2	6	9870	9875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337355
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152	NC_019382	CCG	2	6	10138	10143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337355
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155	NC_019382	GAG	2	6	10243	10248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	412337355
156	NC_019382	GCG	2	6	10442	10447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337355
157	NC_019382	CAG	2	6	10455	10460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337355
158	NC_019382	TGC	2	6	10571	10576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337355
159	NC_019382	ACG	2	6	10580	10585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337355
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161	NC_019382	ACC	2	6	10697	10702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412337355
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163	NC_019382	AGG	2	6	10927	10932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	412337356
164	NC_019382	ACG	2	6	10936	10941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337356
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167	NC_019382	GTG	2	6	11109	11114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337356
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169	NC_019382	TGG	2	6	11149	11154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337356
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189	NC_019382	GCG	2	6	12422	12427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337357
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203	NC_019382	CGG	2	6	13607	13612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
204	NC_019382	ACA	2	6	13654	13659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
205	NC_019382	GAG	2	6	13842	13847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	412337359
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242	NC_019382	GCC	2	6	16009	16014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337362
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244	NC_019382	TCG	2	6	16045	16050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337362
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253	NC_019382	ACT	2	6	16439	16444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337364
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257	NC_019382	TGC	2	6	16634	16639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337364
258	NC_019382	CGC	2	6	16694	16699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337365
259	NC_019382	TGC	2	6	16744	16749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337365
260	NC_019382	CGG	2	6	16816	16821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337365
261	NC_019382	CGG	2	6	16913	16918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337365
262	NC_019382	CAG	2	6	17022	17027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337365
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265	NC_019382	GCC	2	6	17081	17086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337366
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267	NC_019382	CGC	2	6	17227	17232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337366
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270	NC_019382	CAG	2	6	17398	17403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337366
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279	NC_019382	ATC	2	6	18101	18106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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281	NC_019382	CCG	2	6	18218	18223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
282	NC_019382	TGT	2	6	18277	18282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	412337368
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294	NC_019382	CGG	2	6	19109	19114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
295	NC_019382	GGT	2	6	19227	19232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337370
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302	NC_019382	CCG	2	6	19632	19637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337371
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362	NC_019382	ATC	2	6	24792	24797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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366	NC_019382	GTC	2	6	25071	25076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337375
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374	NC_019382	TCG	2	6	25891	25896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
375	NC_019382	CAC	2	6	25994	25999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412337376
376	NC_019382	ATC	2	6	26115	26120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337376
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380	NC_019382	ACC	2	6	26250	26255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412337376
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