MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Bordetella bronchiseptica 253

Total Repeats: 7538

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019382	GCA	2	6	135	140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019382	GCC	2	6	146	151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_019382	CAT	2	6	222	227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019382	TCG	2	6	298	303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019382	CAC	2	6	334	339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_019382	GCG	2	6	437	442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_019382	GCG	2	6	451	456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_019382	CTG	3	9	461	469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_019382	CCG	2	6	1299	1304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_019382	GCA	2	6	1349	1354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_019382	GAC	2	6	1523	1528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_019382	GCC	2	6	1535	1540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_019382	GCG	2	6	1633	1638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_019382	ATC	2	6	1658	1663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_019382	GCC	2	6	1736	1741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_019382	CTT	2	6	1743	1748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_019382	GAG	2	6	3096	3101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019382	GCC	2	6	3320	3325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_019382	GTC	2	6	4976	4981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_019382	GTC	2	6	5042	5047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_019382	GGT	2	6	5146	5151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019382	TCG	2	6	9015	9020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_019382	GCG	2	6	9122	9127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_019382	CGG	2	6	13607	13612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_019382	ACA	2	6	13654	13659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_019382	CCG	2	6	15527	15532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_019382	ATC	2	6	18101	18106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_019382	CGA	2	6	18210	18215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_019382	CCG	2	6	18218	18223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_019382	CGG	2	6	19109	19114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_019382	CAG	2	6	22842	22847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_019382	CTG	2	6	22911	22916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_019382	ATC	2	6	24435	24440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_019382	GGA	2	6	24505	24510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019382	CAA	2	6	24536	24541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_019382	GCC	2	6	24545	24550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_019382	GGC	2	6	24555	24560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_019382	AAG	2	6	24586	24591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019382	CGT	2	6	24770	24775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_019382	ATC	2	6	24792	24797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_019382	AAC	2	6	24817	24822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_019382	CGT	2	6	24851	24856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_019382	GCT	2	6	25041	25046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_019382	TCG	2	6	25891	25896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_019382	CTA	2	6	27054	27059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_019382	GCC	2	6	27064	27069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_019382	GCT	2	6	27400	27405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_019382	AAG	2	6	27435	27440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019382	TCG	2	6	27442	27447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_019382	CGT	2	6	27461	27466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_019382	GCG	2	6	27577	27582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_019382	TGA	2	6	27755	27760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019382	TTC	2	6	27807	27812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_019382	GGC	2	6	27905	27910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_019382	GCG	2	6	27919	27924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_019382	AGC	2	6	27932	27937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_019382	AGG	2	6	27938	27943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019382	ATG	3	9	27974	27982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019382	TGT	2	6	28438	28443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019382	CTT	2	6	28516	28521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_019382	CAG	2	6	28562	28567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_019382	GGC	2	6	28610	28615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_019382	CGG	2	6	28659	28664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_019382	CTT	2	6	28672	28677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_019382	GCT	2	6	29122	29127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_019382	AAG	2	6	29157	29162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019382	TCG	2	6	29164	29169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_019382	CGT	2	6	29183	29188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_019382	GCG	2	6	29299	29304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_019382	TGA	2	6	29477	29482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019382	TTC	2	6	29529	29534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_019382	AGC	2	6	29572	29577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_019382	GGC	2	6	29627	29632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_019382	GCG	2	6	29641	29646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_019382	AGC	2	6	29654	29659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_019382	AGG	2	6	29660	29665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019382	TGT	2	6	29731	29736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019382	GCT	2	6	29765	29770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_019382	TGT	2	6	29900	29905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019382	GAA	2	6	29910	29915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019382	CGT	2	6	29925	29930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_019382	CCT	2	6	29941	29946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_019382	CAT	2	6	30040	30045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_019382	GTG	2	6	30840	30845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019382	GGC	2	6	30925	30930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_019382	CCA	2	6	31007	31012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_019382	TGG	2	6	31069	31074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019382	CAT	2	6	31083	31088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_019382	CAG	2	6	31143	31148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_019382	CAC	2	6	31235	31240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_019382	GAT	2	6	31380	31385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019382	AGA	2	6	31496	31501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019382	TAC	2	6	31523	31528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_019382	AGC	2	6	31567	31572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_019382	CGC	2	6	31673	31678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_019382	ACT	2	6	31690	31695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_019382	CCG	2	6	31799	31804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_019382	TCA	2	6	33751	33756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_019382	ATG	2	6	33965	33970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019382	ATC	2	6	33992	33997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_019382	CAG	2	6	34825	34830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_019382	TCG	2	6	36904	36909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_019382	TCT	2	6	42121	42126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_019382	CGA	2	6	42250	42255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_019382	TCT	2	6	44978	44983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_019382	TTA	2	6	45016	45021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019382	CTA	2	6	45113	45118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_019382	GCA	2	6	45172	45177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_019382	TGA	2	6	45348	45353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019382	CGT	2	6	45429	45434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_019382	GCA	2	6	45451	45456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_019382	GTG	2	6	45514	45519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019382	TCA	2	6	50532	50537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_019382	GGC	2	6	50572	50577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_019382	GTG	2	6	52176	52181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019382	GTT	2	6	53321	53326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019382	GTG	2	6	53354	53359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019382	TGG	2	6	53372	53377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019382	GCG	2	6	55365	55370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_019382	GCA	2	6	55376	55381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_019382	TAC	2	6	55392	55397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_019382	CCG	2	6	55407	55412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_019382	GCT	2	6	55518	55523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_019382	GGC	2	6	55544	55549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_019382	GCC	2	6	55556	55561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_019382	GGC	2	6	56253	56258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_019382	CGT	2	6	56313	56318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_019382	TAT	2	6	56366	56371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019382	GCC	2	6	56485	56490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_019382	GGC	2	6	56506	56511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_019382	TCC	2	6	56897	56902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_019382	CGG	2	6	56931	56936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_019382	CGT	2	6	56948	56953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_019382	GTT	2	6	56959	56964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019382	ATT	2	6	57030	57035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019382	GAC	3	9	57104	57112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_019382	GGC	2	6	57193	57198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_019382	GGC	2	6	57260	57265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_019382	GCC	2	6	58542	58547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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