MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus agalactiae SA20-06 chromosome

Total Repeats: 104

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019048	ATGAAG	2	12	15938	15949	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019048	TAAGGA	2	12	17902	17913	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019048	ACTAAT	2	12	21054	21065	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_019048	TAAGGA	2	12	23727	23738	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019048	ACTAAT	2	12	26879	26890	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_019048	AAAATA	2	12	49513	49524	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019048	TTTTTG	2	12	51024	51035	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019048	TAAGGA	2	12	92757	92768	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019048	ACTAAT	2	12	95911	95922	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_019048	TTAAAA	2	12	143209	143220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019048	TTAAAT	2	12	154610	154621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019048	TAAGGA	2	12	166615	166626	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019048	ACTAAT	2	12	169766	169777	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_019048	CTTGTT	2	12	179018	179029	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_019048	TCCTTT	2	12	193009	193020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_019048	AAGGTA	2	12	209150	209161	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019048	AAATAA	2	12	226790	226801	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019048	TAAGGA	2	12	240618	240629	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019048	ACTAAT	2	12	243770	243781	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_019048	AGCAGA	2	12	247178	247189	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_019048	CAAATT	2	12	318476	318487	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_019048	TAAGGA	2	12	328149	328160	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019048	ACTAAT	2	12	331301	331312	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_019048	ATAGTT	2	12	344710	344721	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019048	TAACAC	2	12	358054	358065	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_019048	AAGTTT	2	12	378451	378462	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019048	TAAGGA	2	12	395180	395191	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019048	ACTAAT	2	12	398332	398343	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_019048	AAATAA	2	12	403435	403446	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019048	GCCATC	2	12	403680	403691	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
31	NC_019048	TATTAC	2	12	413880	413891	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_019048	TGCTTT	2	12	413997	414008	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_019048	AGAAAC	2	12	448550	448561	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_019048	AAAATA	2	12	453509	453520	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019048	AGAAAA	2	12	454386	454397	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019048	CTTTGA	2	12	459886	459897	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_019048	GAAAAT	2	12	468291	468302	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019048	CAAGAA	2	12	469137	469148	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_019048	TTTATA	2	12	478382	478393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019048	TCGGTA	2	12	478922	478933	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_019048	ATTTTC	2	12	495534	495545	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_019048	ATTCAA	2	12	571403	571414	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_019048	CAAGCT	2	12	572981	572992	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_019048	TTTATT	2	12	578111	578122	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019048	ATCTTA	2	12	596190	596201	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_019048	AGATAA	2	12	603978	603989	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019048	TGAGAT	2	12	654460	654471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019048	TTATCT	2	12	659358	659369	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_019048	TAGAAC	2	12	689330	689341	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_019048	AGGACT	2	12	689569	689580	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_019048	TTTTTA	2	12	727877	727888	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019048	TTTAGT	2	12	728647	728658	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019048	AAAACA	2	12	733828	733839	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_019048	AAAGAT	2	12	803490	803501	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019048	AATGCA	2	12	813370	813381	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_019048	GGGGAT	2	12	813753	813764	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019048	AATTGA	2	12	815364	815375	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019048	ACAATA	2	12	842638	842649	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_019048	TTAAAA	2	12	844125	844136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019048	TCATTT	2	12	920098	920109	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_019048	ATTGCA	2	12	930928	930939	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_019048	AATTAA	2	12	953709	953720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019048	ATTTTA	2	12	980260	980271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019048	AAAAAC	2	12	987122	987133	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_019048	CCCGAA	2	12	1012467	1012478	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
66	NC_019048	AATCAT	2	12	1078731	1078742	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_019048	TAGCTT	2	12	1078754	1078765	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_019048	TGGTTA	2	12	1080129	1080140	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019048	AGCCTC	2	12	1098254	1098265	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
70	NC_019048	CGATGG	2	12	1098330	1098341	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_019048	TTTGCT	2	12	1152384	1152395	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_019048	AAAATA	2	12	1153198	1153209	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019048	TTGCAA	2	12	1184121	1184132	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_019048	AATATA	2	12	1219994	1220005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019048	TATTGT	2	12	1229781	1229792	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019048	TATCCA	2	12	1244746	1244757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_019048	ACTCCA	2	12	1277592	1277603	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_019048	TTTTCT	2	12	1281755	1281766	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_019048	ACAATA	2	12	1324365	1324376	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_019048	AAAAAT	2	12	1325537	1325548	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019048	ATTTCA	2	12	1376753	1376764	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_019048	TTCTGA	2	12	1423776	1423787	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_019048	TTTTAT	2	12	1438479	1438490	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019048	ATTTTT	2	12	1461104	1461115	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019048	CTTTAT	2	12	1461881	1461892	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_019048	TTTCAT	2	12	1482551	1482562	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_019048	ACTGAT	2	12	1483511	1483522	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_019048	AAAAGT	2	12	1520618	1520629	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019048	TTCAAT	2	12	1567752	1567763	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_019048	AGAAAA	2	12	1606632	1606643	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019048	CCATAT	2	12	1633890	1633901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_019048	ATCTTT	2	12	1634834	1634845	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_019048	TACCAA	2	12	1645131	1645142	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_019048	CAAAAG	2	12	1647150	1647161	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_019048	GTTTTC	2	12	1686107	1686118	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_019048	TATTCT	2	12	1697114	1697125	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_019048	AGGAAA	2	12	1705635	1705646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019048	AAATAC	2	12	1707175	1707186	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_019048	ATAGTT	2	12	1746350	1746361	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019048	TTCAAG	2	12	1746512	1746523	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_019048	TAAAAA	2	12	1764544	1764555	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019048	CTTATA	2	12	1768086	1768097	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_019048	TAAATT	2	12	1804727	1804738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019048	CTATAA	2	12	1818642	1818653	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.