MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptococcus agalactiae SA20-06 chromosome

Total Repeats: 1468

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019048	TGAAA	2	10	247	256	60 %	20 %	20 %	0 %	410593713
2	NC_019048	AAAAG	2	10	712	721	80 %	0 %	20 %	0 %	410593713
3	NC_019048	AAAAT	2	10	1446	1455	80 %	20 %	0 %	0 %	410593713
4	NC_019048	AAACT	2	10	2029	2038	60 %	20 %	0 %	20 %	410593714
5	NC_019048	CGATT	2	10	2656	2665	20 %	40 %	20 %	20 %	410593714
6	NC_019048	ACAGA	2	10	2931	2940	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_019048	TAAAA	2	10	3261	3270	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019048	GACAG	2	10	3372	3381	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_019048	TGGTA	2	10	4560	4569	20 %	40 %	40 %	0 %	410593716
10	NC_019048	TTTAT	2	10	5809	5818	20 %	80 %	0 %	0 %	410593717
11	NC_019048	TGGGT	2	10	10354	10363	0 %	40 %	60 %	0 %	410593721
12	NC_019048	ACTAT	2	10	12879	12888	40 %	40 %	0 %	20 %	410593724
13	NC_019048	GGATA	2	10	13108	13117	40 %	20 %	40 %	0 %	410593724
14	NC_019048	TCGTG	2	10	17428	17437	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_019048	GTTAA	2	10	18183	18192	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019048	GGGAG	2	10	18702	18711	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019048	AGGGA	2	10	20913	20922	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019048	TCGTG	2	10	23253	23262	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_019048	GTTAA	2	10	24008	24017	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019048	GGGAG	2	10	24527	24536	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019048	AGGGA	2	10	26738	26747	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019048	ATTTT	2	10	32676	32685	20 %	80 %	0 %	0 %	410593730
23	NC_019048	TCAAT	2	10	33104	33113	40 %	40 %	0 %	20 %	410593730
24	NC_019048	CTTTT	2	10	33725	33734	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_019048	ATTTT	2	10	33789	33798	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019048	TGGTG	2	10	35847	35856	0 %	40 %	60 %	0 %	410593733
27	NC_019048	AGTTC	2	10	38528	38537	20 %	40 %	20 %	20 %	410593734
28	NC_019048	AGCGA	2	10	40250	40259	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_019048	AGCAG	2	10	43166	43175	40 %	0 %	40 %	20 %	410593737
30	NC_019048	GGTCA	2	10	43530	43539	20 %	20 %	40 %	20 %	410593737
31	NC_019048	TTGGG	2	10	44531	44540	0 %	40 %	60 %	0 %	410593739
32	NC_019048	CTTTT	2	10	46065	46074	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_019048	AATGC	2	10	48478	48487	40 %	20 %	20 %	20 %	410593741
34	NC_019048	GAAAA	2	10	49742	49751	80 %	0 %	20 %	0 %	410593743
35	NC_019048	GTCAT	2	10	51372	51381	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_019048	AATCA	2	10	52823	52832	60 %	20 %	0 %	20 %	410593745
37	NC_019048	AGTCT	2	10	53667	53676	20 %	40 %	20 %	20 %	410593746
38	NC_019048	GATGG	2	10	55305	55314	20 %	20 %	60 %	0 %	410593748
39	NC_019048	TCCTC	2	10	57433	57442	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
40	NC_019048	TATGT	2	10	57572	57581	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019048	GCAGG	2	10	58875	58884	20 %	0 %	60 %	20 %	410593751
42	NC_019048	TGGTA	2	10	59467	59476	20 %	40 %	40 %	0 %	410593752
43	NC_019048	CTGCC	2	10	59840	59849	0 %	20 %	20 %	60 %	410593753
44	NC_019048	TCCAG	2	10	60323	60332	20 %	20 %	20 %	40 %	410593753
45	NC_019048	TAACT	2	10	60857	60866	40 %	40 %	0 %	20 %	410593754
46	NC_019048	ATTAA	2	10	61592	61601	60 %	40 %	0 %	0 %	410593754
47	NC_019048	TGATT	2	10	64497	64506	20 %	60 %	20 %	0 %	410593757
48	NC_019048	ATTTG	2	10	65057	65066	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019048	TGAAA	2	10	65819	65828	60 %	20 %	20 %	0 %	410593758
50	NC_019048	TGTTT	2	10	66391	66400	0 %	80 %	20 %	0 %	410593759
51	NC_019048	TTTAC	2	10	67250	67259	20 %	60 %	0 %	20 %	410593761
52	NC_019048	GTTTT	2	10	67996	68005	0 %	80 %	20 %	0 %	410593761
53	NC_019048	TTTTA	2	10	68243	68252	20 %	80 %	0 %	0 %	410593761
54	NC_019048	GGTAT	2	10	69998	70007	20 %	40 %	40 %	0 %	410593762
55	NC_019048	AAATA	2	10	76668	76677	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019048	GAAAA	2	10	79292	79301	80 %	0 %	20 %	0 %	410593771
57	NC_019048	TTTGG	2	10	79706	79715	0 %	60 %	40 %	0 %	410593772
58	NC_019048	TTCAC	2	10	80062	80071	20 %	40 %	0 %	40 %	410593773
59	NC_019048	GAAAT	2	10	81143	81152	60 %	20 %	20 %	0 %	410593775
60	NC_019048	AAGGA	2	10	82224	82233	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019048	ATTCA	2	10	83105	83114	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_019048	TTCCA	2	10	86505	86514	20 %	40 %	0 %	40 %	410593786
63	NC_019048	TCCAA	2	10	86664	86673	40 %	20 %	0 %	40 %	410593786
64	NC_019048	GAATA	2	10	87235	87244	60 %	20 %	20 %	0 %	410593786
65	NC_019048	CCGCG	2	10	87439	87448	0 %	0 %	40 %	60 %	410593787
66	NC_019048	TCGTG	2	10	92283	92292	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_019048	GTTAA	2	10	93040	93049	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019048	GGGAG	2	10	93559	93568	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019048	AGGGA	2	10	95770	95779	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019048	ATTTT	2	10	98712	98721	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019048	TTTAA	2	10	98804	98813	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019048	TAAAG	2	10	100709	100718	60 %	20 %	20 %	0 %	410593798
73	NC_019048	TATAA	2	10	101251	101260	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019048	ATTTG	2	10	101660	101669	20 %	60 %	20 %	0 %	410593799
75	NC_019048	GTTTG	2	10	102994	103003	0 %	60 %	40 %	0 %	410593801
76	NC_019048	ATCAA	2	10	105428	105437	60 %	20 %	0 %	20 %	410593804
77	NC_019048	TATGG	2	10	105686	105695	20 %	40 %	40 %	0 %	410593804
78	NC_019048	CATTA	2	10	109365	109374	40 %	40 %	0 %	20 %	410593806
79	NC_019048	TATTG	2	10	111456	111465	20 %	60 %	20 %	0 %	410593809
80	NC_019048	AATAG	2	10	113057	113066	60 %	20 %	20 %	0 %	410593811
81	NC_019048	TAAAC	2	10	113424	113433	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_019048	ATTTA	2	10	115766	115775	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019048	AAAAC	2	10	116348	116357	80 %	0 %	0 %	20 %	410593814
84	NC_019048	ATTTT	2	10	117420	117429	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019048	CTTTT	2	10	117464	117473	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_019048	AAAAT	2	10	119061	119070	80 %	20 %	0 %	0 %	410593816
87	NC_019048	CAAGT	2	10	120055	120064	40 %	20 %	20 %	20 %	410593817
88	NC_019048	ACTAT	2	10	121350	121359	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_019048	TGCCA	2	10	122468	122477	20 %	20 %	20 %	40 %	410593819
90	NC_019048	ACGTC	2	10	123087	123096	20 %	20 %	20 %	40 %	410593820
91	NC_019048	TGGAT	2	10	123911	123920	20 %	40 %	40 %	0 %	410593820
92	NC_019048	TATAA	2	10	124391	124400	60 %	40 %	0 %	0 %	410593820
93	NC_019048	GTGAT	2	10	125707	125716	20 %	40 %	40 %	0 %	410593822
94	NC_019048	TTTGG	2	10	128589	128598	0 %	60 %	40 %	0 %	410593825
95	NC_019048	GAAAA	2	10	130638	130647	80 %	0 %	20 %	0 %	410593827
96	NC_019048	AGTCA	2	10	131199	131208	40 %	20 %	20 %	20 %	410593827
97	NC_019048	GGGTA	2	10	132719	132728	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019048	CTAAG	2	10	132744	132753	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_019048	GAAAA	2	10	133967	133976	80 %	0 %	20 %	0 %	410593831
100	NC_019048	GATTT	2	10	134671	134680	20 %	60 %	20 %	0 %	410593831
101	NC_019048	AGTTA	2	10	134976	134985	40 %	40 %	20 %	0 %	410593831
102	NC_019048	TATGA	2	10	135277	135286	40 %	40 %	20 %	0 %	410593832
103	NC_019048	AAACC	2	10	138910	138919	60 %	0 %	0 %	40 %	410593834
104	NC_019048	ATAGA	2	10	139105	139114	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019048	ATAAA	2	10	141176	141185	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019048	GATTC	2	10	142007	142016	20 %	40 %	20 %	20 %	410593837
107	NC_019048	GTTAA	2	10	142757	142766	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019048	TATAT	2	10	143133	143142	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019048	ATTTT	2	10	143408	143417	20 %	80 %	0 %	0 %	410593839
110	NC_019048	TTGAT	2	10	145215	145224	20 %	60 %	20 %	0 %	410593840
111	NC_019048	TTTTG	2	10	145457	145466	0 %	80 %	20 %	0 %	410593840
112	NC_019048	AAGCA	2	10	145673	145682	60 %	0 %	20 %	20 %	410593840
113	NC_019048	ACTTT	2	10	148340	148349	20 %	60 %	0 %	20 %	410593842
114	NC_019048	GCTTT	2	10	150442	150451	0 %	60 %	20 %	20 %	410593844
115	NC_019048	AATAT	2	10	150716	150725	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019048	ATTAC	2	10	151432	151441	40 %	40 %	0 %	20 %	410593845
117	NC_019048	AAATT	2	10	152245	152254	60 %	40 %	0 %	0 %	410593846
118	NC_019048	ATCCT	2	10	152647	152656	20 %	40 %	0 %	40 %	410593846
119	NC_019048	AGTTT	2	10	153793	153802	20 %	60 %	20 %	0 %	410593847
120	NC_019048	ATACC	2	10	155820	155829	40 %	20 %	0 %	40 %	410593849
121	NC_019048	AGGTT	2	10	157814	157823	20 %	40 %	40 %	0 %	410593851
122	NC_019048	ATTTT	2	10	158156	158165	20 %	80 %	0 %	0 %	410593851
123	NC_019048	AATAG	2	10	158675	158684	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019048	AAGAC	2	10	159182	159191	60 %	0 %	20 %	20 %	410593852
125	NC_019048	AAAAC	2	10	160261	160270	80 %	0 %	0 %	20 %	410593852
126	NC_019048	AATTA	2	10	160599	160608	60 %	40 %	0 %	0 %	410593852
127	NC_019048	ATGAT	2	10	160714	160723	40 %	40 %	20 %	0 %	410593853
128	NC_019048	CAATC	2	10	164461	164470	40 %	20 %	0 %	40 %	410593856
129	NC_019048	TCGTG	2	10	166141	166150	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
130	NC_019048	GTTAA	2	10	166895	166904	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019048	GGGAG	2	10	167414	167423	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019048	AGGGA	2	10	169625	169634	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019048	TGTTA	2	10	170160	170169	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019048	ATTGT	2	10	170351	170360	20 %	60 %	20 %	0 %	410593857
135	NC_019048	ATTAG	2	10	170464	170473	40 %	40 %	20 %	0 %	410593857
136	NC_019048	TTTTA	2	10	172720	172729	20 %	80 %	0 %	0 %	410593860
137	NC_019048	ATCTA	2	10	173857	173866	40 %	40 %	0 %	20 %	410593861
138	NC_019048	TTATT	2	10	174533	174542	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019048	GATTG	2	10	178152	178161	20 %	40 %	40 %	0 %	410593863
140	NC_019048	GTCCT	2	10	186160	186169	0 %	40 %	20 %	40 %	410593865
141	NC_019048	ATTTT	2	10	187066	187075	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019048	AAGAT	2	10	189263	189272	60 %	20 %	20 %	0 %	410593869
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252	NC_019048	ATATA	2	10	334063	334072	60 %	40 %	0 %	0 %	410594012
253	NC_019048	GTGCA	2	10	334528	334537	20 %	20 %	40 %	20 %	410594012
254	NC_019048	GTTTT	2	10	335711	335720	0 %	80 %	20 %	0 %	410594014
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259	NC_019048	TAAAA	2	10	343372	343381	80 %	20 %	0 %	0 %	410594023
260	NC_019048	AATTT	2	10	344568	344577	40 %	60 %	0 %	0 %	410594024
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262	NC_019048	TTTCA	2	10	351815	351824	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
263	NC_019048	ATAGT	2	10	351964	351973	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
264	NC_019048	TTAGT	2	10	353154	353163	20 %	60 %	20 %	0 %	410594032
265	NC_019048	TTAAT	2	10	353564	353573	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
266	NC_019048	ATTTG	2	10	353693	353702	20 %	60 %	20 %	0 %	410594033
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269	NC_019048	ATAAA	2	10	357453	357462	80 %	20 %	0 %	0 %	410594037
270	NC_019048	CAAGA	2	10	359506	359515	60 %	0 %	20 %	20 %	410594040
271	NC_019048	AAGAA	2	10	359537	359546	80 %	0 %	20 %	0 %	410594040
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273	NC_019048	TTGAT	2	10	363025	363034	20 %	60 %	20 %	0 %	410594044
274	NC_019048	TTTTA	2	10	363546	363555	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_019048	ATGAT	2	10	364861	364870	40 %	40 %	20 %	0 %	410594046
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357	NC_019048	TATCA	2	10	462658	462667	40 %	40 %	0 %	20 %	410594134
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403	NC_019048	CCACT	2	10	519689	519698	20 %	20 %	0 %	60 %	410594190
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