MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus agalactiae SA20-06 chromosome

Total Repeats: 330

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019048	ACAGA	2	10	2931	2940	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_019048	TAAAA	2	10	3261	3270	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019048	GACAG	2	10	3372	3381	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_019048	TCGTG	2	10	17428	17437	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_019048	GTTAA	2	10	18183	18192	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019048	GGGAG	2	10	18702	18711	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019048	AGGGA	2	10	20913	20922	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019048	TCGTG	2	10	23253	23262	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_019048	GTTAA	2	10	24008	24017	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019048	GGGAG	2	10	24527	24536	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019048	AGGGA	2	10	26738	26747	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019048	CTTTT	2	10	33725	33734	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_019048	ATTTT	2	10	33789	33798	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019048	AGCGA	2	10	40250	40259	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_019048	CTTTT	2	10	46065	46074	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_019048	GTCAT	2	10	51372	51381	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_019048	TCCTC	2	10	57433	57442	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
18	NC_019048	TATGT	2	10	57572	57581	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019048	ATTTG	2	10	65057	65066	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019048	AAATA	2	10	76668	76677	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019048	AAGGA	2	10	82224	82233	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019048	ATTCA	2	10	83105	83114	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_019048	TCGTG	2	10	92283	92292	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_019048	GTTAA	2	10	93040	93049	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019048	GGGAG	2	10	93559	93568	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019048	AGGGA	2	10	95770	95779	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019048	ATTTT	2	10	98712	98721	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019048	TTTAA	2	10	98804	98813	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019048	TATAA	2	10	101251	101260	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019048	TAAAC	2	10	113424	113433	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_019048	ATTTA	2	10	115766	115775	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019048	ATTTT	2	10	117420	117429	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019048	CTTTT	2	10	117464	117473	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_019048	ACTAT	2	10	121350	121359	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_019048	GGGTA	2	10	132719	132728	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019048	CTAAG	2	10	132744	132753	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_019048	ATAGA	2	10	139105	139114	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019048	ATAAA	2	10	141176	141185	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019048	GTTAA	2	10	142757	142766	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019048	TATAT	2	10	143133	143142	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019048	AATAT	2	10	150716	150725	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019048	AATAG	2	10	158675	158684	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019048	TCGTG	2	10	166141	166150	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_019048	GTTAA	2	10	166895	166904	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019048	GGGAG	2	10	167414	167423	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019048	AGGGA	2	10	169625	169634	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019048	TGTTA	2	10	170160	170169	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019048	TTATT	2	10	174533	174542	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019048	ATTTT	2	10	187066	187075	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019048	AGAAC	2	10	195882	195891	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_019048	ATTTC	2	10	209577	209586	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_019048	ACTCA	2	10	210082	210091	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
53	NC_019048	TCTAA	2	10	227982	227991	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_019048	ATAAA	2	10	228400	228409	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019048	AAAGT	2	10	229504	229513	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019048	TTTAT	2	10	232521	232530	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019048	AGATG	2	10	232895	232904	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019048	TCGTG	2	10	240144	240153	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_019048	GTTAA	2	10	240899	240908	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019048	GGGAG	2	10	241418	241427	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019048	AGGGA	2	10	243629	243638	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019048	CTTTA	2	10	244141	244150	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_019048	GATGG	2	10	246289	246298	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019048	AAGTG	2	10	255654	255663	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019048	TAATA	2	10	257019	257028	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019048	ATAAA	2	10	273772	273781	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019048	ATCAT	2	10	299159	299168	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_019048	TTTGT	2	10	318120	318129	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019048	AATAC	2	10	318757	318766	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_019048	ATGAT	2	10	322176	322185	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019048	TCGTG	2	10	327675	327684	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_019048	GTTAA	2	10	328430	328439	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019048	GGGAG	2	10	328949	328958	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019048	AGGGA	2	10	331160	331169	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019048	TTTCA	2	10	351815	351824	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_019048	ATAGT	2	10	351964	351973	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019048	TTAAT	2	10	353564	353573	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019048	TTTTA	2	10	363546	363555	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019048	TAGAA	2	10	373607	373616	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019048	ATTTT	2	10	386659	386668	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019048	TCGTG	2	10	394706	394715	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_019048	GTTAA	2	10	395461	395470	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019048	GGGAG	2	10	395980	395989	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019048	AGGGA	2	10	398191	398200	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019048	CTTTA	2	10	398703	398712	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_019048	TTAAA	2	10	403425	403434	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019048	AGTTG	2	10	408359	408368	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019048	TCAAG	2	10	419355	419364	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_019048	TTACT	2	10	424221	424230	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_019048	ATAAA	2	10	433268	433277	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019048	ATTTA	2	10	443267	443276	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019048	GAAAA	2	10	453170	453179	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019048	ACAAA	2	10	454507	454516	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_019048	AAGTT	2	10	456999	457008	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019048	AGGTA	2	10	457785	457794	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019048	CATCT	2	10	458222	458231	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
97	NC_019048	TTAGT	2	10	459828	459837	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019048	ACTTG	2	10	465176	465185	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_019048	AGAAA	2	10	465869	465878	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019048	GATGC	2	10	465935	465944	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
101	NC_019048	GGTTT	2	10	468677	468686	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019048	GATAT	2	10	469501	469510	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019048	TTTTG	2	10	481942	481951	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019048	TAGAA	2	10	485846	485855	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019048	ATATT	2	10	491701	491710	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019048	ATATA	2	10	502128	502137	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019048	ATAGG	2	10	509434	509443	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019048	TAGAA	2	10	519421	519430	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019048	AAGCC	2	10	531358	531367	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
110	NC_019048	TTATC	2	10	532272	532281	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_019048	TGTTT	2	10	532320	532329	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019048	TAGTA	2	10	547354	547363	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019048	TTAGG	2	10	550658	550667	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019048	CTTTT	2	10	551706	551715	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_019048	TTGAT	2	10	560815	560824	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019048	TTGAC	2	10	567258	567267	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_019048	CTTGG	2	10	567406	567415	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
118	NC_019048	CGATA	2	10	567426	567435	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_019048	ATATT	2	10	570223	570232	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019048	TTCTA	2	10	573265	573274	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_019048	TTCTT	2	10	576800	576809	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_019048	GTGAT	2	10	577360	577369	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019048	ATAAA	2	10	582318	582327	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019048	TAAAT	2	10	592824	592833	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019048	ATTAA	2	10	592844	592853	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019048	ATATG	2	10	592895	592904	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019048	TAGCT	2	10	606180	606189	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_019048	TTGCT	2	10	610375	610384	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_019048	GGAGA	2	10	613470	613479	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019048	GGAAA	2	10	638239	638248	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019048	GTTCA	2	10	642077	642086	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_019048	ATACT	2	10	643455	643464	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_019048	TTTTA	2	10	644089	644098	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019048	TAATG	2	10	651552	651561	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019048	GAAAT	2	10	653248	653257	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019048	TACTT	2	10	659108	659117	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_019048	AGTTA	2	10	666663	666672	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019048	TTAGA	2	10	666700	666709	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019048	CTTCT	2	10	673262	673271	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
140	NC_019048	ATATC	2	10	694932	694941	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_019048	TGATA	2	10	700382	700391	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019048	TCTAT	2	10	716684	716693	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_019048	TAAAA	2	10	717269	717278	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019048	CTTAA	2	10	721183	721192	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_019048	TAAAA	2	10	721568	721577	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_019048	AATTT	2	10	727953	727962	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_019048	TAGTA	2	10	732054	732063	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019048	TAAAT	2	10	737093	737102	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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329	NC_019048	ATAAA	2	10	1812143	1812152	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
330	NC_019048	TAGGT	2	10	1817744	1817753	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.