MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus agalactiae SA20-06 chromosome

Total Repeats: 973

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019048	AAAG	2	8	2986	2993	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019048	CAGA	2	8	3151	3158	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_019048	TTTA	2	8	3181	3188	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019048	TTGA	2	8	3627	3634	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019048	TTGA	2	8	4408	4415	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019048	TAGA	2	8	9969	9976	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019048	GTTA	2	8	16027	16034	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019048	ACGA	2	8	16256	16263	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_019048	GTTA	2	8	16548	16555	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019048	GTGA	2	8	16761	16768	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019048	TAAC	2	8	16844	16851	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_019048	AGCG	2	8	16932	16939	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_019048	TGGT	2	8	17597	17604	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019048	AGCC	2	8	17814	17821	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_019048	GTAA	2	8	18269	18276	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019048	GAAG	2	8	18351	18358	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019048	GCGA	2	8	18425	18432	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_019048	ATTC	2	8	19291	19298	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_019048	CTAA	2	8	19647	19654	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_019048	TAGG	2	8	20302	20309	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019048	ACGA	2	8	22081	22088	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_019048	GTTA	2	8	22373	22380	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019048	GTGA	2	8	22586	22593	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019048	TAAC	2	8	22669	22676	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_019048	AGCG	2	8	22757	22764	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_019048	TGGT	2	8	23422	23429	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019048	AGCC	2	8	23639	23646	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_019048	GTAA	2	8	24094	24101	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019048	GAAG	2	8	24176	24183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019048	GCGA	2	8	24250	24257	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_019048	ATTC	2	8	25116	25123	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_019048	CTAA	2	8	25472	25479	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_019048	TAGG	2	8	26127	26134	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019048	TATT	2	8	27950	27957	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019048	GCGT	2	8	28119	28126	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_019048	ATTA	2	8	30185	30192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019048	AATT	2	8	33340	33347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019048	ATTT	2	8	33922	33929	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019048	TAAA	2	8	35582	35589	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019048	GGAA	2	8	36372	36379	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019048	TAGT	2	8	42978	42985	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019048	ACTA	2	8	47139	47146	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_019048	AATT	2	8	51609	51616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019048	AGAA	2	8	59026	59033	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019048	AGTT	2	8	64002	64009	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019048	TAAG	2	8	65097	65104	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019048	GAAA	2	8	74730	74737	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019048	TAAA	2	8	82794	82801	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019048	ATTA	2	8	83090	83097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019048	ATCG	2	8	90658	90665	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_019048	ACGA	2	8	91111	91118	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_019048	GTTA	2	8	91403	91410	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019048	GTGA	2	8	91616	91623	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019048	TAAC	2	8	91699	91706	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_019048	AGCG	2	8	91787	91794	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_019048	TGGT	2	8	92452	92459	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019048	AGCC	2	8	92669	92676	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_019048	GTAA	2	8	93126	93133	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019048	GAAG	2	8	93208	93215	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019048	GCGA	2	8	93282	93289	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_019048	ATTC	2	8	94148	94155	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_019048	CTAA	2	8	94504	94511	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_019048	TAGG	2	8	95159	95166	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019048	GCGT	2	8	96788	96795	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_019048	TAAA	2	8	97582	97589	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019048	GATA	2	8	97647	97654	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019048	GTTT	2	8	98689	98696	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019048	GTAT	2	8	98823	98830	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019048	TTCT	2	8	99037	99044	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_019048	ATTA	2	8	99057	99064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019048	TAAA	2	8	107190	107197	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019048	TAAA	2	8	113256	113263	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019048	TCTA	2	8	114878	114885	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_019048	ATCA	2	8	115717	115724	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_019048	AACT	2	8	115747	115754	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_019048	ACTT	2	8	119101	119108	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_019048	CAGA	2	8	121318	121325	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_019048	CTTT	2	8	130162	130169	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_019048	TATT	2	8	133850	133857	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019048	AAAT	2	8	133861	133868	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019048	AATA	2	8	133905	133912	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019048	TTCT	2	8	137756	137763	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_019048	ATCA	2	8	138447	138454	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_019048	GAAA	2	8	138626	138633	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019048	GAAG	2	8	138656	138663	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019048	TTAT	2	8	142264	142271	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019048	AAAT	2	8	142504	142511	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019048	ATCA	2	8	142528	142535	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_019048	ATGA	2	8	142610	142617	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019048	TGAA	2	8	142724	142731	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019048	TTTA	2	8	142778	142785	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019048	AATT	2	8	143192	143199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019048	ACAA	2	8	145823	145830	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_019048	AAAG	2	8	154625	154632	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019048	TAAA	2	8	158792	158799	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019048	AAAG	2	8	160666	160673	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019048	ACGA	2	8	164969	164976	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_019048	GTTA	2	8	165261	165268	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019048	GTGA	2	8	165474	165481	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019048	TAAC	2	8	165557	165564	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_019048	AGCG	2	8	165645	165652	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_019048	TGGT	2	8	166310	166317	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019048	AGCC	2	8	166527	166534	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_019048	GTAA	2	8	166981	166988	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019048	GAAG	2	8	167063	167070	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019048	GCGA	2	8	167137	167144	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_019048	ATTC	2	8	168003	168010	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_019048	CTAA	2	8	168359	168366	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_019048	TAGG	2	8	169014	169021	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019048	CTAT	2	8	171077	171084	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_019048	GATT	2	8	171085	171092	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019048	AGAC	2	8	174655	174662	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_019048	TGTT	2	8	174751	174758	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019048	ATGT	2	8	178838	178845	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019048	AAAG	2	8	182785	182792	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019048	TTTG	2	8	189855	189862	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019048	TTAT	2	8	193127	193134	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019048	GGTT	2	8	193484	193491	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019048	ATTC	2	8	193736	193743	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_019048	TTAA	2	8	195868	195875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019048	AAGG	2	8	202337	202344	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019048	TAAT	2	8	203684	203691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019048	ATTT	2	8	208876	208883	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019048	GCTG	2	8	209349	209356	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_019048	CTTA	2	8	209822	209829	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_019048	TTGG	2	8	209936	209943	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019048	ATTT	2	8	219738	219745	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019048	AATG	2	8	219806	219813	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019048	AGCC	2	8	226741	226748	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_019048	TTTA	2	8	227949	227956	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019048	ACGA	2	8	238972	238979	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_019048	GTTA	2	8	239264	239271	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019048	GTGA	2	8	239477	239484	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019048	TAAC	2	8	239560	239567	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_019048	AGCG	2	8	239648	239655	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_019048	TGGT	2	8	240313	240320	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019048	AGCC	2	8	240530	240537	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_019048	GTAA	2	8	240985	240992	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019048	GAAG	2	8	241067	241074	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019048	GCGA	2	8	241141	241148	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_019048	ATTC	2	8	242007	242014	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_019048	CTAA	2	8	242363	242370	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_019048	TAGG	2	8	243018	243025	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019048	GCGT	2	8	244407	244414	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_019048	TAAA	2	8	245201	245208	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_019048	GATA	2	8	245266	245273	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_019048	GAAA	2	8	246393	246400	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019048	TCAC	2	8	246453	246460	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_019048	TAGT	2	8	246647	246654	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_019048	ATTT	2	8	248217	248224	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_019048	TTAT	2	8	248570	248577	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_019048	AAGG	2	8	249242	249249	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_019048	TCAT	2	8	250557	250564	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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