MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Streptococcus agalactiae SA20-06 chromosome

Total Repeats: 26304

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019048	TTG	2	6	8	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019048	TTC	2	6	20	25	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019048	AAT	2	6	68	73	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019048	GAA	2	6	92	97	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019048	AAC	2	6	114	119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410593713
6	NC_019048	CAG	2	6	165	170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410593713
7	NC_019048	CTC	2	6	200	205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410593713
8	NC_019048	TTA	2	6	228	233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593713
9	NC_019048	CTA	2	6	587	592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410593713
10	NC_019048	CTG	2	6	651	656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410593713
11	NC_019048	TTA	2	6	663	668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593713
12	NC_019048	GAA	2	6	704	709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593713
13	NC_019048	TTC	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410593713
14	NC_019048	AGA	2	6	886	891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593713
15	NC_019048	CAC	2	6	936	941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410593713
16	NC_019048	AGA	2	6	1189	1194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593713
17	NC_019048	TAA	2	6	1384	1389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410593713
18	NC_019048	CTA	2	6	1573	1578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_019048	TAC	2	6	1580	1585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_019048	TCT	2	6	1645	1650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410593714
21	NC_019048	ATT	2	6	1869	1874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593714
22	NC_019048	AAC	2	6	1915	1920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410593714
23	NC_019048	ACA	2	6	2004	2009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410593714
24	NC_019048	ATT	2	6	2049	2054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593714
25	NC_019048	TGC	2	6	2069	2074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410593714
26	NC_019048	CAA	2	6	2079	2084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410593714
27	NC_019048	TAA	2	6	2204	2209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410593714
28	NC_019048	GTT	2	6	2220	2225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410593714
29	NC_019048	GAT	2	6	2265	2270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593714
30	NC_019048	TCT	2	6	2290	2295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410593714
31	NC_019048	CCT	2	6	2378	2383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410593714
32	NC_019048	TAA	2	6	2728	2733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410593714
33	NC_019048	ATG	2	6	2811	2816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019048	TAA	2	6	2858	2863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019048	TTG	2	6	2878	2883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019048	GAT	2	6	2943	2948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019048	ATC	2	6	2996	3001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_019048	AGG	2	6	3012	3017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019048	TTA	2	6	3072	3077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019048	ATT	2	6	3330	3335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019048	TTC	2	6	3339	3344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_019048	TAT	2	6	3535	3540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019048	TAC	2	6	3560	3565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_019048	TTG	2	6	3733	3738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410593715
45	NC_019048	ATG	2	6	3858	3863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593715
46	NC_019048	AAT	2	6	3927	3932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019048	AAT	2	6	3964	3969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019048	AGA	2	6	4014	4019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019048	GTT	2	6	4056	4061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019048	ATA	2	6	4199	4204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019048	ATT	2	6	4231	4236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019048	CTA	2	6	4243	4248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_019048	TCT	2	6	4362	4367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_019048	TCT	2	6	4383	4388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_019048	ATA	2	6	4399	4404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019048	CAG	2	6	4448	4453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410593716
57	NC_019048	GCT	2	6	4522	4527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410593716
58	NC_019048	TAA	2	6	4698	4703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410593716
59	NC_019048	TGA	3	9	4758	4766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593716
60	NC_019048	AGA	2	6	5004	5009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593716
61	NC_019048	GTT	2	6	5020	5025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410593716
62	NC_019048	AAC	2	6	5043	5048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410593716
63	NC_019048	TGA	2	6	5076	5081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593716
64	NC_019048	TGA	2	6	5100	5105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593716
65	NC_019048	AGT	2	6	5157	5162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593716
66	NC_019048	GAA	3	9	5182	5190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593716
67	NC_019048	TGA	3	9	5202	5210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593716
68	NC_019048	GCT	2	6	5275	5280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410593716
69	NC_019048	ATC	2	6	5282	5287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410593716
70	NC_019048	CTG	2	6	5312	5317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410593716
71	NC_019048	TAT	2	6	5379	5384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593716
72	NC_019048	ATG	2	6	5432	5437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593716
73	NC_019048	AAG	2	6	5471	5476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593716
74	NC_019048	GAA	2	6	5491	5496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593716
75	NC_019048	TAA	2	6	5554	5559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019048	TTA	2	6	5596	5601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019048	TTG	2	6	5650	5655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410593717
78	NC_019048	ATA	2	6	5695	5700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410593717
79	NC_019048	AGA	2	6	5753	5758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593717
80	NC_019048	ACT	2	6	5826	5831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410593717
81	NC_019048	ACA	2	6	5878	5883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410593717
82	NC_019048	GAT	2	6	5913	5918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593717
83	NC_019048	CTG	2	6	5962	5967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410593717
84	NC_019048	TAT	2	6	5990	5995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593717
85	NC_019048	TTA	2	6	6067	6072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593717
86	NC_019048	ATG	2	6	6100	6105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593717
87	NC_019048	ATT	3	9	6151	6159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593717
88	NC_019048	ATT	2	6	6223	6228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593718
89	NC_019048	GTG	2	6	6242	6247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410593718
90	NC_019048	TGA	2	6	6454	6459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593718
91	NC_019048	TTC	2	6	6791	6796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410593718
92	NC_019048	CAG	2	6	6879	6884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410593718
93	NC_019048	ATT	2	6	6890	6895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593718
94	NC_019048	AAC	2	6	6963	6968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410593718
95	NC_019048	TCG	2	6	7027	7032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410593718
96	NC_019048	TGA	2	6	7105	7110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593718
97	NC_019048	ACA	2	6	7180	7185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410593718
98	NC_019048	CTT	2	6	7258	7263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410593718
99	NC_019048	TCA	2	6	7309	7314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410593718
100	NC_019048	TTG	2	6	7358	7363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410593718
101	NC_019048	TTG	2	6	7524	7529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410593718
102	NC_019048	TGT	2	6	7687	7692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410593718
103	NC_019048	ATG	2	6	7878	7883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593718
104	NC_019048	AGA	2	6	7924	7929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593718
105	NC_019048	TGA	2	6	7936	7941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593718
106	NC_019048	ATA	2	6	8001	8006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410593718
107	NC_019048	ATT	2	6	8113	8118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593718
108	NC_019048	CAA	2	6	8211	8216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410593718
109	NC_019048	CAG	2	6	8228	8233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410593718
110	NC_019048	ATT	3	9	8357	8365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593718
111	NC_019048	TGT	2	6	8392	8397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410593718
112	NC_019048	TGA	2	6	8425	8430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593718
113	NC_019048	TAT	2	6	8644	8649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593718
114	NC_019048	AGG	2	6	8665	8670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410593718
115	NC_019048	TTG	2	6	8892	8897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410593718
116	NC_019048	GTG	2	6	9099	9104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410593718
117	NC_019048	CCA	2	6	9192	9197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410593718
118	NC_019048	CAG	2	6	9267	9272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410593718
119	NC_019048	TAG	2	6	9459	9464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593718
120	NC_019048	CAT	2	6	9487	9492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410593718
121	NC_019048	ATT	2	6	9531	9536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593718
122	NC_019048	GTT	2	6	9599	9604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410593718
123	NC_019048	ATT	2	6	9635	9640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593718
124	NC_019048	GAA	2	6	9641	9646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593718
125	NC_019048	AGA	2	6	9697	9702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593718
126	NC_019048	AAG	2	6	9761	9766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593719
127	NC_019048	TTA	2	6	9832	9837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593719
128	NC_019048	TAG	2	6	9955	9960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019048	ATC	2	6	9985	9990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_019048	CGT	2	6	10034	10039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410593720
131	NC_019048	AAG	2	6	10050	10055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593720
132	NC_019048	TCA	2	6	10100	10105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410593720
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134	NC_019048	TTG	2	6	10154	10159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410593720
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