MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis AC-2713

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019042	TAACTA	2	12	136	147	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_019042	GAAGTG	2	12	25319	25330	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019042	ACTAAT	2	12	25349	25360	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_019042	GAAGTG	2	12	85511	85522	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019042	ACTAAT	2	12	85541	85552	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_019042	TTCGGG	2	12	86474	86485	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_019042	ATAAAA	2	12	124169	124180	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019042	GTAGGT	2	12	171429	171440	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019042	AGATGA	2	12	174160	174171	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019042	AGAGAA	2	12	177413	177424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019042	CATAAA	2	12	217371	217382	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_019042	TCTAGC	2	12	225456	225467	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_019042	TGAAAA	2	12	241922	241933	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019042	GAAGTG	2	12	292660	292671	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019042	ACTAAT	2	12	292690	292701	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_019042	CTCAGT	2	12	321393	321404	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_019042	GAAGTG	2	12	345320	345331	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019042	ACTAAT	2	12	345350	345361	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_019042	AAAAAG	2	12	388337	388348	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019042	AGAAGG	2	12	502296	502307	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019042	AGAAAT	2	12	508133	508144	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019042	AGGACT	2	12	554585	554596	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_019042	GCCAAA	2	12	560924	560935	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_019042	AATTAA	2	12	567988	567999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019042	AAAAGA	2	12	574568	574579	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019042	GAAAAA	2	12	624505	624516	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019042	ATGTCA	2	12	805608	805619	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_019042	AAATAA	2	12	840397	840408	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019042	TATTAA	2	12	941528	941539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019042	TCATGT	2	12	942647	942658	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_019042	AAAATG	2	12	946257	946268	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019042	AAACTA	2	12	946345	946356	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_019042	AAAGAA	2	12	975461	975472	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019042	ATGATA	2	12	978092	978103	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019042	TAAATT	2	12	987079	987090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019042	TTCCTT	2	12	1011198	1011209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_019042	ACCTTT	2	12	1029430	1029441	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_019042	ACAAAT	2	12	1050109	1050120	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_019042	AGAGAA	2	12	1074087	1074098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019042	CCCGAA	2	12	1077396	1077407	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
41	NC_019042	CTCCTT	2	12	1129462	1129473	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_019042	GTTTTC	2	12	1157030	1157041	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_019042	TCTAAT	2	12	1234609	1234620	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_019042	GTAAAT	2	12	1249163	1249174	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019042	TTAATT	2	12	1258838	1258849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019042	CACTAA	2	12	1285784	1285795	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_019042	TGAAAC	2	12	1335003	1335014	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_019042	GTCAGG	2	12	1454337	1454348	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_019042	AAAATC	2	12	1454400	1454411	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_019042	TTTCAT	2	12	1510936	1510947	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_019042	TGACTT	2	12	1519585	1519596	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_019042	ATAATT	2	12	1550513	1550524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019042	GAGATA	2	12	1568517	1568528	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019042	TATTTT	3	18	1626799	1626816	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019042	AGTTTT	2	12	1627065	1627076	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019042	TTTTAT	2	12	1629677	1629688	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019042	CAAGTA	2	12	1633778	1633789	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_019042	TTAGTA	2	12	1634211	1634222	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019042	TGGTAT	2	12	1666199	1666210	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019042	CCTTAT	2	12	1676763	1676774	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_019042	ATTTTC	2	12	1678394	1678405	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_019042	TATTAG	2	12	1681369	1681380	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019042	CAATTC	2	12	1706385	1706396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_019042	TATTTT	2	12	1707457	1707468	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019042	AACTTC	2	12	1763109	1763120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_019042	ATTCCA	2	12	1822779	1822790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_019042	TTCCTT	2	12	1831641	1831652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_019042	ATCATG	2	12	1856803	1856814	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_019042	ACAATA	2	12	1876104	1876115	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_019042	ACTAGT	2	12	1880174	1880185	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_019042	TCTTTC	2	12	1896059	1896070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_019042	CTGATA	2	12	2001341	2001352	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_019042	ACTGTC	2	12	2034931	2034942	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_019042	TATCCT	2	12	2044007	2044018	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_019042	CTTTTT	2	12	2044022	2044033	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_019042	TTAATA	2	12	2082783	2082794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019042	CTTTCT	2	12	2087101	2087112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_019042	TTTTCA	2	12	2102318	2102329	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_019042	TAGTAT	2	12	2139957	2139968	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019042	GAAAAA	2	12	2175113	2175124	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.