MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Fibrella aestuarina BUZ 2 plasmid pFAES01

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019012	CGATGC	2	12	48	59	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019012	GGTCAA	2	12	279	290	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_019012	CAGCAC	2	12	1399	1410	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4	NC_019012	TTCGCC	2	12	1615	1626	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5	NC_019012	CACGCA	2	12	1683	1694	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6	NC_019012	CAAGGC	2	12	2625	2636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410503519
7	NC_019012	CGATGT	2	12	3333	3344	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410503519
8	NC_019012	GTTTTC	2	12	4027	4038	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	410503519
9	NC_019012	ATGGTG	2	12	13610	13621	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	410503531
10	NC_019012	CATCGG	2	12	14355	14366	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	410503531
11	NC_019012	GACTCC	2	12	19125	19136	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	410503536
12	NC_019012	GCCCTG	2	12	21031	21042	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	410503538
13	NC_019012	TGTGTA	2	12	31377	31388	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019012	AGCGTT	2	12	32920	32931	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410503551
15	NC_019012	CTGGAA	2	12	40272	40283	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	410503557
16	NC_019012	TTTGTC	2	12	54283	54294	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	410503569
17	NC_019012	GCTGAT	2	12	55270	55281	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_019012	CGGCAT	2	12	56605	56616	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	410503573
19	NC_019012	TCGCGT	2	12	58243	58254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410503574
20	NC_019012	CGGCTC	2	12	60177	60188	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	410503578
21	NC_019012	CAGGCA	2	12	62311	62322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410503579
22	NC_019012	CCCGAC	2	12	63647	63658	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	410503580
23	NC_019012	TGTTGC	2	12	73712	73723	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	410503590
24	NC_019012	GGTTCA	2	12	75023	75034	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410503591
25	NC_019012	GTCGGA	2	12	83019	83030	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	410503598
26	NC_019012	TATCCT	2	12	83583	83594	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	410503599
27	NC_019012	TACAAG	2	12	86585	86596	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	410503602
28	NC_019012	CTTTTT	2	12	89710	89721	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_019012	AAACTG	2	12	90657	90668	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	410503606
30	NC_019012	TTCTGT	2	12	101987	101998	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	410503618
31	NC_019012	GCGGCT	2	12	104414	104425	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	410503620
32	NC_019012	AGCGCA	2	12	104868	104879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410503620
33	NC_019012	GGGTTT	2	12	111700	111711	0 %	50 %	50 %	0 %	410503624
34	NC_019012	GCAACA	2	12	113410	113421	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	410503625
35	NC_019012	ATCGCC	2	12	119008	119019	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	410503630
36	NC_019012	GCATGA	2	12	119771	119782	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	410503630
37	NC_019012	GGACAG	2	12	120046	120057	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	410503630
38	NC_019012	CTGCAC	2	12	123808	123819	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
39	NC_019012	CAGGTG	2	12	124224	124235	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	410503634
40	NC_019012	GTGCTG	2	12	125154	125165	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	410503634
41	NC_019012	AGCATG	2	12	129549	129560	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	410503635
42	NC_019012	TGGCCC	2	12	133396	133407	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	410503642
43	NC_019012	CGTTTT	2	12	134207	134218	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	410503643
44	NC_019012	TTCCGG	2	12	138150	138161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410503647
45	NC_019012	CTCACG	2	12	138298	138309	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	410503647
46	NC_019012	GGCATT	2	12	141136	141147	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410503650
47	NC_019012	ATTGTT	2	12	141961	141972	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	410503651
48	NC_019012	GGCCGA	2	12	142819	142830	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	410503652
49	NC_019012	GCAAGC	2	12	143620	143631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410503652
50	NC_019012	GTGGTA	2	12	143861	143872	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	410503653
51	NC_019012	ACCAGA	2	12	144018	144029	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	410503653
52	NC_019012	CAGGTG	2	12	146189	146200	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	410503653
53	NC_019012	TGCTGA	2	12	146628	146639	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410503653
54	NC_019012	GTTTCC	2	12	150497	150508	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	410503657
55	NC_019012	AATCGT	2	12	156488	156499	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	410503662
56	NC_019012	CGAACA	2	12	156810	156821	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	410503663
57	NC_019012	ACCGAG	2	12	159577	159588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410503665
58	NC_019012	TTCGCC	2	12	159724	159735	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	410503665

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.