MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Fibrella aestuarina BUZ 2 plasmid pFAES01

Total Repeats: 108

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019012	CTAAC	2	10	6141	6150	40 %	20 %	0 %	40 %	410503523
2	NC_019012	TACGC	2	10	8663	8672	20 %	20 %	20 %	40 %	410503527
3	NC_019012	ACTGA	2	10	9560	9569	40 %	20 %	20 %	20 %	410503528
4	NC_019012	TACGG	2	10	10048	10057	20 %	20 %	40 %	20 %	410503529
5	NC_019012	TTTAT	2	10	10078	10087	20 %	80 %	0 %	0 %	410503529
6	NC_019012	GCGGG	2	10	10379	10388	0 %	0 %	80 %	20 %	410503529
7	NC_019012	CAGCC	2	10	10452	10461	20 %	0 %	20 %	60 %	410503529
8	NC_019012	CTGAA	2	10	10642	10651	40 %	20 %	20 %	20 %	410503529
9	NC_019012	CGGTA	2	10	12162	12171	20 %	20 %	40 %	20 %	410503529
10	NC_019012	CGGCT	2	10	14159	14168	0 %	20 %	40 %	40 %	410503531
11	NC_019012	TACCG	2	10	16040	16049	20 %	20 %	20 %	40 %	410503532
12	NC_019012	TGGGC	2	10	18505	18514	0 %	20 %	60 %	20 %	410503536
13	NC_019012	CCGAC	2	10	19211	19220	20 %	0 %	20 %	60 %	410503536
14	NC_019012	GCCTG	2	10	19424	19433	0 %	20 %	40 %	40 %	410503536
15	NC_019012	ACGGT	2	10	19966	19975	20 %	20 %	40 %	20 %	410503537
16	NC_019012	ACGCA	2	10	24495	24504	40 %	0 %	20 %	40 %	410503541
17	NC_019012	GTACC	2	10	25333	25342	20 %	20 %	20 %	40 %	410503542
18	NC_019012	CTGGT	2	10	26431	26440	0 %	40 %	40 %	20 %	410503543
19	NC_019012	AAGCA	2	10	26957	26966	60 %	0 %	20 %	20 %	410503543
20	NC_019012	GCCGA	2	10	27178	27187	20 %	0 %	40 %	40 %	410503544
21	NC_019012	GGCTC	2	10	27272	27281	0 %	20 %	40 %	40 %	410503544
22	NC_019012	GTTTC	2	10	28172	28181	0 %	60 %	20 %	20 %	410503545
23	NC_019012	CAGCG	2	10	29108	29117	20 %	0 %	40 %	40 %	410503546
24	NC_019012	CTTTT	2	10	30477	30486	0 %	80 %	0 %	20 %	410503548
25	NC_019012	CGACG	2	10	36616	36625	20 %	0 %	40 %	40 %	410503554
26	NC_019012	GTGGG	2	10	36978	36987	0 %	20 %	80 %	0 %	410503554
27	NC_019012	TCGGG	2	10	37113	37122	0 %	20 %	60 %	20 %	410503554
28	NC_019012	ATCGT	2	10	37729	37738	20 %	40 %	20 %	20 %	410503555
29	NC_019012	CAGCC	2	10	38672	38681	20 %	0 %	20 %	60 %	410503557
30	NC_019012	CGGTA	2	10	39437	39446	20 %	20 %	40 %	20 %	410503557
31	NC_019012	CCCCT	2	10	40846	40855	0 %	20 %	0 %	80 %	410503558
32	NC_019012	CCGAC	2	10	42257	42266	20 %	0 %	20 %	60 %	410503559
33	NC_019012	GGTTT	2	10	44274	44283	0 %	60 %	40 %	0 %	410503562
34	NC_019012	CGGCC	2	10	46168	46177	0 %	0 %	40 %	60 %	410503562
35	NC_019012	TTGAG	2	10	49721	49730	20 %	40 %	40 %	0 %	410503563
36	NC_019012	GTTGC	2	10	50986	50995	0 %	40 %	40 %	20 %	410503564
37	NC_019012	CAGAT	2	10	51878	51887	40 %	20 %	20 %	20 %	410503566
38	NC_019012	AGGGC	2	10	52386	52395	20 %	0 %	60 %	20 %	410503566
39	NC_019012	ACAAA	2	10	54141	54150	80 %	0 %	0 %	20 %	410503568
40	NC_019012	TCTGT	2	10	56304	56313	0 %	60 %	20 %	20 %	410503573
41	NC_019012	GCCAC	2	10	60122	60131	20 %	0 %	20 %	60 %	410503578
42	NC_019012	GACGC	2	10	65813	65822	20 %	0 %	40 %	40 %	410503583
43	NC_019012	CGAAT	2	10	65834	65843	40 %	20 %	20 %	20 %	410503583
44	NC_019012	GCCGG	2	10	65860	65869	0 %	0 %	60 %	40 %	410503583
45	NC_019012	ACGGC	2	10	67197	67206	20 %	0 %	40 %	40 %	410503584
46	NC_019012	TTTTC	2	10	70848	70857	0 %	80 %	0 %	20 %	410503589
47	NC_019012	GCCCG	2	10	74588	74597	0 %	0 %	40 %	60 %	410503591
48	NC_019012	CCAAT	2	10	76126	76135	40 %	20 %	0 %	40 %	410503591
49	NC_019012	ACCAA	2	10	76233	76242	60 %	0 %	0 %	40 %	410503592
50	NC_019012	ATCAA	2	10	76712	76721	60 %	20 %	0 %	20 %	410503592
51	NC_019012	GCAAG	2	10	79581	79590	40 %	0 %	40 %	20 %	410503595
52	NC_019012	GGAGC	2	10	79845	79854	20 %	0 %	60 %	20 %	410503595
53	NC_019012	TGAAG	2	10	80465	80474	40 %	20 %	40 %	0 %	410503596
54	NC_019012	GATCC	2	10	80930	80939	20 %	20 %	20 %	40 %	410503596
55	NC_019012	TCGAA	2	10	81415	81424	40 %	20 %	20 %	20 %	410503596
56	NC_019012	ATCCG	2	10	83492	83501	20 %	20 %	20 %	40 %	410503599
57	NC_019012	TTCTG	2	10	84765	84774	0 %	60 %	20 %	20 %	410503601
58	NC_019012	ACTGA	2	10	88417	88426	40 %	20 %	20 %	20 %	410503603
59	NC_019012	TGTGG	2	10	88704	88713	0 %	40 %	60 %	0 %	410503603
60	NC_019012	ACCTG	2	10	88918	88927	20 %	20 %	20 %	40 %	410503604
61	NC_019012	CAACA	2	10	91460	91469	60 %	0 %	0 %	40 %	410503606
62	NC_019012	CTGAT	2	10	92677	92686	20 %	40 %	20 %	20 %	410503606
63	NC_019012	AGCCC	2	10	92919	92928	20 %	0 %	20 %	60 %	410503607
64	NC_019012	CTTGG	2	10	97929	97938	0 %	40 %	40 %	20 %	410503614
65	NC_019012	GGGAG	2	10	98012	98021	20 %	0 %	80 %	0 %	410503614
66	NC_019012	GATGA	2	10	100930	100939	40 %	20 %	40 %	0 %	410503618
67	NC_019012	TGTCG	2	10	101967	101976	0 %	40 %	40 %	20 %	410503618
68	NC_019012	CCTGG	2	10	102507	102516	0 %	20 %	40 %	40 %	410503619
69	NC_019012	GGCGG	2	10	102900	102909	0 %	0 %	80 %	20 %	410503619
70	NC_019012	TGGAG	2	10	103643	103652	20 %	20 %	60 %	0 %	410503619
71	NC_019012	GGGCG	2	10	104630	104639	0 %	0 %	80 %	20 %	410503620
72	NC_019012	TCGGG	2	10	106655	106664	0 %	20 %	60 %	20 %	410503621
73	NC_019012	GCTCG	2	10	107294	107303	0 %	20 %	40 %	40 %	410503622
74	NC_019012	GGTGC	2	10	107675	107684	0 %	20 %	60 %	20 %	410503622
75	NC_019012	TGGCC	2	10	107953	107962	0 %	20 %	40 %	40 %	410503622
76	NC_019012	CCGGC	2	10	108423	108432	0 %	0 %	40 %	60 %	410503622
77	NC_019012	TTGTA	2	10	109065	109074	20 %	60 %	20 %	0 %	410503623
78	NC_019012	CTACA	2	10	109664	109673	40 %	20 %	0 %	40 %	410503623
79	NC_019012	CAACG	2	10	111065	111074	40 %	0 %	20 %	40 %	410503624
80	NC_019012	TCAAG	2	10	113074	113083	40 %	20 %	20 %	20 %	410503625
81	NC_019012	AAGGT	2	10	115458	115467	40 %	20 %	40 %	0 %	410503626
82	NC_019012	ATGAC	2	10	119630	119639	40 %	20 %	20 %	20 %	410503630
83	NC_019012	CGGCC	2	10	119677	119686	0 %	0 %	40 %	60 %	410503630
84	NC_019012	ATTGA	2	10	120109	120118	40 %	40 %	20 %	0 %	410503630
85	NC_019012	GCTCG	2	10	122841	122850	0 %	20 %	40 %	40 %	410503633
86	NC_019012	GACCT	2	10	123355	123364	20 %	20 %	20 %	40 %	410503633
87	NC_019012	TGCCC	2	10	124199	124208	0 %	20 %	20 %	60 %	410503634
88	NC_019012	CCTGA	2	10	124317	124326	20 %	20 %	20 %	40 %	410503634
89	NC_019012	GGTAC	2	10	126216	126225	20 %	20 %	40 %	20 %	410503634
90	NC_019012	GGCTC	2	10	129385	129394	0 %	20 %	40 %	40 %	410503635
91	NC_019012	GGCTG	2	10	132033	132042	0 %	20 %	60 %	20 %	410503640
92	NC_019012	GCTGG	2	10	132058	132067	0 %	20 %	60 %	20 %	410503640
93	NC_019012	GGCTG	2	10	132113	132122	0 %	20 %	60 %	20 %	410503640
94	NC_019012	CAGCG	2	10	132135	132144	20 %	0 %	40 %	40 %	410503640
95	NC_019012	GGACT	2	10	132380	132389	20 %	20 %	40 %	20 %	410503640
96	NC_019012	GGCAG	2	10	133075	133084	20 %	0 %	60 %	20 %	410503641
97	NC_019012	CGGGC	2	10	134091	134100	0 %	0 %	60 %	40 %	410503642
98	NC_019012	CGATG	2	10	134748	134757	20 %	20 %	40 %	20 %	410503643
99	NC_019012	GATGG	2	10	135151	135160	20 %	20 %	60 %	0 %	410503644
100	NC_019012	GTTTG	2	10	140454	140463	0 %	60 %	40 %	0 %	410503650
101	NC_019012	ACCAA	2	10	141203	141212	60 %	0 %	0 %	40 %	410503650
102	NC_019012	TCAGG	2	10	145564	145573	20 %	20 %	40 %	20 %	410503653
103	NC_019012	TGCGC	2	10	145813	145822	0 %	20 %	40 %	40 %	410503653
104	NC_019012	TCAAC	2	10	148373	148382	40 %	20 %	0 %	40 %	410503655
105	NC_019012	CCTTA	2	10	149769	149778	20 %	40 %	0 %	40 %	410503656
106	NC_019012	TTTAG	2	10	158680	158689	20 %	60 %	20 %	0 %	410503665
107	NC_019012	GGGCA	2	10	158892	158901	20 %	0 %	60 %	20 %	410503665
108	NC_019012	GTTAG	2	10	159274	159283	20 %	40 %	40 %	0 %	410503665

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.