MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Fibrella aestuarina BUZ 2 plasmid pFAES01

Total Repeats: 390

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019012	GAAT	2	8	2923	2930	50 %	25 %	25 %	0 %	410503519
2	NC_019012	CCAT	2	8	2963	2970	25 %	25 %	0 %	50 %	410503519
3	NC_019012	ATGA	2	8	3649	3656	50 %	25 %	25 %	0 %	410503519
4	NC_019012	GTTT	2	8	3827	3834	0 %	75 %	25 %	0 %	410503519
5	NC_019012	GTCC	2	8	4394	4401	0 %	25 %	25 %	50 %	410503520
6	NC_019012	CTTT	2	8	4599	4606	0 %	75 %	0 %	25 %	410503520
7	NC_019012	CTTG	2	8	4835	4842	0 %	50 %	25 %	25 %	410503521
8	NC_019012	TCGG	2	8	5044	5051	0 %	25 %	50 %	25 %	410503521
9	NC_019012	CGTT	2	8	5278	5285	0 %	50 %	25 %	25 %	410503521
10	NC_019012	CGGA	2	8	5309	5316	25 %	0 %	50 %	25 %	410503521
11	NC_019012	GCCC	2	8	5606	5613	0 %	0 %	25 %	75 %	410503522
12	NC_019012	CCGA	2	8	5616	5623	25 %	0 %	25 %	50 %	410503522
13	NC_019012	TGAT	2	8	5803	5810	25 %	50 %	25 %	0 %	410503522
14	NC_019012	TGGT	2	8	5845	5852	0 %	50 %	50 %	0 %	410503522
15	NC_019012	GAAG	2	8	6462	6469	50 %	0 %	50 %	0 %	410503524
16	NC_019012	AGCC	2	8	7206	7213	25 %	0 %	25 %	50 %	410503525
17	NC_019012	TAAG	2	8	7268	7275	50 %	25 %	25 %	0 %	410503525
18	NC_019012	GCAG	2	8	7333	7340	25 %	0 %	50 %	25 %	410503525
19	NC_019012	TCGG	2	8	7884	7891	0 %	25 %	50 %	25 %	410503526
20	NC_019012	GTTT	2	8	8745	8752	0 %	75 %	25 %	0 %	410503527
21	NC_019012	GTAC	2	8	9133	9140	25 %	25 %	25 %	25 %	410503528
22	NC_019012	ATGA	2	8	9683	9690	50 %	25 %	25 %	0 %	410503528
23	NC_019012	GCGG	2	8	9951	9958	0 %	0 %	75 %	25 %	410503529
24	NC_019012	GCCC	2	8	10190	10197	0 %	0 %	25 %	75 %	410503529
25	NC_019012	GAAC	2	8	10365	10372	50 %	0 %	25 %	25 %	410503529
26	NC_019012	GATA	2	8	11153	11160	50 %	25 %	25 %	0 %	410503529
27	NC_019012	CGAA	2	8	11463	11470	50 %	0 %	25 %	25 %	410503529
28	NC_019012	AACG	2	8	11679	11686	50 %	0 %	25 %	25 %	410503529
29	NC_019012	GGTG	2	8	12144	12151	0 %	25 %	75 %	0 %	410503529
30	NC_019012	ACAA	2	8	12380	12387	75 %	0 %	0 %	25 %	410503529
31	NC_019012	CGCC	2	8	12595	12602	0 %	0 %	25 %	75 %	410503530
32	NC_019012	GAAC	2	8	13153	13160	50 %	0 %	25 %	25 %	410503530
33	NC_019012	GTCA	2	8	13473	13480	25 %	25 %	25 %	25 %	410503531
34	NC_019012	TGCG	2	8	14201	14208	0 %	25 %	50 %	25 %	410503531
35	NC_019012	GTTG	2	8	14212	14219	0 %	50 %	50 %	0 %	410503531
36	NC_019012	TAGG	2	8	15570	15577	25 %	25 %	50 %	0 %	410503532
37	NC_019012	ATAC	2	8	15583	15590	50 %	25 %	0 %	25 %	410503532
38	NC_019012	AGCC	2	8	16091	16098	25 %	0 %	25 %	50 %	410503532
39	NC_019012	CGAC	2	8	16420	16427	25 %	0 %	25 %	50 %	410503532
40	NC_019012	TGGG	2	8	16464	16471	0 %	25 %	75 %	0 %	410503532
41	NC_019012	CCAC	2	8	16839	16846	25 %	0 %	0 %	75 %	410503532
42	NC_019012	ACCG	2	8	17018	17025	25 %	0 %	25 %	50 %	410503532
43	NC_019012	GATT	2	8	17040	17047	25 %	50 %	25 %	0 %	410503532
44	NC_019012	TGAT	2	8	18041	18048	25 %	50 %	25 %	0 %	410503534
45	NC_019012	CCGT	2	8	18055	18062	0 %	25 %	25 %	50 %	410503534
46	NC_019012	CCAC	2	8	18157	18164	25 %	0 %	0 %	75 %	410503534
47	NC_019012	CCAG	2	8	18284	18291	25 %	0 %	25 %	50 %	410503534
48	NC_019012	CCAG	2	8	18352	18359	25 %	0 %	25 %	50 %	410503536
49	NC_019012	GTAC	2	8	18681	18688	25 %	25 %	25 %	25 %	410503536
50	NC_019012	GTCG	2	8	19780	19787	0 %	25 %	50 %	25 %	410503536
51	NC_019012	CGTT	2	8	19791	19798	0 %	50 %	25 %	25 %	410503536
52	NC_019012	GCGG	2	8	19978	19985	0 %	0 %	75 %	25 %	410503537
53	NC_019012	CGGG	2	8	21291	21298	0 %	0 %	75 %	25 %	410503538
54	NC_019012	AGAT	2	8	21724	21731	50 %	25 %	25 %	0 %	410503539
55	NC_019012	TCCC	2	8	22966	22973	0 %	25 %	0 %	75 %	410503540
56	NC_019012	GGCT	3	12	23609	23620	0 %	25 %	50 %	25 %	410503540
57	NC_019012	CGGG	2	8	25433	25440	0 %	0 %	75 %	25 %	410503542
58	NC_019012	CCCG	2	8	26110	26117	0 %	0 %	25 %	75 %	410503543
59	NC_019012	GACG	2	8	26118	26125	25 %	0 %	50 %	25 %	410503543
60	NC_019012	GGCT	2	8	26468	26475	0 %	25 %	50 %	25 %	410503543
61	NC_019012	CTGG	2	8	27115	27122	0 %	25 %	50 %	25 %	410503544
62	NC_019012	ATTT	2	8	27613	27620	25 %	75 %	0 %	0 %	410503544
63	NC_019012	AAAC	2	8	27748	27755	75 %	0 %	0 %	25 %	410503544
64	NC_019012	CTGT	2	8	27898	27905	0 %	50 %	25 %	25 %	410503545
65	NC_019012	TTCG	2	8	28314	28321	0 %	50 %	25 %	25 %	410503545
66	NC_019012	GTTT	2	8	28472	28479	0 %	75 %	25 %	0 %	410503545
67	NC_019012	ATTA	2	8	28522	28529	50 %	50 %	0 %	0 %	410503545
68	NC_019012	CCAG	2	8	28909	28916	25 %	0 %	25 %	50 %	410503546
69	NC_019012	TACC	2	8	29594	29601	25 %	25 %	0 %	50 %	410503547
70	NC_019012	CTCA	2	8	29679	29686	25 %	25 %	0 %	50 %	410503547
71	NC_019012	CAAG	2	8	32046	32053	50 %	0 %	25 %	25 %	410503549
72	NC_019012	CTTT	2	8	32834	32841	0 %	75 %	0 %	25 %	410503551
73	NC_019012	ACCG	2	8	33442	33449	25 %	0 %	25 %	50 %	410503552
74	NC_019012	CAAT	2	8	33617	33624	50 %	25 %	0 %	25 %	410503552
75	NC_019012	CCCA	2	8	34036	34043	25 %	0 %	0 %	75 %	410503552
76	NC_019012	ACCG	2	8	34078	34085	25 %	0 %	25 %	50 %	410503552
77	NC_019012	CCCG	2	8	34258	34265	0 %	0 %	25 %	75 %	410503552
78	NC_019012	TGGT	2	8	35033	35040	0 %	50 %	50 %	0 %	410503553
79	NC_019012	CCGT	2	8	35138	35145	0 %	25 %	25 %	50 %	410503553
80	NC_019012	CATC	2	8	35651	35658	25 %	25 %	0 %	50 %	410503553
81	NC_019012	ATGG	2	8	36042	36049	25 %	25 %	50 %	0 %	410503553
82	NC_019012	ATGA	2	8	36226	36233	50 %	25 %	25 %	0 %	410503553
83	NC_019012	TTTG	2	8	36567	36574	0 %	75 %	25 %	0 %	410503553
84	NC_019012	ATTG	2	8	36640	36647	25 %	50 %	25 %	0 %	410503554
85	NC_019012	ACCT	2	8	36788	36795	25 %	25 %	0 %	50 %	410503554
86	NC_019012	GTAT	2	8	37223	37230	25 %	50 %	25 %	0 %	410503554
87	NC_019012	GACA	2	8	37531	37538	50 %	0 %	25 %	25 %	410503555
88	NC_019012	CCCG	2	8	38154	38161	0 %	0 %	25 %	75 %	410503557
89	NC_019012	CAGC	2	8	38611	38618	25 %	0 %	25 %	50 %	410503557
90	NC_019012	TTAT	2	8	38827	38834	25 %	75 %	0 %	0 %	410503557
91	NC_019012	TGGC	2	8	38927	38934	0 %	25 %	50 %	25 %	410503557
92	NC_019012	GGTC	2	8	39159	39166	0 %	25 %	50 %	25 %	410503557
93	NC_019012	CATG	2	8	39401	39408	25 %	25 %	25 %	25 %	410503557
94	NC_019012	ATTA	2	8	39768	39775	50 %	50 %	0 %	0 %	410503557
95	NC_019012	CCTC	2	8	39848	39855	0 %	25 %	0 %	75 %	410503557
96	NC_019012	GTCG	2	8	40034	40041	0 %	25 %	50 %	25 %	410503557
97	NC_019012	CAGT	2	8	40050	40057	25 %	25 %	25 %	25 %	410503557
98	NC_019012	TATG	2	8	40070	40077	25 %	50 %	25 %	0 %	410503557
99	NC_019012	GTTA	2	8	41284	41291	25 %	50 %	25 %	0 %	410503558
100	NC_019012	GATC	2	8	41393	41400	25 %	25 %	25 %	25 %	410503558
101	NC_019012	ATAG	2	8	41553	41560	50 %	25 %	25 %	0 %	410503558
102	NC_019012	GCCC	2	8	42465	42472	0 %	0 %	25 %	75 %	410503559
103	NC_019012	TCGG	2	8	42783	42790	0 %	25 %	50 %	25 %	410503560
104	NC_019012	CGAC	2	8	42990	42997	25 %	0 %	25 %	50 %	410503560
105	NC_019012	TTTA	2	8	43007	43014	25 %	75 %	0 %	0 %	410503560
106	NC_019012	TGCC	2	8	43418	43425	0 %	25 %	25 %	50 %	410503561
107	NC_019012	CCCG	2	8	43728	43735	0 %	0 %	25 %	75 %	410503562
108	NC_019012	AGCC	2	8	44304	44311	25 %	0 %	25 %	50 %	410503562
109	NC_019012	CGAC	2	8	44542	44549	25 %	0 %	25 %	50 %	410503562
110	NC_019012	CCAT	2	8	44574	44581	25 %	25 %	0 %	50 %	410503562
111	NC_019012	CGAC	2	8	44775	44782	25 %	0 %	25 %	50 %	410503562
112	NC_019012	ACGA	2	8	44867	44874	50 %	0 %	25 %	25 %	410503562
113	NC_019012	TGAA	2	8	45759	45766	50 %	25 %	25 %	0 %	410503562
114	NC_019012	GGAA	2	8	46063	46070	50 %	0 %	50 %	0 %	410503562
115	NC_019012	TGTT	2	8	46140	46147	0 %	75 %	25 %	0 %	410503562
116	NC_019012	GCCA	2	8	46264	46271	25 %	0 %	25 %	50 %	410503562
117	NC_019012	CGTG	2	8	46457	46464	0 %	25 %	50 %	25 %	410503562
118	NC_019012	GCTT	2	8	47445	47452	0 %	50 %	25 %	25 %	410503562
119	NC_019012	GTAC	2	8	47744	47751	25 %	25 %	25 %	25 %	410503562
120	NC_019012	CGGT	2	8	47977	47984	0 %	25 %	50 %	25 %	410503562
121	NC_019012	ATCA	2	8	48005	48012	50 %	25 %	0 %	25 %	410503562
122	NC_019012	GATG	2	8	48199	48206	25 %	25 %	50 %	0 %	410503562
123	NC_019012	AGCC	2	8	48777	48784	25 %	0 %	25 %	50 %	410503562
124	NC_019012	TTGA	2	8	49638	49645	25 %	50 %	25 %	0 %	410503563
125	NC_019012	TGGC	2	8	49828	49835	0 %	25 %	50 %	25 %	410503563
126	NC_019012	TGTT	2	8	49861	49868	0 %	75 %	25 %	0 %	410503563
127	NC_019012	AGTC	2	8	50414	50421	25 %	25 %	25 %	25 %	410503563
128	NC_019012	CTCA	2	8	50433	50440	25 %	25 %	0 %	50 %	410503563
129	NC_019012	TTCC	2	8	50454	50461	0 %	50 %	0 %	50 %	410503563
130	NC_019012	CTGC	2	8	50669	50676	0 %	25 %	25 %	50 %	410503564
131	NC_019012	GCTC	2	8	51071	51078	0 %	25 %	25 %	50 %	410503564
132	NC_019012	GAAA	2	8	51327	51334	75 %	0 %	25 %	0 %	410503565
133	NC_019012	GCCC	2	8	52311	52318	0 %	0 %	25 %	75 %	410503566
134	NC_019012	TGAG	2	8	52983	52990	25 %	25 %	50 %	0 %	410503567
135	NC_019012	ACGG	2	8	53137	53144	25 %	0 %	50 %	25 %	410503567
136	NC_019012	TCAG	2	8	53322	53329	25 %	25 %	25 %	25 %	410503567
137	NC_019012	TGAA	2	8	53726	53733	50 %	25 %	25 %	0 %	410503568
138	NC_019012	CAGC	2	8	54112	54119	25 %	0 %	25 %	50 %	410503568
139	NC_019012	TGGA	2	8	54254	54261	25 %	25 %	50 %	0 %	410503569
140	NC_019012	TATC	2	8	54677	54684	25 %	50 %	0 %	25 %	410503570
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.