MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori 26695 chromosome

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018939	ACTTAG	2	12	44968	44979	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018939	AGAAAA	2	12	62309	62320	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018939	AAAAGA	2	12	62432	62443	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018939	AGAAAA	2	12	62540	62551	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018939	TACAAA	2	12	97145	97156	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_018939	GTTTTA	2	12	138218	138229	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018939	TAAAAA	2	12	174561	174572	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018939	CAAAAC	2	12	230929	230940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018939	ATTAAA	2	12	232435	232446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018939	TCAATA	2	12	238696	238707	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_018939	ATTTTA	2	12	255514	255525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018939	AAATTT	2	12	271004	271015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018939	TGCATT	2	12	334146	334157	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_018939	ATCCAT	2	12	352253	352264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018939	TTAATT	2	12	399231	399242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018939	TTAAAG	2	12	448351	448362	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018939	CTAAGT	2	12	448927	448938	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_018939	AAAGAA	2	12	452324	452335	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018939	GTTTGT	2	12	452766	452777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018939	AAGATA	2	12	454799	454810	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018939	GCCAAA	2	12	467700	467711	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018939	AGAAAA	2	12	467735	467746	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018939	TTTCTT	2	12	479958	479969	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_018939	TAAAAA	2	12	485972	485983	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018939	TATTTT	2	12	510970	510981	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018939	TTTAAT	2	12	522697	522708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018939	TAAAGA	2	12	531219	531230	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018939	TTGTAA	2	12	561591	561602	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018939	TTTTAT	2	12	567650	567661	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018939	TTTAAA	2	12	567769	567780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018939	TTTAAA	2	12	586936	586947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018939	ATTTTA	2	12	620088	620099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018939	AAATCA	2	12	630229	630240	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_018939	ACTTTC	2	12	649616	649627	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_018939	TTTAAT	2	12	651596	651607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018939	CCAAAC	2	12	651907	651918	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_018939	ATTTGA	2	12	652005	652016	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018939	GCGAAT	2	12	654887	654898	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_018939	ATGTGG	2	12	656169	656180	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018939	CTCAAT	2	12	677857	677868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_018939	ACACCA	2	12	684103	684114	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_018939	AAGAAA	2	12	731473	731484	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018939	ATGGTA	2	12	767856	767867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018939	AATAAG	2	12	768053	768064	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018939	ACTTTT	2	12	900678	900689	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_018939	GTTCCA	2	12	900835	900846	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018939	CTTTTT	2	12	925569	925580	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_018939	ATTTTT	2	12	927365	927376	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018939	AGCAAT	2	12	941932	941943	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_018939	ATTATA	2	12	970820	970831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018939	ATTGAA	2	12	978311	978322	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018939	ACATAT	2	12	1020410	1020421	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_018939	TTAAAA	2	12	1020433	1020444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018939	TATGGG	2	12	1026306	1026317	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018939	CTAAGT	2	12	1045533	1045544	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_018939	CAAGAG	2	12	1048087	1048098	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_018939	AAGATA	2	12	1051520	1051531	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018939	AGTGGC	2	12	1052854	1052865	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_018939	AAACCA	2	12	1054748	1054759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_018939	TAAATC	2	12	1057350	1057361	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_018939	CAAAAT	2	12	1057859	1057870	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_018939	GTTTTT	2	12	1058184	1058195	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018939	TTTTTC	2	12	1065958	1065969	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_018939	CATGCG	2	12	1066328	1066339	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018939	AAACCC	2	12	1071674	1071685	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_018939	AAAGAA	3	18	1071833	1071850	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018939	TATTTT	2	12	1079912	1079923	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018939	AAAAAC	2	12	1153545	1153556	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_018939	GCATTA	2	12	1206876	1206887	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_018939	AAATTA	2	12	1210499	1210510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018939	AACGCT	2	12	1211017	1211028	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_018939	ACAGAA	2	12	1241828	1241839	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_018939	AAATCA	2	12	1249252	1249263	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_018939	ATCCTT	2	12	1259551	1259562	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_018939	AAACTT	2	12	1302608	1302619	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_018939	TGTTAT	2	12	1312105	1312116	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018939	TGCATT	2	12	1320087	1320098	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_018939	AAAATC	2	12	1407178	1407189	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_018939	CAAATG	2	12	1413388	1413399	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_018939	TGGCTT	2	12	1413667	1413678	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_018939	CTTTAA	2	12	1473762	1473773	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_018939	GTTTTA	2	12	1495000	1495011	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018939	TAGCTT	2	12	1496525	1496536	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_018939	TAAAAA	2	12	1496640	1496651	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018939	TAAAAA	2	12	1496838	1496849	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018939	CTAAGT	6	36	1508329	1508364	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_018939	TGTTTA	2	12	1516937	1516948	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018939	TACGAT	2	12	1595179	1595190	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_018939	TTGAAT	2	12	1595318	1595329	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018939	TTTTGA	2	12	1595908	1595919	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018939	TTCTAA	2	12	1596696	1596707	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_018939	TTTTAC	2	12	1596851	1596862	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_018939	AAATTG	2	12	1597136	1597147	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.