MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori 26695 chromosome

Total Repeats: 697

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018939	AAAGCG	2	12	494	505	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	410681523
2	NC_018939	ATTATA	2	12	2001	2012	50 %	50 %	0 %	0 %	410681526
3	NC_018939	GCTTGC	2	12	6274	6285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410681530
4	NC_018939	GAAACC	2	12	7721	7732	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	410681531
5	NC_018939	AGAAAA	2	12	18673	18684	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	410681540
6	NC_018939	GATAAA	2	12	22229	22240	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	410681543
7	NC_018939	ATAAAC	2	12	22601	22612	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	410681543
8	NC_018939	TTTCTT	2	12	22952	22963	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	410681544
9	NC_018939	ATTTTT	2	12	25052	25063	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	410681545
10	NC_018939	CAATTC	2	12	27035	27046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410681546
11	NC_018939	TATCAA	2	12	30208	30219	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	410681550
12	NC_018939	TCTTAT	2	12	30922	30933	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	410681550
13	NC_018939	CAAAGC	2	12	32626	32637	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	410681552
14	NC_018939	GCGTGG	2	12	32975	32986	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	410681553
15	NC_018939	TTGGAT	2	12	33085	33096	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	410681553
16	NC_018939	TAATGA	2	12	33120	33131	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	410681553
17	NC_018939	TTGAAT	2	12	34171	34182	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	410681553
18	NC_018939	TAAGGA	2	12	34470	34481	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	410681553
19	NC_018939	TAGGGG	2	12	35977	35988	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	410681556
20	NC_018939	AAAGAA	2	12	37489	37500	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	410681557
21	NC_018939	AAAGAA	2	12	39063	39074	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	410681559
22	NC_018939	CAAAAT	2	12	41409	41420	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	410681561
23	NC_018939	CGCAAA	2	12	45823	45834	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	410681565
24	NC_018939	GGCTAG	2	12	50066	50077	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	410681569
25	NC_018939	TGAAAT	2	12	51799	51810	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	410681571
26	NC_018939	CTTTTT	2	12	53909	53920	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	410681573
27	NC_018939	ATTTGC	2	12	56033	56044	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	410681573
28	NC_018939	TAAAAA	2	12	57629	57640	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	410681574
29	NC_018939	CCACGC	2	12	59384	59395	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	410681575
30	NC_018939	AGAAAA	2	12	62645	62656	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	410681577
31	NC_018939	AAAAGA	2	12	63516	63527	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	410681578
32	NC_018939	GATGTG	2	12	64325	64336	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	410681579
33	NC_018939	AGCCAA	2	12	64403	64414	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	410681579
34	NC_018939	CCAACA	2	12	66291	66302	50 %	0 %	0 %	50 %	410681579
35	NC_018939	TTTTGT	2	12	66629	66640	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	410681580
36	NC_018939	AAAGAG	2	12	66908	66919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410681580
37	NC_018939	AGAAAA	2	12	68428	68439	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	410681582
38	NC_018939	AGCGGG	2	12	70590	70601	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	410681585
39	NC_018939	ACGCCC	2	12	78357	78368	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	410681594
40	NC_018939	AAGGGC	2	12	81084	81095	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	410681597
41	NC_018939	CGCCCA	2	12	81620	81631	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	410681597
42	NC_018939	AGGATA	2	12	82465	82476	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	410681599
43	NC_018939	GTGAGC	2	12	83067	83078	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	410681599
44	NC_018939	CAACGA	2	12	83413	83424	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	410681599
45	NC_018939	GGCATG	2	12	84911	84922	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	410681600
46	NC_018939	GGCATG	2	12	84935	84946	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	410681600
47	NC_018939	GCAACG	2	12	85983	85994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410681600
48	NC_018939	AATATT	2	12	86857	86868	50 %	50 %	0 %	0 %	410681602
49	NC_018939	AAAAAT	2	12	97349	97360	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	410681611
50	NC_018939	CAAGAT	2	12	99193	99204	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	410681613
51	NC_018939	GATTTT	2	12	100623	100634	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	410681616
52	NC_018939	AAACTC	2	12	100740	100751	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	410681616
53	NC_018939	TCAAAA	2	12	102034	102045	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	410681617
54	NC_018939	TTATCG	2	12	102612	102623	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	410681618
55	NC_018939	CAATAT	2	12	105940	105951	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	410681619
56	NC_018939	TGGAGC	2	12	116847	116858	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	410681630
57	NC_018939	TTTTCT	2	12	118347	118358	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	410681631
58	NC_018939	CGCTCG	2	12	123519	123530	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	410681636
59	NC_018939	TAGGCA	2	12	126056	126067	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	410681637
60	NC_018939	CTTCTA	2	12	128385	128396	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	410681639
61	NC_018939	GTTCTA	2	12	128730	128741	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	410681639
62	NC_018939	CTTCTA	2	12	129844	129855	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	410681640
63	NC_018939	CTTCTA	2	12	131514	131525	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	410681641
64	NC_018939	GTTCTA	2	12	131793	131804	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	410681641
65	NC_018939	GTTCTA	2	12	131856	131867	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	410681641
66	NC_018939	CTAAAG	2	12	133169	133180	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	410681642
67	NC_018939	TGAATT	2	12	133703	133714	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	410681642
68	NC_018939	TTTCAA	2	12	133862	133873	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	410681642
69	NC_018939	AGCAAA	2	12	137208	137219	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	410681645
70	NC_018939	TGGTTT	2	12	138732	138743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410681648
71	NC_018939	TCATGA	2	12	139984	139995	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	410681649
72	NC_018939	AAAAAT	2	12	146564	146575	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	410681655
73	NC_018939	ATTCAA	2	12	147655	147666	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	410681657
74	NC_018939	TTAGCG	2	12	151613	151624	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410681660
75	NC_018939	TATCGC	2	12	151825	151836	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	410681660
76	NC_018939	TTTTAG	2	12	152948	152959	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	410681661
77	NC_018939	ATCGCT	2	12	153541	153552	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	410681661
78	NC_018939	CCTAAA	2	12	155766	155777	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	410681664
79	NC_018939	TTGTTT	2	12	159913	159924	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	410681670
80	NC_018939	CTTGGG	2	12	160575	160586	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	410681672
81	NC_018939	ATTGGA	2	12	161947	161958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410681673
82	NC_018939	TTGGGT	2	12	165349	165360	0 %	50 %	50 %	0 %	410681677
83	NC_018939	GATGGC	2	12	169088	169099	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	410681682
84	NC_018939	CCGCTC	2	12	171476	171487	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	410681684
85	NC_018939	GCTCTC	2	12	173903	173914	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	410681686
86	NC_018939	TAGTGG	2	12	175673	175684	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	410681689
87	NC_018939	TTCTAA	2	12	176226	176237	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	410681689
88	NC_018939	CGTTTT	2	12	178059	178070	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	410681691
89	NC_018939	ATCGTT	2	12	178372	178383	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	410681691
90	NC_018939	AATTTC	2	12	178723	178734	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	410681692
91	NC_018939	TAAAAT	2	12	180247	180258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410681693
92	NC_018939	ATTTTG	2	12	182057	182068	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	410681696
93	NC_018939	CGCTTT	2	12	182535	182546	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	410681696
94	NC_018939	ACTTAT	2	12	182632	182643	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	410681696
95	NC_018939	CCGCTC	2	12	186346	186357	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	410681700
96	NC_018939	AAAGCA	2	12	187542	187553	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	410681701
97	NC_018939	AATAAA	2	12	188515	188526	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	410681702
98	NC_018939	GAAAAA	2	12	189970	189981	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	410681703
99	NC_018939	AGGCAT	2	12	190059	190070	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	410681703
100	NC_018939	GCATTT	2	12	191772	191783	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	410681705
101	NC_018939	TCAAAC	2	12	192339	192350	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	410681706
102	NC_018939	ATAAAG	2	12	192500	192511	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	410681706
103	NC_018939	GGTATT	2	12	196263	196274	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	410681711
104	NC_018939	TCTAAA	2	12	196493	196504	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	410681711
105	NC_018939	TGGGCA	2	12	197562	197573	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	410681712
106	NC_018939	ATTTTC	2	12	199986	199997	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	410681713
107	NC_018939	TGGGGC	2	12	207393	207404	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	410681723
108	NC_018939	CTATGG	2	12	207782	207793	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410681723
109	NC_018939	AAATCC	2	12	209173	209184	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	410681726
110	NC_018939	CTGTAT	2	12	210919	210930	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	410681727
111	NC_018939	AATTTT	2	12	211639	211650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410681727
112	NC_018939	GGGAAC	2	12	215696	215707	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	410681732
113	NC_018939	ATTCTA	2	12	219364	219375	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	410681735
114	NC_018939	CATAGC	2	12	221104	221115	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	410681736
115	NC_018939	GTTTTG	2	12	221609	221620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410681736
116	NC_018939	TAATTA	2	12	226112	226123	50 %	50 %	0 %	0 %	410681741
117	NC_018939	AGGGCC	2	12	236659	236670	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	410681751
118	NC_018939	CACGCC	2	12	239176	239187	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	410681753
119	NC_018939	GCTAGG	2	12	241796	241807	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	410681755
120	NC_018939	TCTTTA	2	12	248416	248427	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	410681762
121	NC_018939	GTTTTT	2	12	254054	254065	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	410681769
122	NC_018939	ATTGTC	2	12	257214	257225	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	410681773
123	NC_018939	TCCCGC	2	12	259416	259427	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	410681775
124	NC_018939	TCCCGC	2	12	260229	260240	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	410681775
125	NC_018939	GAAAAG	2	12	266258	266269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410681781
126	NC_018939	AAAAAG	2	12	266569	266580	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	410681782
127	NC_018939	TGAGCG	2	12	268086	268097	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	410681784
128	NC_018939	CTTTAG	2	12	268392	268403	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	410681784
129	NC_018939	AAATTC	2	12	270614	270625	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	410681786
130	NC_018939	ATGGAA	2	12	274041	274052	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	410681789
131	NC_018939	TGAGCG	2	12	278018	278029	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	410681792
132	NC_018939	AGCTTT	2	12	278166	278177	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	410681792
133	NC_018939	GATTTT	2	12	282705	282716	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	410681799
134	NC_018939	ATTAGA	2	12	282827	282838	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	410681799
135	NC_018939	TCAAAA	2	12	284938	284949	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	410681801
136	NC_018939	AAATAC	2	12	285247	285258	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	410681802
137	NC_018939	AAATCA	2	12	285608	285619	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	410681803
138	NC_018939	GAATAA	2	12	287291	287302	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	410681804
139	NC_018939	AGCTCA	2	12	295129	295140	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	410681810
140	NC_018939	AGCGAG	2	12	296647	296658	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	410681811
141	NC_018939	ATCAAA	2	12	298063	298074	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	410681814
142	NC_018939	TTTTAA	2	12	298943	298954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410681814
143	NC_018939	ACTTTT	2	12	299049	299060	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	410681814
144	NC_018939	TAACAT	2	12	304487	304498	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	410681814
145	NC_018939	CTACAA	2	12	306200	306211	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	410681814
146	NC_018939	TTGTGG	2	12	307605	307616	0 %	50 %	50 %	0 %	410681815
147	NC_018939	GTAGCG	2	12	311658	311669	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	410681819
148	NC_018939	TTATCG	2	12	313924	313935	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	410681820
149	NC_018939	GTTTGT	2	12	314066	314077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410681820
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152	NC_018939	GAGCGG	2	12	319233	319244	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	410681826
153	NC_018939	GCTATG	2	12	319609	319620	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410681826
154	NC_018939	GTTGGA	2	12	321576	321587	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	410681828
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220	NC_018939	AGGGTT	2	12	519593	519604	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	410682013
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222	NC_018939	GCTCGC	2	12	523650	523661	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	410682017
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227	NC_018939	CTTGCG	2	12	538994	539005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410682030
228	NC_018939	TTTAAT	2	12	539226	539237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410682030
229	NC_018939	CATTTT	2	12	542791	542802	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	410682034
230	NC_018939	CTATCG	2	12	543086	543097	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	410682035
231	NC_018939	GAAATT	2	12	543520	543531	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	410682035
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233	NC_018939	AGAAAA	2	12	549053	549064	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	410682042
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457	NC_018939	CTTATC	2	12	1118021	1118032	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	410682569
458	NC_018939	ACAGCG	2	12	1127576	1127587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410682582
459	NC_018939	TTAGCG	2	12	1130749	1130760	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410682586
460	NC_018939	CTATTT	2	12	1131560	1131571	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	410682586
461	NC_018939	TAATTT	2	12	1133802	1133813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410682588
462	NC_018939	ATCTCA	2	12	1137086	1137097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410682592
463	NC_018939	TTTCAA	2	12	1137477	1137488	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	410682592
464	NC_018939	TCCATT	2	12	1141417	1141428	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	410682596
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