MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori 26695 chromosome

Total Repeats: 1372

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018939	TAAAA	2	10	914	923	80 %	20 %	0 %	0 %	410681524
2	NC_018939	TAAAA	2	10	1807	1816	80 %	20 %	0 %	0 %	410681525
3	NC_018939	TTTTA	2	10	5116	5125	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018939	TTGAT	2	10	6052	6061	20 %	60 %	20 %	0 %	410681530
5	NC_018939	AAATT	2	10	7274	7283	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018939	TTTCT	2	10	8385	8394	0 %	80 %	0 %	20 %	410681531
7	NC_018939	TGCCA	2	10	11857	11866	20 %	20 %	20 %	40 %	410681534
8	NC_018939	TTGAA	2	10	11897	11906	40 %	40 %	20 %	0 %	410681534
9	NC_018939	TTTTG	2	10	11913	11922	0 %	80 %	20 %	0 %	410681534
10	NC_018939	TGGTG	2	10	12748	12757	0 %	40 %	60 %	0 %	410681535
11	NC_018939	GCTTT	2	10	13576	13585	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_018939	CAAAA	2	10	18638	18647	80 %	0 %	0 %	20 %	410681540
13	NC_018939	TGAAA	2	10	20982	20991	60 %	20 %	20 %	0 %	410681542
14	NC_018939	TAAAG	2	10	21687	21696	60 %	20 %	20 %	0 %	410681543
15	NC_018939	AAAAG	2	10	23259	23268	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018939	CCATG	2	10	23437	23446	20 %	20 %	20 %	40 %	410681545
17	NC_018939	CAAGC	2	10	28246	28255	40 %	0 %	20 %	40 %	410681547
18	NC_018939	TGGGT	2	10	28683	28692	0 %	40 %	60 %	0 %	410681547
19	NC_018939	TTTTA	2	10	29177	29186	20 %	80 %	0 %	0 %	410681548
20	NC_018939	GTTTC	2	10	30491	30500	0 %	60 %	20 %	20 %	410681550
21	NC_018939	TCAAA	2	10	31006	31015	60 %	20 %	0 %	20 %	410681550
22	NC_018939	TTTTC	2	10	31176	31185	0 %	80 %	0 %	20 %	410681550
23	NC_018939	TCATA	2	10	31648	31657	40 %	40 %	0 %	20 %	410681550
24	NC_018939	GTGGG	2	10	34133	34142	0 %	20 %	80 %	0 %	410681553
25	NC_018939	AGCCT	2	10	39551	39560	20 %	20 %	20 %	40 %	410681560
26	NC_018939	AAGCC	2	10	41149	41158	40 %	0 %	20 %	40 %	410681561
27	NC_018939	CAAAC	2	10	41790	41799	60 %	0 %	0 %	40 %	410681561
28	NC_018939	AGAAA	2	10	42476	42485	80 %	0 %	20 %	0 %	410681562
29	NC_018939	TACTC	2	10	43329	43338	20 %	40 %	0 %	40 %	410681563
30	NC_018939	CTATT	2	10	44351	44360	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_018939	TAAAA	2	10	45758	45767	80 %	20 %	0 %	0 %	410681565
32	NC_018939	TCCCA	2	10	46770	46779	20 %	20 %	0 %	60 %	410681566
33	NC_018939	TGCCT	2	10	49883	49892	0 %	40 %	20 %	40 %	410681568
34	NC_018939	GATTG	2	10	52111	52120	20 %	40 %	40 %	0 %	410681571
35	NC_018939	TGCTT	2	10	52166	52175	0 %	60 %	20 %	20 %	410681571
36	NC_018939	GATAA	2	10	52411	52420	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018939	CTTGA	2	10	52582	52591	20 %	40 %	20 %	20 %	410681572
38	NC_018939	CAACA	2	10	52621	52630	60 %	0 %	0 %	40 %	410681572
39	NC_018939	AAATA	2	10	53404	53413	80 %	20 %	0 %	0 %	410681572
40	NC_018939	CCAAA	2	10	53737	53746	60 %	0 %	0 %	40 %	410681573
41	NC_018939	TAAAA	2	10	55788	55797	80 %	20 %	0 %	0 %	410681573
42	NC_018939	ATCAA	2	10	55819	55828	60 %	20 %	0 %	20 %	410681573
43	NC_018939	TGAAA	2	10	56548	56557	60 %	20 %	20 %	0 %	410681574
44	NC_018939	TCAAA	2	10	56802	56811	60 %	20 %	0 %	20 %	410681574
45	NC_018939	CAGCA	2	10	57749	57758	40 %	0 %	20 %	40 %	410681575
46	NC_018939	TAAAA	2	10	59841	59850	80 %	20 %	0 %	0 %	410681575
47	NC_018939	TCAAA	2	10	60557	60566	60 %	20 %	0 %	20 %	410681575
48	NC_018939	AACGA	2	10	61560	61569	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_018939	TTAAA	2	10	61572	61581	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018939	TATCC	2	10	65037	65046	20 %	40 %	0 %	40 %	410681579
51	NC_018939	GGTGG	2	10	70511	70520	0 %	20 %	80 %	0 %	410681585
52	NC_018939	ACACC	2	10	71183	71192	40 %	0 %	0 %	60 %	410681585
53	NC_018939	TCAAT	2	10	73688	73697	40 %	40 %	0 %	20 %	410681588
54	NC_018939	TTTCT	2	10	74225	74234	0 %	80 %	0 %	20 %	410681589
55	NC_018939	CTTGG	2	10	74488	74497	0 %	40 %	40 %	20 %	410681589
56	NC_018939	CTTCT	2	10	74542	74551	0 %	60 %	0 %	40 %	410681589
57	NC_018939	TGCCT	2	10	74619	74628	0 %	40 %	20 %	40 %	410681589
58	NC_018939	TCCAA	2	10	75031	75040	40 %	20 %	0 %	40 %	410681590
59	NC_018939	TTTTG	2	10	78313	78322	0 %	80 %	20 %	0 %	410681594
60	NC_018939	ACGCC	2	10	78619	78628	20 %	0 %	20 %	60 %	410681594
61	NC_018939	AAAGC	2	10	79385	79394	60 %	0 %	20 %	20 %	410681595
62	NC_018939	TTACA	2	10	80167	80176	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_018939	TTTGT	2	10	84181	84190	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018939	GTATG	2	10	84898	84907	20 %	40 %	40 %	0 %	410681600
65	NC_018939	CCTCA	2	10	86914	86923	20 %	20 %	0 %	60 %	410681602
66	NC_018939	ATCTT	2	10	88013	88022	20 %	60 %	0 %	20 %	410681602
67	NC_018939	TGGCT	2	10	88554	88563	0 %	40 %	40 %	20 %	410681602
68	NC_018939	ATGCC	2	10	88978	88987	20 %	20 %	20 %	40 %	410681603
69	NC_018939	TTGAT	2	10	90024	90033	20 %	60 %	20 %	0 %	410681605
70	NC_018939	GGCGT	2	10	91838	91847	0 %	20 %	60 %	20 %	410681607
71	NC_018939	ATAAG	2	10	95018	95027	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018939	ATTAT	2	10	95075	95084	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018939	CTTTC	2	10	95403	95412	0 %	60 %	0 %	40 %	410681609
74	NC_018939	TTTGA	2	10	98197	98206	20 %	60 %	20 %	0 %	410681612
75	NC_018939	TCTTT	2	10	98408	98417	0 %	80 %	0 %	20 %	410681612
76	NC_018939	GGCTT	2	10	99528	99537	0 %	40 %	40 %	20 %	410681614
77	NC_018939	GAATT	2	10	106322	106331	40 %	40 %	20 %	0 %	410681620
78	NC_018939	TCGTT	2	10	108220	108229	0 %	60 %	20 %	20 %	410681621
79	NC_018939	CAAAA	2	10	110812	110821	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_018939	TCTTT	2	10	111524	111533	0 %	80 %	0 %	20 %	410681624
81	NC_018939	TAGGC	2	10	113127	113136	20 %	20 %	40 %	20 %	410681626
82	NC_018939	AAAGC	2	10	114314	114323	60 %	0 %	20 %	20 %	410681627
83	NC_018939	GAATG	2	10	115545	115554	40 %	20 %	40 %	0 %	410681629
84	NC_018939	CAAAT	2	10	116868	116877	60 %	20 %	0 %	20 %	410681630
85	NC_018939	ACCCT	2	10	118296	118305	20 %	20 %	0 %	60 %	410681631
86	NC_018939	ATGCC	2	10	118428	118437	20 %	20 %	20 %	40 %	410681631
87	NC_018939	ATTTA	2	10	119811	119820	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018939	GATCT	2	10	119821	119830	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_018939	TGATT	2	10	120590	120599	20 %	60 %	20 %	0 %	410681633
90	NC_018939	AAGCC	2	10	126993	127002	40 %	0 %	20 %	40 %	410681638
91	NC_018939	TTGAT	2	10	128822	128831	20 %	60 %	20 %	0 %	410681639
92	NC_018939	CAATC	2	10	129202	129211	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
93	NC_018939	CAATC	2	10	130872	130881	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
94	NC_018939	TTGAT	2	10	131948	131957	20 %	60 %	20 %	0 %	410681641
95	NC_018939	CTGAT	2	10	132123	132132	20 %	40 %	20 %	20 %	410681641
96	NC_018939	TTTGA	2	10	133188	133197	20 %	60 %	20 %	0 %	410681642
97	NC_018939	GACTT	2	10	133722	133731	20 %	40 %	20 %	20 %	410681642
98	NC_018939	ATCTC	2	10	134473	134482	20 %	40 %	0 %	40 %	410681642
99	NC_018939	TTTGT	2	10	134987	134996	0 %	80 %	20 %	0 %	410681643
100	NC_018939	GAAAA	2	10	137180	137189	80 %	0 %	20 %	0 %	410681645
101	NC_018939	GAAAA	2	10	137498	137507	80 %	0 %	20 %	0 %	410681645
102	NC_018939	ATTTT	2	10	140455	140464	20 %	80 %	0 %	0 %	410681650
103	NC_018939	ATGTT	2	10	140537	140546	20 %	60 %	20 %	0 %	410681650
104	NC_018939	AAAAG	2	10	140949	140958	80 %	0 %	20 %	0 %	410681650
105	NC_018939	GATGT	2	10	141686	141695	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018939	TTTTA	2	10	141865	141874	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018939	AGATT	2	10	142204	142213	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018939	AAATC	2	10	143248	143257	60 %	20 %	0 %	20 %	410681652
109	NC_018939	AAAAT	2	10	144720	144729	80 %	20 %	0 %	0 %	410681653
110	NC_018939	TTTTC	2	10	147075	147084	0 %	80 %	0 %	20 %	410681656
111	NC_018939	GTAAA	2	10	147627	147636	60 %	20 %	20 %	0 %	410681657
112	NC_018939	TTCTT	2	10	149031	149040	0 %	80 %	0 %	20 %	410681658
113	NC_018939	TCTTT	2	10	149525	149534	0 %	80 %	0 %	20 %	410681659
114	NC_018939	TTTTG	2	10	150698	150707	0 %	80 %	20 %	0 %	410681660
115	NC_018939	GCGAT	2	10	151491	151500	20 %	20 %	40 %	20 %	410681660
116	NC_018939	GCTTG	2	10	151747	151756	0 %	40 %	40 %	20 %	410681660
117	NC_018939	GTCCA	2	10	152359	152368	20 %	20 %	20 %	40 %	410681661
118	NC_018939	TTTTG	2	10	152407	152416	0 %	80 %	20 %	0 %	410681661
119	NC_018939	CCAAA	2	10	154247	154256	60 %	0 %	0 %	40 %	410681662
120	NC_018939	TAAGG	2	10	155307	155316	40 %	20 %	40 %	0 %	410681663
121	NC_018939	ACGCC	2	10	157771	157780	20 %	0 %	20 %	60 %	410681665
122	NC_018939	TTATT	2	10	159666	159675	20 %	80 %	0 %	0 %	410681669
123	NC_018939	GCGTT	2	10	160024	160033	0 %	40 %	40 %	20 %	410681671
124	NC_018939	ATTTG	2	10	161000	161009	20 %	60 %	20 %	0 %	410681672
125	NC_018939	CAAAT	2	10	162895	162904	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_018939	AGATT	2	10	165518	165527	40 %	40 %	20 %	0 %	410681677
127	NC_018939	AAGCC	2	10	166857	166866	40 %	0 %	20 %	40 %	410681680
128	NC_018939	TGGCG	2	10	167531	167540	0 %	20 %	60 %	20 %	410681680
129	NC_018939	GGCAT	2	10	168672	168681	20 %	20 %	40 %	20 %	410681681
130	NC_018939	ATTTT	2	10	168908	168917	20 %	80 %	0 %	0 %	410681682
131	NC_018939	GGGTG	2	10	169264	169273	0 %	20 %	80 %	0 %	410681682
132	NC_018939	AACAA	2	10	170406	170415	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_018939	AATAA	2	10	170428	170437	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018939	ATTCA	2	10	170784	170793	40 %	40 %	0 %	20 %	410681683
135	NC_018939	ATCTT	2	10	174186	174195	20 %	60 %	0 %	20 %	410681686
136	NC_018939	ATATT	2	10	181587	181596	40 %	60 %	0 %	0 %	410681695
137	NC_018939	GAATG	2	10	181724	181733	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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266	NC_018939	TGAAT	2	10	349297	349306	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
267	NC_018939	CGTGG	2	10	350165	350174	0 %	20 %	60 %	20 %	410681863
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