MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Rif2 chromosome

Total Repeats: 619

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018938	GTTT	2	8	2633	2640	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018938	ATGC	2	8	4486	4493	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_018938	TAAA	2	8	4891	4898	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018938	TAAG	2	8	7306	7313	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018938	GTTT	2	8	7399	7406	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018938	AGCG	2	8	7497	7504	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_018938	ATAA	2	8	9645	9652	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018938	TATT	2	8	9845	9852	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018938	ATTC	2	8	9860	9867	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_018938	TTAA	2	8	13674	13681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018938	AGTT	2	8	16620	16627	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018938	ATCA	2	8	22732	22739	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_018938	TTTA	2	8	22777	22784	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018938	GTTG	2	8	22836	22843	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018938	CTTG	2	8	23121	23128	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_018938	TTTG	2	8	23229	23236	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018938	ATTA	2	8	25583	25590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018938	CGCT	2	8	25977	25984	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_018938	GGTT	2	8	31950	31957	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018938	CAAA	2	8	44267	44274	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_018938	AAAC	2	8	44437	44444	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_018938	ATCT	2	8	44481	44488	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_018938	CTGT	2	8	44542	44549	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_018938	AAAT	2	8	44643	44650	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018938	GATT	2	8	44732	44739	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018938	AAAG	2	8	51375	51382	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018938	TAAA	2	8	51734	51741	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018938	TTTA	2	8	61310	61317	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018938	TAAT	2	8	61410	61417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018938	ACAA	2	8	61602	61609	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_018938	GGGA	2	8	61855	61862	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018938	CTGA	2	8	62281	62288	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_018938	CTAA	2	8	62323	62330	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_018938	AAGC	2	8	62350	62357	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_018938	CTAA	2	8	62407	62414	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_018938	CTGA	2	8	62512	62519	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_018938	CTAA	2	8	62554	62561	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_018938	AAGC	2	8	62581	62588	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_018938	CAAA	2	8	75349	75356	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_018938	TAGA	2	8	80147	80154	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018938	ATTT	2	8	81839	81846	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018938	AACT	2	8	86259	86266	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_018938	CCAA	2	8	86291	86298	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_018938	CGTT	2	8	86586	86593	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_018938	TTTG	2	8	89750	89757	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018938	TCAA	2	8	95000	95007	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_018938	AAAC	2	8	95183	95190	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_018938	GGTG	2	8	96965	96972	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018938	TCCC	2	8	97035	97042	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
50	NC_018938	TTCA	2	8	102368	102375	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_018938	AACA	2	8	110856	110863	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_018938	AACA	2	8	115432	115439	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_018938	GATC	2	8	115514	115521	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_018938	CCGC	2	8	116332	116339	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
55	NC_018938	CTTT	2	8	118235	118242	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_018938	AAAT	2	8	118245	118252	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018938	GCTT	2	8	119976	119983	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_018938	TCAT	2	8	124619	124626	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_018938	ACTG	2	8	129321	129328	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_018938	ACTG	2	8	130991	130998	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_018938	GATT	2	8	132322	132329	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018938	TATT	2	8	132330	132337	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018938	GTTA	2	8	134930	134937	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018938	AAAG	2	8	137834	137841	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018938	AAAG	2	8	138329	138336	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018938	GAAG	2	8	138386	138393	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018938	ATTG	2	8	139452	139459	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018938	AATC	2	8	139559	139566	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_018938	CTAT	2	8	140169	140176	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_018938	GAAT	2	8	141609	141616	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018938	AAGC	2	8	141946	141953	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_018938	AAAC	2	8	142161	142168	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_018938	CTTT	2	8	142176	142183	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_018938	ATTT	2	8	144930	144937	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018938	TAAG	2	8	150292	150299	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018938	TGCA	2	8	156324	156331	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_018938	ATTT	2	8	168776	168783	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018938	AATA	2	8	170206	170213	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018938	CACT	2	8	181397	181404	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_018938	GATT	2	8	181465	181472	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018938	GATT	2	8	187799	187806	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018938	GTTT	2	8	187897	187904	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018938	CATT	2	8	193009	193016	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_018938	TTTG	2	8	193028	193035	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018938	TGCA	2	8	194909	194916	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_018938	CAAT	2	8	203605	203612	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_018938	TAAG	2	8	205265	205272	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018938	CAAC	2	8	208579	208586	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_018938	AAAC	2	8	208779	208786	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_018938	GTTT	2	8	214685	214692	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018938	CTTA	2	8	219071	219078	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_018938	TGTT	2	8	219080	219087	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018938	TATT	2	8	227668	227675	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018938	ATTT	2	8	233643	233650	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018938	AAAC	2	8	234939	234946	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_018938	GAAA	2	8	237295	237302	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018938	TTTA	2	8	240206	240213	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018938	AGCG	2	8	244420	244427	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_018938	TAAT	2	8	254696	254703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018938	TTTA	2	8	254812	254819	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018938	TCAA	2	8	255388	255395	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_018938	CATT	2	8	258741	258748	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_018938	TAAT	2	8	261411	261418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018938	AAAG	2	8	261456	261463	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018938	ATGA	2	8	271694	271701	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018938	TTTA	2	8	271709	271716	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018938	AACA	2	8	314651	314658	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_018938	TTAA	2	8	315480	315487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018938	GTTT	2	8	322984	322991	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018938	AATG	2	8	323152	323159	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018938	TGAA	2	8	330242	330249	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018938	AAAG	2	8	331554	331561	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018938	TTGG	2	8	337087	337094	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018938	TTTG	2	8	337097	337104	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018938	TTGG	2	8	339361	339368	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018938	CGCA	2	8	342042	342049	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_018938	AAAT	2	8	345512	345519	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018938	AAAC	2	8	349348	349355	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_018938	AAAT	2	8	349654	349661	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018938	AATC	2	8	351504	351511	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_018938	GTTT	2	8	352304	352311	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018938	AGTG	2	8	352410	352417	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018938	GAGT	2	8	352752	352759	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018938	AATG	2	8	353157	353164	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018938	TGAA	2	8	358290	358297	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018938	TAAT	2	8	367009	367016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018938	ATTT	2	8	367112	367119	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018938	TGCG	2	8	374813	374820	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_018938	TCTA	2	8	376757	376764	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_018938	ACAA	2	8	380854	380861	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_018938	ATTT	2	8	384216	384223	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018938	TAAA	2	8	393672	393679	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018938	AAAT	2	8	411112	411119	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018938	CTAA	2	8	425480	425487	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_018938	TCTG	2	8	425924	425931	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_018938	ATAA	2	8	427561	427568	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018938	TTTA	2	8	439276	439283	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018938	TCAA	2	8	444616	444623	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_018938	TTTA	3	12	444764	444775	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018938	TTTA	3	12	444780	444791	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018938	TTTA	3	12	444796	444807	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018938	TTTA	3	12	444812	444823	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018938	TTTA	3	12	444828	444839	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018938	TTTC	2	8	444892	444899	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_018938	TTTC	2	8	444911	444918	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_018938	CAAG	2	8	445019	445026	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_018938	GCGA	2	8	445563	445570	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_018938	CAAA	2	8	446139	446146	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_018938	GGTG	2	8	446300	446307	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018938	AATC	2	8	446312	446319	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_018938	AAAG	2	8	446436	446443	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018938	AGCT	2	8	446793	446800	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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481	NC_018938	TCAA	2	8	1245619	1245626	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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500	NC_018938	CAAT	2	8	1313220	1313227	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

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