MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori Rif2 chromosome

Total Repeats: 14966

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018938	GAT	3	9	328	336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501006
2	NC_018938	TTC	2	6	562	567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501006
3	NC_018938	ACA	2	6	588	593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410501006
4	NC_018938	CAA	2	6	662	667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410501007
5	NC_018938	AAT	2	6	903	908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410501007
6	NC_018938	CTT	2	6	1006	1011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501007
7	NC_018938	TGA	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501007
8	NC_018938	AAC	2	6	1230	1235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410501008
9	NC_018938	CCG	3	9	1249	1257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410501008
10	NC_018938	CCA	2	6	1393	1398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410501008
11	NC_018938	GCT	2	6	1418	1423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410501008
12	NC_018938	GGC	2	6	1609	1614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410501008
13	NC_018938	GTT	2	6	1829	1834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501008
14	NC_018938	CTT	2	6	1863	1868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501008
15	NC_018938	ATG	2	6	2029	2034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501009
16	NC_018938	GTT	2	6	2103	2108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501009
17	NC_018938	CTT	2	6	2192	2197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501009
18	NC_018938	TGG	2	6	2249	2254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410501009
19	NC_018938	TCA	2	6	2257	2262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410501009
20	NC_018938	TGA	2	6	2868	2873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501010
21	NC_018938	AGC	2	6	2983	2988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410501010
22	NC_018938	GTG	2	6	3172	3177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410501010
23	NC_018938	GTG	2	6	3331	3336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410501010
24	NC_018938	GCC	2	6	3338	3343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410501010
25	NC_018938	TTG	2	6	3422	3427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501011
26	NC_018938	GAA	2	6	3454	3459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410501011
27	NC_018938	GTT	2	6	3784	3789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501011
28	NC_018938	CAG	2	6	4030	4035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410501011
29	NC_018938	ATT	2	6	4112	4117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410501011
30	NC_018938	TGT	2	6	4123	4128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501011
31	NC_018938	TGG	2	6	4181	4186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410501011
32	NC_018938	TAT	2	6	4959	4964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410501012
33	NC_018938	TTA	2	6	5014	5019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410501012
34	NC_018938	ATT	2	6	5472	5477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410501013
35	NC_018938	TGG	2	6	5570	5575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410501013
36	NC_018938	ATA	2	6	5691	5696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410501013
37	NC_018938	TCT	2	6	5709	5714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501013
38	NC_018938	GTT	2	6	5772	5777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501013
39	NC_018938	TAA	2	6	5841	5846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410501013
40	NC_018938	TTA	2	6	5899	5904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410501013
41	NC_018938	GTG	2	6	5968	5973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410501013
42	NC_018938	GTT	2	6	5988	5993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501013
43	NC_018938	CAA	2	6	6036	6041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410501013
44	NC_018938	AGT	2	6	6200	6205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501013
45	NC_018938	CAG	2	6	6320	6325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410501013
46	NC_018938	GTT	2	6	6372	6377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501013
47	NC_018938	CTT	2	6	6566	6571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501013
48	NC_018938	TAG	8	24	6593	6616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501013
49	NC_018938	TTA	2	6	6625	6630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410501013
50	NC_018938	TGT	2	6	6645	6650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501013
51	NC_018938	TTG	2	6	6717	6722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501013
52	NC_018938	GTT	2	6	6786	6791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501013
53	NC_018938	CCG	2	6	6920	6925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410501013
54	NC_018938	GCT	2	6	7035	7040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410501013
55	NC_018938	GTT	2	6	7065	7070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501013
56	NC_018938	CAT	2	6	7606	7611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410501014
57	NC_018938	TCT	2	6	7673	7678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501014
58	NC_018938	AAT	2	6	7771	7776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410501014
59	NC_018938	CTT	2	6	7779	7784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501014
60	NC_018938	CAT	2	6	7869	7874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410501014
61	NC_018938	ATG	2	6	7922	7927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501014
62	NC_018938	TCA	2	6	7946	7951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410501014
63	NC_018938	CCG	2	6	8000	8005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410501014
64	NC_018938	CTT	2	6	8019	8024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501014
65	NC_018938	CAT	2	6	8052	8057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410501014
66	NC_018938	CAT	2	6	8223	8228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410501014
67	NC_018938	GTG	2	6	8255	8260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410501014
68	NC_018938	TTC	2	6	8335	8340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501014
69	NC_018938	TAA	2	6	8343	8348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410501014
70	NC_018938	CCG	2	6	8354	8359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410501014
71	NC_018938	CAC	2	6	8455	8460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410501014
72	NC_018938	GAT	2	6	8497	8502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501014
73	NC_018938	TAG	2	6	8536	8541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501014
74	NC_018938	ACA	2	6	8678	8683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410501014
75	NC_018938	CTT	2	6	8709	8714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501014
76	NC_018938	TCT	2	6	8819	8824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501014
77	NC_018938	TAA	2	6	8862	8867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410501014
78	NC_018938	CTT	2	6	8940	8945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501014
79	NC_018938	GCA	2	6	8993	8998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410501014
80	NC_018938	CTT	2	6	9018	9023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501014
81	NC_018938	ACA	2	6	9340	9345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410501015
82	NC_018938	TCT	2	6	9374	9379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501015
83	NC_018938	CTT	2	6	9456	9461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501015
84	NC_018938	GAT	3	9	9544	9552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501015
85	NC_018938	TCT	2	6	9572	9577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410501015
86	NC_018938	CTA	2	6	9588	9593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410501015
87	NC_018938	TTG	2	6	10015	10020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501016
88	NC_018938	GAA	2	6	10031	10036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410501016
89	NC_018938	TTA	2	6	10210	10215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410501016
90	NC_018938	AGA	2	6	10225	10230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410501016
91	NC_018938	ACC	2	6	10233	10238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410501016
92	NC_018938	AAG	2	6	10266	10271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410501016
93	NC_018938	ATT	2	6	10299	10304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410501016
94	NC_018938	CAT	2	6	10480	10485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410501016
95	NC_018938	GTG	2	6	10514	10519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410501016
96	NC_018938	ATG	2	6	10794	10799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501016
97	NC_018938	AGG	2	6	10859	10864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410501016
98	NC_018938	AAC	2	6	10886	10891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410501016
99	NC_018938	AGA	2	6	11272	11277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410501016
100	NC_018938	TTG	2	6	11285	11290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501016
101	NC_018938	GAC	2	6	11372	11377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410501016
102	NC_018938	TTA	3	9	11393	11401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410501016
103	NC_018938	TTG	2	6	11450	11455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501016
104	NC_018938	TGT	2	6	11636	11641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501017
105	NC_018938	TGT	2	6	11804	11809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501017
106	NC_018938	AAG	2	6	11963	11968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410501017
107	NC_018938	GGT	2	6	12049	12054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410501017
108	NC_018938	GTT	2	6	12078	12083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501017
109	NC_018938	TTG	2	6	12140	12145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501017
110	NC_018938	TGG	3	9	12374	12382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410501017
111	NC_018938	GAA	3	9	12391	12399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410501017
112	NC_018938	TGG	2	6	12473	12478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410501017
113	NC_018938	AGA	2	6	12495	12500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410501017
114	NC_018938	TTA	2	6	12804	12809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410501018
115	NC_018938	GAA	2	6	12821	12826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410501018
116	NC_018938	GTT	2	6	12888	12893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501018
117	NC_018938	ATT	2	6	12911	12916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410501018
118	NC_018938	CGC	2	6	13063	13068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410501018
119	NC_018938	AAT	2	6	13193	13198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410501018
120	NC_018938	ACC	2	6	13287	13292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410501018
121	NC_018938	GGT	2	6	13429	13434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410501018
122	NC_018938	AGA	2	6	13489	13494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410501018
123	NC_018938	GTG	2	6	13915	13920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410501019
124	NC_018938	GAA	2	6	14006	14011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410501020
125	NC_018938	GAA	2	6	14332	14337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410501021
126	NC_018938	AAC	2	6	14338	14343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410501021
127	NC_018938	ATG	2	6	14357	14362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410501021
128	NC_018938	TCC	2	6	14402	14407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410501021
129	NC_018938	CAA	2	6	14542	14547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410501021
130	NC_018938	AAG	2	6	14603	14608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410501021
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139	NC_018938	AAG	2	6	15836	15841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410501021
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152	NC_018938	GTT	2	6	17507	17512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410501022
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