MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori Rif2 chromosome

Total Repeats: 2372

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018938	CT	3	6	897	902	0 %	50 %	0 %	50 %	410501007
2	NC_018938	CA	3	6	1432	1437	50 %	0 %	0 %	50 %	410501008
3	NC_018938	TC	3	6	1491	1496	0 %	50 %	0 %	50 %	410501008
4	NC_018938	CT	3	6	1767	1772	0 %	50 %	0 %	50 %	410501008
5	NC_018938	GC	3	6	2118	2123	0 %	0 %	50 %	50 %	410501009
6	NC_018938	CA	3	6	2481	2486	50 %	0 %	0 %	50 %	410501009
7	NC_018938	GC	3	6	2996	3001	0 %	0 %	50 %	50 %	410501010
8	NC_018938	AG	3	6	3153	3158	50 %	0 %	50 %	0 %	410501010
9	NC_018938	AG	3	6	3433	3438	50 %	0 %	50 %	0 %	410501011
10	NC_018938	CA	3	6	3981	3986	50 %	0 %	0 %	50 %	410501011
11	NC_018938	GC	3	6	6030	6035	0 %	0 %	50 %	50 %	410501013
12	NC_018938	AC	3	6	6459	6464	50 %	0 %	0 %	50 %	410501013
13	NC_018938	GA	11	22	7221	7242	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018938	GC	3	6	7916	7921	0 %	0 %	50 %	50 %	410501014
15	NC_018938	CG	3	6	7981	7986	0 %	0 %	50 %	50 %	410501014
16	NC_018938	AG	3	6	8128	8133	50 %	0 %	50 %	0 %	410501014
17	NC_018938	AG	3	6	10327	10332	50 %	0 %	50 %	0 %	410501016
18	NC_018938	AG	3	6	11144	11149	50 %	0 %	50 %	0 %	410501016
19	NC_018938	GC	3	6	11223	11228	0 %	0 %	50 %	50 %	410501016
20	NC_018938	AG	3	6	11722	11727	50 %	0 %	50 %	0 %	410501017
21	NC_018938	AG	3	6	11782	11787	50 %	0 %	50 %	0 %	410501017
22	NC_018938	GA	3	6	12789	12794	50 %	0 %	50 %	0 %	410501018
23	NC_018938	TG	3	6	13863	13868	0 %	50 %	50 %	0 %	410501019
24	NC_018938	GC	3	6	14506	14511	0 %	0 %	50 %	50 %	410501021
25	NC_018938	TC	3	6	14683	14688	0 %	50 %	0 %	50 %	410501021
26	NC_018938	TC	3	6	14721	14726	0 %	50 %	0 %	50 %	410501021
27	NC_018938	AG	3	6	15108	15113	50 %	0 %	50 %	0 %	410501021
28	NC_018938	CA	3	6	16681	16686	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_018938	GC	3	6	17189	17194	0 %	0 %	50 %	50 %	410501022
30	NC_018938	TC	3	6	17498	17503	0 %	50 %	0 %	50 %	410501022
31	NC_018938	AG	3	6	19383	19388	50 %	0 %	50 %	0 %	410501024
32	NC_018938	GA	3	6	19574	19579	50 %	0 %	50 %	0 %	410501024
33	NC_018938	CT	3	6	19772	19777	0 %	50 %	0 %	50 %	410501024
34	NC_018938	GC	3	6	20965	20970	0 %	0 %	50 %	50 %	410501025
35	NC_018938	GC	3	6	23091	23096	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_018938	GC	3	6	23449	23454	0 %	0 %	50 %	50 %	410501028
37	NC_018938	AG	3	6	24044	24049	50 %	0 %	50 %	0 %	410501028
38	NC_018938	GT	3	6	25516	25521	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018938	GC	3	6	26388	26393	0 %	0 %	50 %	50 %	410501029
40	NC_018938	CG	3	6	26463	26468	0 %	0 %	50 %	50 %	410501029
41	NC_018938	AG	3	6	26951	26956	50 %	0 %	50 %	0 %	410501029
42	NC_018938	CA	3	6	27102	27107	50 %	0 %	0 %	50 %	410501029
43	NC_018938	TA	3	6	27502	27507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018938	TG	3	6	27961	27966	0 %	50 %	50 %	0 %	410501030
45	NC_018938	AG	3	6	28201	28206	50 %	0 %	50 %	0 %	410501030
46	NC_018938	AG	3	6	29317	29322	50 %	0 %	50 %	0 %	410501031
47	NC_018938	GC	3	6	29391	29396	0 %	0 %	50 %	50 %	410501031
48	NC_018938	TC	3	6	30179	30184	0 %	50 %	0 %	50 %	410501033
49	NC_018938	AG	3	6	30779	30784	50 %	0 %	50 %	0 %	410501033
50	NC_018938	TC	3	6	31199	31204	0 %	50 %	0 %	50 %	410501033
51	NC_018938	AT	3	6	33563	33568	50 %	50 %	0 %	0 %	410501036
52	NC_018938	GA	3	6	34737	34742	50 %	0 %	50 %	0 %	410501036
53	NC_018938	GC	4	8	34872	34879	0 %	0 %	50 %	50 %	410501036
54	NC_018938	TA	3	6	34958	34963	50 %	50 %	0 %	0 %	410501037
55	NC_018938	AG	3	6	35009	35014	50 %	0 %	50 %	0 %	410501037
56	NC_018938	CA	3	6	35190	35195	50 %	0 %	0 %	50 %	410501037
57	NC_018938	GC	3	6	36484	36489	0 %	0 %	50 %	50 %	410501039
58	NC_018938	GC	3	6	36743	36748	0 %	0 %	50 %	50 %	410501040
59	NC_018938	CT	3	6	36874	36879	0 %	50 %	0 %	50 %	410501040
60	NC_018938	TG	3	6	36987	36992	0 %	50 %	50 %	0 %	410501040
61	NC_018938	TG	3	6	37071	37076	0 %	50 %	50 %	0 %	410501040
62	NC_018938	GA	3	6	38102	38107	50 %	0 %	50 %	0 %	410501041
63	NC_018938	CT	3	6	39210	39215	0 %	50 %	0 %	50 %	410501042
64	NC_018938	CT	3	6	39282	39287	0 %	50 %	0 %	50 %	410501042
65	NC_018938	AG	3	6	40546	40551	50 %	0 %	50 %	0 %	410501043
66	NC_018938	AG	3	6	40629	40634	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018938	TG	3	6	40812	40817	0 %	50 %	50 %	0 %	410501044
68	NC_018938	AG	3	6	40893	40898	50 %	0 %	50 %	0 %	410501044
69	NC_018938	AG	3	6	42624	42629	50 %	0 %	50 %	0 %	410501045
70	NC_018938	AG	3	6	43602	43607	50 %	0 %	50 %	0 %	410501046
71	NC_018938	CT	3	6	43663	43668	0 %	50 %	0 %	50 %	410501046
72	NC_018938	GA	3	6	43866	43871	50 %	0 %	50 %	0 %	410501046
73	NC_018938	GT	3	6	44299	44304	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018938	GT	3	6	44343	44348	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018938	AG	4	8	44457	44464	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018938	CT	3	6	44924	44929	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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79	NC_018938	AG	3	6	47640	47645	50 %	0 %	50 %	0 %	410501049
80	NC_018938	TC	3	6	47963	47968	0 %	50 %	0 %	50 %	410501049
81	NC_018938	GT	3	6	48376	48381	0 %	50 %	50 %	0 %	410501050
82	NC_018938	TG	3	6	49479	49484	0 %	50 %	50 %	0 %	410501051
83	NC_018938	GT	3	6	50239	50244	0 %	50 %	50 %	0 %	410501052
84	NC_018938	CT	5	10	50599	50608	0 %	50 %	0 %	50 %	410501052
85	NC_018938	TA	3	6	50780	50785	50 %	50 %	0 %	0 %	410501052
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88	NC_018938	TA	3	6	52793	52798	50 %	50 %	0 %	0 %	410501055
89	NC_018938	TG	3	6	52845	52850	0 %	50 %	50 %	0 %	410501055
90	NC_018938	AG	4	8	52883	52890	50 %	0 %	50 %	0 %	410501055
91	NC_018938	AT	3	6	53298	53303	50 %	50 %	0 %	0 %	410501055
92	NC_018938	TA	3	6	54645	54650	50 %	50 %	0 %	0 %	410501056
93	NC_018938	CT	3	6	54785	54790	0 %	50 %	0 %	50 %	410501056
94	NC_018938	CT	3	6	55213	55218	0 %	50 %	0 %	50 %	410501056
95	NC_018938	TC	3	6	57043	57048	0 %	50 %	0 %	50 %	410501057
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99	NC_018938	TC	3	6	62123	62128	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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102	NC_018938	AG	3	6	63949	63954	50 %	0 %	50 %	0 %	410501061
103	NC_018938	CT	3	6	64653	64658	0 %	50 %	0 %	50 %	410501062
104	NC_018938	AG	3	6	64679	64684	50 %	0 %	50 %	0 %	410501062
105	NC_018938	AG	4	8	65082	65089	50 %	0 %	50 %	0 %	410501062
106	NC_018938	GA	4	8	66159	66166	50 %	0 %	50 %	0 %	410501062
107	NC_018938	TC	3	6	66285	66290	0 %	50 %	0 %	50 %	410501062
108	NC_018938	AC	3	6	66319	66324	50 %	0 %	0 %	50 %	410501062
109	NC_018938	AG	3	6	67115	67120	50 %	0 %	50 %	0 %	410501064
110	NC_018938	AG	3	6	67267	67272	50 %	0 %	50 %	0 %	410501064
111	NC_018938	GA	3	6	67550	67555	50 %	0 %	50 %	0 %	410501065
112	NC_018938	GA	3	6	68723	68728	50 %	0 %	50 %	0 %	410501065
113	NC_018938	AC	3	6	68750	68755	50 %	0 %	0 %	50 %	410501065
114	NC_018938	AG	3	6	69609	69614	50 %	0 %	50 %	0 %	410501068
115	NC_018938	TA	3	6	69823	69828	50 %	50 %	0 %	0 %	410501068
116	NC_018938	GT	3	6	70540	70545	0 %	50 %	50 %	0 %	410501068
117	NC_018938	AG	3	6	72190	72195	50 %	0 %	50 %	0 %	410501069
118	NC_018938	GC	3	6	72373	72378	0 %	0 %	50 %	50 %	410501069
119	NC_018938	CT	3	6	73249	73254	0 %	50 %	0 %	50 %	410501070
120	NC_018938	AG	3	6	73978	73983	50 %	0 %	50 %	0 %	410501071
121	NC_018938	GA	3	6	74572	74577	50 %	0 %	50 %	0 %	410501072
122	NC_018938	AG	3	6	75481	75486	50 %	0 %	50 %	0 %	410501074
123	NC_018938	TG	3	6	76491	76496	0 %	50 %	50 %	0 %	410501075
124	NC_018938	TG	4	8	76829	76836	0 %	50 %	50 %	0 %	410501075
125	NC_018938	TC	3	6	77080	77085	0 %	50 %	0 %	50 %	410501075
126	NC_018938	GC	3	6	81409	81414	0 %	0 %	50 %	50 %	410501080
127	NC_018938	TA	4	8	81807	81814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018938	GT	3	6	82096	82101	0 %	50 %	50 %	0 %	410501081
129	NC_018938	AC	3	6	82923	82928	50 %	0 %	0 %	50 %	410501082
130	NC_018938	GA	3	6	83855	83860	50 %	0 %	50 %	0 %	410501082
131	NC_018938	TC	3	6	84144	84149	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_018938	GA	3	6	87058	87063	50 %	0 %	50 %	0 %	410501085
133	NC_018938	GC	3	6	88141	88146	0 %	0 %	50 %	50 %	410501085
134	NC_018938	AG	3	6	88406	88411	50 %	0 %	50 %	0 %	410501085
135	NC_018938	CA	3	6	88633	88638	50 %	0 %	0 %	50 %	410501085
136	NC_018938	AG	3	6	88750	88755	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018938	AG	3	6	88778	88783	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018938	AG	3	6	90418	90423	50 %	0 %	50 %	0 %	410501089
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140	NC_018938	TC	3	6	92145	92150	0 %	50 %	0 %	50 %	410501090
141	NC_018938	CT	3	6	92754	92759	0 %	50 %	0 %	50 %	410501090
142	NC_018938	TG	3	6	94898	94903	0 %	50 %	50 %	0 %	410501091
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144	NC_018938	CA	3	6	95337	95342	50 %	0 %	0 %	50 %	410501092
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