MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Rif2 chromosome

Total Repeats: 289

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018938	GA	11	22	7221	7242	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018938	CA	3	6	16681	16686	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_018938	GC	3	6	23091	23096	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_018938	GT	3	6	25516	25521	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018938	TA	3	6	27502	27507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018938	AG	3	6	40629	40634	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018938	GT	3	6	44299	44304	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018938	GT	3	6	44343	44348	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018938	AG	4	8	44457	44464	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018938	CT	3	6	44924	44929	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_018938	TC	3	6	62123	62128	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_018938	TA	4	8	81807	81814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018938	TC	3	6	84144	84149	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_018938	AG	3	6	88750	88755	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018938	AG	3	6	88778	88783	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018938	AG	3	6	97174	97179	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018938	TA	3	6	97222	97227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018938	TA	3	6	100508	100513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018938	TA	3	6	129149	129154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018938	TA	4	8	130816	130823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018938	AT	3	6	132282	132287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018938	AG	3	6	140383	140388	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018938	GA	4	8	141698	141705	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018938	GA	3	6	146752	146757	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018938	TG	3	6	168840	168845	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018938	CT	3	6	169847	169852	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_018938	TG	3	6	170070	170075	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018938	TC	3	6	172459	172464	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_018938	CT	3	6	173269	173274	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_018938	AC	3	6	181851	181856	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_018938	AT	3	6	187933	187938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018938	GA	3	6	187939	187944	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018938	AG	3	6	193163	193168	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018938	CT	3	6	193181	193186	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_018938	CT	3	6	193197	193202	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_018938	TA	3	6	208492	208497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018938	GC	3	6	216146	216151	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_018938	TG	3	6	230964	230969	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018938	CT	3	6	233674	233679	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_018938	AG	3	6	234958	234963	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018938	GT	3	6	238603	238608	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018938	GA	3	6	244461	244466	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018938	TG	3	6	244712	244717	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018938	CT	3	6	255192	255197	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_018938	AT	3	6	270964	270969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018938	GA	3	6	297974	297979	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018938	AG	3	6	331803	331808	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018938	TG	3	6	334262	334267	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018938	AG	3	6	340782	340787	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018938	TC	3	6	349372	349377	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_018938	TC	4	8	351526	351533	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_018938	TC	4	8	351536	351543	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_018938	AT	3	6	380880	380885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018938	AC	3	6	380916	380921	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_018938	CT	3	6	395103	395108	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_018938	TA	3	6	397620	397625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018938	GA	3	6	399884	399889	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018938	AG	3	6	445369	445374	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018938	AG	3	6	445489	445494	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018938	AT	3	6	446173	446178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018938	TG	3	6	446385	446390	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018938	AT	3	6	446625	446630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018938	TG	3	6	447733	447738	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018938	AC	3	6	448054	448059	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_018938	TG	3	6	448157	448162	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018938	AG	3	6	448278	448283	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018938	AT	3	6	452266	452271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018938	TG	3	6	452580	452585	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018938	GA	3	6	453596	453601	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018938	GA	3	6	453790	453795	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018938	CA	3	6	454061	454066	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_018938	AG	3	6	454149	454154	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018938	CA	3	6	466599	466604	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_018938	AG	3	6	466780	466785	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018938	AG	4	8	467575	467582	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018938	AG	3	6	468333	468338	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018938	AG	3	6	468371	468376	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018938	TC	3	6	468453	468458	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_018938	AG	3	6	468512	468517	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018938	GA	3	6	469833	469838	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018938	AC	3	6	474078	474083	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_018938	AT	3	6	474348	474353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018938	GA	3	6	474533	474538	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018938	AG	3	6	474810	474815	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018938	TG	3	6	479558	479563	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018938	AT	4	8	494160	494167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018938	GT	4	8	507980	507987	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018938	AG	3	6	507998	508003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018938	TA	3	6	509081	509086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018938	GA	3	6	530039	530044	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018938	TA	3	6	530693	530698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018938	AT	3	6	530863	530868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018938	TG	3	6	537526	537531	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018938	CT	3	6	538018	538023	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_018938	GA	3	6	547702	547707	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018938	CA	3	6	547758	547763	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_018938	GA	3	6	564035	564040	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018938	AG	4	8	564315	564322	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018938	AG	3	6	565945	565950	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018938	GA	3	6	567149	567154	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018938	AC	3	6	567730	567735	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_018938	GA	3	6	568041	568046	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018938	AC	4	8	579528	579535	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_018938	GT	3	6	579836	579841	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018938	AG	3	6	583752	583757	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018938	AG	3	6	583803	583808	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018938	AG	3	6	583839	583844	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018938	TC	3	6	584488	584493	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_018938	GA	4	8	591169	591176	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018938	AG	3	6	591333	591338	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018938	AC	3	6	591457	591462	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_018938	AC	3	6	596990	596995	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_018938	AT	3	6	600061	600066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018938	AG	3	6	605764	605769	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018938	AT	3	6	629804	629809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018938	GC	3	6	648040	648045	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_018938	CA	3	6	651080	651085	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_018938	TG	4	8	651154	651161	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018938	TC	3	6	652815	652820	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_018938	TC	3	6	653271	653276	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_018938	AG	3	6	653695	653700	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018938	CT	3	6	684776	684781	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_018938	TA	3	6	699485	699490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018938	CT	3	6	700747	700752	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_018938	TA	3	6	715040	715045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018938	AG	3	6	716230	716235	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018938	TA	3	6	739407	739412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018938	TC	3	6	744839	744844	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_018938	AC	3	6	750271	750276	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_018938	TC	3	6	756645	756650	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_018938	TC	3	6	756814	756819	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_018938	CT	3	6	757213	757218	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_018938	AG	3	6	761276	761281	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018938	AG	3	6	762580	762585	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018938	AG	3	6	767616	767621	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018938	GC	3	6	768086	768091	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_018938	CT	8	16	774416	774431	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_018938	GA	3	6	792293	792298	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018938	AG	3	6	799003	799008	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018938	TG	3	6	799659	799664	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018938	CT	9	18	799718	799735	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_018938	CA	3	6	800203	800208	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_018938	CA	3	6	800216	800221	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_018938	AG	3	6	808895	808900	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018938	GA	3	6	834530	834535	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018938	TC	3	6	839445	839450	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_018938	CG	3	6	846882	846887	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_018938	AT	3	6	876862	876867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018938	AC	3	6	925476	925481	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_018938	AT	3	6	938294	938299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018938	TA	3	6	938312	938317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018938	AC	3	6	938425	938430	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_018938	TC	3	6	938455	938460	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.