MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori Rif1 chromosome

Total Repeats: 4725

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018937	TGAG	2	8	233	240	25 %	25 %	50 %	0 %	410023237
2	NC_018937	CATT	2	8	320	327	25 %	50 %	0 %	25 %	410023237
3	NC_018937	GTTG	2	8	507	514	0 %	50 %	50 %	0 %	410023237
4	NC_018937	TCTG	2	8	1016	1023	0 %	50 %	25 %	25 %	410023238
5	NC_018937	AAAT	2	8	1118	1125	75 %	25 %	0 %	0 %	410023239
6	NC_018937	GCTT	2	8	1661	1668	0 %	50 %	25 %	25 %	410023239
7	NC_018937	CCTG	2	8	2016	2023	0 %	25 %	25 %	50 %	410023240
8	NC_018937	CCAA	2	8	2040	2047	50 %	0 %	0 %	50 %	410023240
9	NC_018937	ATTC	2	8	2057	2064	25 %	50 %	0 %	25 %	410023240
10	NC_018937	TGAA	2	8	2080	2087	50 %	25 %	25 %	0 %	410023240
11	NC_018937	ATTC	2	8	2555	2562	25 %	50 %	0 %	25 %	410023240
12	NC_018937	GTTT	2	8	2633	2640	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018937	TCTT	2	8	2763	2770	0 %	75 %	0 %	25 %	410023241
14	NC_018937	CAAA	2	8	3306	3313	75 %	0 %	0 %	25 %	410023241
15	NC_018937	GAAA	2	8	3528	3535	75 %	0 %	25 %	0 %	410023242
16	NC_018937	ATGC	2	8	4486	4493	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_018937	TAAA	2	8	4891	4898	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018937	TCGC	2	8	5377	5384	0 %	25 %	25 %	50 %	410023244
19	NC_018937	ATTC	2	8	5406	5413	25 %	50 %	0 %	25 %	410023244
20	NC_018937	CATT	2	8	5450	5457	25 %	50 %	0 %	25 %	410023244
21	NC_018937	ATCG	2	8	7008	7015	25 %	25 %	25 %	25 %	410023244
22	NC_018937	CGTT	2	8	7043	7050	0 %	50 %	25 %	25 %	410023244
23	NC_018937	TTGA	2	8	7056	7063	25 %	50 %	25 %	0 %	410023244
24	NC_018937	TAAG	2	8	7306	7313	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018937	GTTT	2	8	7399	7406	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018937	AGCG	2	8	7497	7504	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_018937	TTCA	2	8	7849	7856	25 %	50 %	0 %	25 %	410023245
28	NC_018937	ATAA	2	8	9645	9652	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018937	TATT	2	8	9845	9852	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018937	ATTC	2	8	9860	9867	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_018937	TCAA	2	8	10056	10063	50 %	25 %	0 %	25 %	410023247
32	NC_018937	TTTG	2	8	10876	10883	0 %	75 %	25 %	0 %	410023247
33	NC_018937	GTTT	2	8	10972	10979	0 %	75 %	25 %	0 %	410023247
34	NC_018937	GCTC	2	8	11499	11506	0 %	25 %	25 %	50 %	410023247
35	NC_018937	CGCT	2	8	12366	12373	0 %	25 %	25 %	50 %	410023248
36	NC_018937	GCCG	2	8	12511	12518	0 %	0 %	50 %	50 %	410023248
37	NC_018937	TGCA	2	8	12725	12732	25 %	25 %	25 %	25 %	410023249
38	NC_018937	AGCA	2	8	12780	12787	50 %	0 %	25 %	25 %	410023249
39	NC_018937	GTTT	2	8	13138	13145	0 %	75 %	25 %	0 %	410023249
40	NC_018937	TCTT	2	8	13525	13532	0 %	75 %	0 %	25 %	410023249
41	NC_018937	TTAA	2	8	13674	13681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018937	AGCG	2	8	13997	14004	25 %	0 %	50 %	25 %	410023251
43	NC_018937	GATT	2	8	14105	14112	25 %	50 %	25 %	0 %	410023251
44	NC_018937	CAAA	2	8	14274	14281	75 %	0 %	0 %	25 %	410023252
45	NC_018937	CACT	2	8	14643	14650	25 %	25 %	0 %	50 %	410023252
46	NC_018937	ATGC	2	8	14689	14696	25 %	25 %	25 %	25 %	410023252
47	NC_018937	TTTA	2	8	15276	15283	25 %	75 %	0 %	0 %	410023252
48	NC_018937	CAGG	2	8	16434	16441	25 %	0 %	50 %	25 %	410023252
49	NC_018937	TGAT	2	8	16478	16485	25 %	50 %	25 %	0 %	410023252
50	NC_018937	AGTT	2	8	16620	16627	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018937	CGAA	2	8	17299	17306	50 %	0 %	25 %	25 %	410023253
52	NC_018937	CTTA	2	8	17474	17481	25 %	50 %	0 %	25 %	410023253
53	NC_018937	GTTT	2	8	18248	18255	0 %	75 %	25 %	0 %	410023253
54	NC_018937	TTGA	2	8	18602	18609	25 %	50 %	25 %	0 %	410023254
55	NC_018937	TGCT	2	8	18978	18985	0 %	50 %	25 %	25 %	410023254
56	NC_018937	CTTG	2	8	19452	19459	0 %	50 %	25 %	25 %	410023255
57	NC_018937	TAAA	2	8	20656	20663	75 %	25 %	0 %	0 %	410023256
58	NC_018937	GCGA	2	8	20665	20672	25 %	0 %	50 %	25 %	410023256
59	NC_018937	CTTT	2	8	21522	21529	0 %	75 %	0 %	25 %	410023257
60	NC_018937	AAGT	2	8	21834	21841	50 %	25 %	25 %	0 %	410023257
61	NC_018937	GCTT	2	8	21961	21968	0 %	50 %	25 %	25 %	410023257
62	NC_018937	CTTT	2	8	22593	22600	0 %	75 %	0 %	25 %	410023257
63	NC_018937	ATCA	2	8	22732	22739	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_018937	TTTA	2	8	22777	22784	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018937	GTTG	2	8	22836	22843	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018937	CTTG	2	8	23121	23128	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_018937	TTTG	2	8	23229	23236	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018937	GTTT	2	8	23794	23801	0 %	75 %	25 %	0 %	410023259
69	NC_018937	CTGG	2	8	24811	24818	0 %	25 %	50 %	25 %	410023259
70	NC_018937	GCAA	2	8	24995	25002	50 %	0 %	25 %	25 %	410023259
71	NC_018937	ATTA	2	8	25583	25590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018937	CGCT	2	8	25977	25984	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_018937	GACA	2	8	27350	27357	50 %	0 %	25 %	25 %	410023260
74	NC_018937	GCTC	2	8	28324	28331	0 %	25 %	25 %	50 %	410023261
75	NC_018937	ATGG	2	8	28772	28779	25 %	25 %	50 %	0 %	410023261
76	NC_018937	GAAT	2	8	29034	29041	50 %	25 %	25 %	0 %	410023262
77	NC_018937	AATC	2	8	29227	29234	50 %	25 %	0 %	25 %	410023262
78	NC_018937	TTTA	2	8	29410	29417	25 %	75 %	0 %	0 %	410023262
79	NC_018937	GAGT	2	8	30242	30249	25 %	25 %	50 %	0 %	410023264
80	NC_018937	TCAA	2	8	30264	30271	50 %	25 %	0 %	25 %	410023264
81	NC_018937	TGCT	2	8	30296	30303	0 %	50 %	25 %	25 %	410023264
82	NC_018937	AGCA	2	8	30413	30420	50 %	0 %	25 %	25 %	410023264
83	NC_018937	CAAT	2	8	30427	30434	50 %	25 %	0 %	25 %	410023264
84	NC_018937	CAAT	2	8	30937	30944	50 %	25 %	0 %	25 %	410023264
85	NC_018937	GAAA	2	8	31372	31379	75 %	0 %	25 %	0 %	410023264
86	NC_018937	GGTT	2	8	31950	31957	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018937	TTTA	2	8	32084	32091	25 %	75 %	0 %	0 %	410023265
88	NC_018937	CAGA	2	8	32120	32127	50 %	0 %	25 %	25 %	410023265
89	NC_018937	TGAT	2	8	32229	32236	25 %	50 %	25 %	0 %	410023265
90	NC_018937	ATTG	2	8	32272	32279	25 %	50 %	25 %	0 %	410023265
91	NC_018937	GCGA	2	8	32282	32289	25 %	0 %	50 %	25 %	410023265
92	NC_018937	ACCC	2	8	32422	32429	25 %	0 %	0 %	75 %	410023266
93	NC_018937	CATC	2	8	32548	32555	25 %	25 %	0 %	50 %	410023266
94	NC_018937	TCAA	2	8	32690	32697	50 %	25 %	0 %	25 %	410023267
95	NC_018937	CATG	2	8	33813	33820	25 %	25 %	25 %	25 %	410023267
96	NC_018937	GAAA	2	8	33921	33928	75 %	0 %	25 %	0 %	410023267
97	NC_018937	CGCT	2	8	33929	33936	0 %	25 %	25 %	50 %	410023267
98	NC_018937	TCAT	2	8	34754	34761	25 %	50 %	0 %	25 %	410023267
99	NC_018937	GCTT	2	8	34828	34835	0 %	50 %	25 %	25 %	410023267
100	NC_018937	GAAA	2	8	34887	34894	75 %	0 %	25 %	0 %	410023267
101	NC_018937	ATGA	2	8	35168	35175	50 %	25 %	25 %	0 %	410023268
102	NC_018937	TTGT	2	8	36763	36770	0 %	75 %	25 %	0 %	410023271
103	NC_018937	CTTT	2	8	36910	36917	0 %	75 %	0 %	25 %	410023271
104	NC_018937	AATA	2	8	37587	37594	75 %	25 %	0 %	0 %	410023271
105	NC_018937	TAAA	2	8	37609	37616	75 %	25 %	0 %	0 %	410023271
106	NC_018937	GAAA	2	8	37740	37747	75 %	0 %	25 %	0 %	410023272
107	NC_018937	TTTG	2	8	38370	38377	0 %	75 %	25 %	0 %	410023272
108	NC_018937	TGAT	2	8	38469	38476	25 %	50 %	25 %	0 %	410023272
109	NC_018937	CGAA	2	8	38554	38561	50 %	0 %	25 %	25 %	410023273
110	NC_018937	TGAT	2	8	38854	38861	25 %	50 %	25 %	0 %	410023273
111	NC_018937	ATTG	2	8	40251	40258	25 %	50 %	25 %	0 %	410023274
112	NC_018937	ATTG	2	8	40317	40324	25 %	50 %	25 %	0 %	410023274
113	NC_018937	ATCA	2	8	40426	40433	50 %	25 %	0 %	25 %	410023274
114	NC_018937	TGTT	2	8	41213	41220	0 %	75 %	25 %	0 %	410023275
115	NC_018937	AAAG	2	8	41533	41540	75 %	0 %	25 %	0 %	410023275
116	NC_018937	AAAC	2	8	41681	41688	75 %	0 %	0 %	25 %	410023275
117	NC_018937	CTTT	2	8	41806	41813	0 %	75 %	0 %	25 %	410023275
118	NC_018937	GAAA	2	8	42107	42114	75 %	0 %	25 %	0 %	410023276
119	NC_018937	GATC	2	8	42236	42243	25 %	25 %	25 %	25 %	410023276
120	NC_018937	ATGA	2	8	43243	43250	50 %	25 %	25 %	0 %	410023276
121	NC_018937	TGTT	2	8	43360	43367	0 %	75 %	25 %	0 %	410023277
122	NC_018937	ATGA	2	8	43459	43466	50 %	25 %	25 %	0 %	410023277
123	NC_018937	AACG	2	8	43635	43642	50 %	0 %	25 %	25 %	410023277
124	NC_018937	CAAA	2	8	44082	44089	75 %	0 %	0 %	25 %	410023277
125	NC_018937	CAAA	2	8	44267	44274	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_018937	AAAC	2	8	44437	44444	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_018937	ATCT	2	8	44481	44488	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_018937	CTGT	2	8	44542	44549	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_018937	AAAT	2	8	44643	44650	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018937	GATT	2	8	44732	44739	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018937	TCTA	2	8	44782	44789	25 %	50 %	0 %	25 %	410023278
132	NC_018937	TTGA	2	8	45215	45222	25 %	50 %	25 %	0 %	410023279
133	NC_018937	AAAC	2	8	45229	45236	75 %	0 %	0 %	25 %	410023279
134	NC_018937	CGCT	2	8	45370	45377	0 %	25 %	25 %	50 %	410023279
135	NC_018937	TCAA	2	8	45981	45988	50 %	25 %	0 %	25 %	410023279
136	NC_018937	GTTT	2	8	45992	45999	0 %	75 %	25 %	0 %	410023279
137	NC_018937	CAAA	2	8	46488	46495	75 %	0 %	0 %	25 %	410023280
138	NC_018937	CGCT	2	8	46836	46843	0 %	25 %	25 %	50 %	410023280
139	NC_018937	TCGC	2	8	47303	47310	0 %	25 %	25 %	50 %	410023280
140	NC_018937	AGGG	2	8	47314	47321	25 %	0 %	75 %	0 %	410023280
141	NC_018937	TTCC	2	8	47624	47631	0 %	50 %	0 %	50 %	410023280
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