MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Rif1 chromosome

Total Repeats: 614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018937	GTTT	2	8	2633	2640	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018937	ATGC	2	8	4486	4493	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_018937	TAAA	2	8	4891	4898	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018937	TAAG	2	8	7306	7313	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018937	GTTT	2	8	7399	7406	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018937	AGCG	2	8	7497	7504	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_018937	ATAA	2	8	9645	9652	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018937	TATT	2	8	9845	9852	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018937	ATTC	2	8	9860	9867	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_018937	TTAA	2	8	13674	13681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018937	AGTT	2	8	16620	16627	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018937	ATCA	2	8	22732	22739	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_018937	TTTA	2	8	22777	22784	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018937	GTTG	2	8	22836	22843	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018937	CTTG	2	8	23121	23128	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_018937	TTTG	2	8	23229	23236	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018937	ATTA	2	8	25583	25590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018937	CGCT	2	8	25977	25984	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_018937	GGTT	2	8	31950	31957	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018937	CAAA	2	8	44267	44274	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_018937	AAAC	2	8	44437	44444	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_018937	ATCT	2	8	44481	44488	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_018937	CTGT	2	8	44542	44549	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_018937	AAAT	2	8	44643	44650	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018937	GATT	2	8	44732	44739	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018937	TTTA	2	8	61309	61316	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018937	TAAT	2	8	61409	61416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018937	ACAA	2	8	61601	61608	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_018937	GGGA	2	8	61854	61861	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018937	CTGA	2	8	62280	62287	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_018937	CTAA	2	8	62322	62329	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_018937	AAGC	2	8	62349	62356	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_018937	CTAA	2	8	62406	62413	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_018937	CTGA	2	8	62511	62518	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_018937	CTAA	2	8	62553	62560	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_018937	AAGC	2	8	62580	62587	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_018937	CAAA	2	8	75348	75355	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_018937	TAGA	2	8	80146	80153	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018937	ATTT	2	8	81838	81845	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018937	AACT	2	8	86258	86265	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_018937	CCAA	2	8	86290	86297	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_018937	CGTT	2	8	86585	86592	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_018937	TTTG	2	8	89749	89756	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018937	TCAA	2	8	94999	95006	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_018937	AAAC	2	8	95182	95189	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_018937	GGTG	2	8	96964	96971	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018937	TCCC	2	8	97034	97041	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
48	NC_018937	TTCA	2	8	102367	102374	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_018937	AACA	2	8	110855	110862	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_018937	AACA	2	8	115431	115438	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_018937	GATC	2	8	115513	115520	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_018937	CCGC	2	8	116331	116338	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
53	NC_018937	CTTT	2	8	118234	118241	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_018937	AAAT	2	8	118244	118251	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018937	GCTT	2	8	119975	119982	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_018937	TCAT	2	8	124618	124625	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_018937	ACTG	2	8	129320	129327	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_018937	ACTG	2	8	130990	130997	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_018937	GATT	2	8	132321	132328	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018937	TATT	2	8	132329	132336	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018937	GTTA	2	8	134929	134936	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018937	AAAG	2	8	137833	137840	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018937	AAAG	2	8	138328	138335	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018937	GAAG	2	8	138385	138392	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018937	ATTG	2	8	139451	139458	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018937	AATC	2	8	139558	139565	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_018937	CTAT	2	8	140168	140175	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_018937	GAAT	2	8	141608	141615	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018937	AAGC	2	8	141945	141952	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_018937	AAAC	2	8	142160	142167	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_018937	CTTT	2	8	142175	142182	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_018937	ATTT	2	8	144929	144936	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018937	TAAG	2	8	150291	150298	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018937	TGCA	2	8	156323	156330	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_018937	ATTT	2	8	168775	168782	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018937	AATA	2	8	170205	170212	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018937	CACT	2	8	181396	181403	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_018937	GATT	2	8	181464	181471	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018937	GATT	2	8	187798	187805	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018937	GTTT	2	8	187896	187903	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018937	CATT	2	8	193008	193015	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_018937	TTTG	2	8	193027	193034	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018937	TGCA	2	8	194908	194915	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_018937	CAAT	2	8	203604	203611	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_018937	TAAG	2	8	205264	205271	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018937	CAAC	2	8	208578	208585	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_018937	AAAC	2	8	208778	208785	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_018937	GTTT	2	8	214684	214691	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018937	CTTA	2	8	219070	219077	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_018937	TGTT	2	8	219079	219086	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018937	TATT	2	8	227667	227674	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018937	ATTT	2	8	233642	233649	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018937	AAAC	2	8	234938	234945	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_018937	GAAA	2	8	237294	237301	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018937	TTTA	2	8	240205	240212	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018937	AGCG	2	8	244419	244426	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_018937	CATT	2	8	258739	258746	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_018937	TAAT	2	8	261409	261416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018937	AAAG	2	8	261454	261461	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018937	ATGA	2	8	271692	271699	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018937	TTTA	2	8	271707	271714	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018937	AACA	2	8	314649	314656	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_018937	TTAA	2	8	315478	315485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018937	GTTT	2	8	322982	322989	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018937	AATG	2	8	323150	323157	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018937	TGAA	2	8	330240	330247	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018937	AAAG	2	8	331552	331559	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018937	TTGG	2	8	337084	337091	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018937	TTTG	2	8	337094	337101	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018937	TTGG	2	8	339358	339365	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018937	CGCA	2	8	342039	342046	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_018937	AAAT	2	8	345509	345516	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018937	AAAC	2	8	349345	349352	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_018937	AAAT	2	8	349651	349658	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018937	AATC	2	8	351501	351508	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_018937	GTTT	2	8	352301	352308	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018937	AGTG	2	8	352407	352414	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018937	GAGT	2	8	352749	352756	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018937	AATG	2	8	353154	353161	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018937	TGAA	2	8	358288	358295	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018937	TAAT	2	8	367007	367014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018937	ATTT	2	8	367110	367117	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018937	TGCG	2	8	374811	374818	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_018937	TCTA	2	8	376755	376762	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_018937	ACAA	2	8	380852	380859	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_018937	ATTT	2	8	384214	384221	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018937	TAAA	2	8	393670	393677	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018937	AAAT	2	8	411110	411117	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018937	CTAA	2	8	425478	425485	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_018937	TCTG	2	8	425922	425929	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_018937	ATAA	2	8	427559	427566	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018937	TTTA	2	8	439274	439281	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018937	TCAA	2	8	444614	444621	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_018937	TTTA	3	12	444762	444773	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018937	TTTA	3	12	444778	444789	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018937	TTTA	3	12	444794	444805	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018937	TTTA	3	12	444810	444821	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018937	TTTA	3	12	444826	444837	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018937	TTTC	2	8	444890	444897	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_018937	TTTC	2	8	444909	444916	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_018937	CAAG	2	8	445017	445024	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_018937	GCGA	2	8	445561	445568	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_018937	CAAA	2	8	446137	446144	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_018937	GGTG	2	8	446298	446305	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018937	AATC	2	8	446310	446317	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_018937	AAAG	2	8	446434	446441	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018937	AGCT	2	8	446791	446798	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_018937	TCCC	2	8	447089	447096	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
149	NC_018937	CAGG	2	8	447544	447551	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_018937	AGCC	2	8	447663	447670	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
151	NC_018937	AATG	2	8	448980	448987	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018937	ATGA	2	8	449823	449830	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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