MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori Rif1 chromosome

Total Repeats: 16817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018937	CAT	2	6	185	190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018937	GAT	3	9	328	336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410023237
3	NC_018937	TTC	2	6	562	567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023237
4	NC_018937	ACA	2	6	588	593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410023237
5	NC_018937	CAA	2	6	662	667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410023238
6	NC_018937	AAT	2	6	903	908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410023238
7	NC_018937	CTT	2	6	1006	1011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023238
8	NC_018937	TGA	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410023238
9	NC_018937	AAC	2	6	1230	1235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410023239
10	NC_018937	CCG	3	9	1249	1257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410023239
11	NC_018937	CCA	2	6	1393	1398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410023239
12	NC_018937	GCT	2	6	1418	1423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410023239
13	NC_018937	GGC	2	6	1609	1614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410023239
14	NC_018937	GTT	2	6	1829	1834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410023239
15	NC_018937	CTT	2	6	1863	1868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023239
16	NC_018937	ATG	2	6	2029	2034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410023240
17	NC_018937	GTT	2	6	2103	2108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410023240
18	NC_018937	CTT	2	6	2192	2197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023240
19	NC_018937	TGG	2	6	2249	2254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410023240
20	NC_018937	TCA	2	6	2257	2262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410023240
21	NC_018937	TGA	2	6	2868	2873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410023241
22	NC_018937	AGC	2	6	2983	2988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410023241
23	NC_018937	GTG	2	6	3172	3177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410023241
24	NC_018937	GTG	2	6	3331	3336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410023241
25	NC_018937	GCC	2	6	3338	3343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410023241
26	NC_018937	TTG	2	6	3422	3427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410023242
27	NC_018937	GAA	2	6	3454	3459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410023242
28	NC_018937	GTT	2	6	3784	3789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410023242
29	NC_018937	CAG	2	6	4030	4035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410023242
30	NC_018937	ATT	2	6	4112	4117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410023242
31	NC_018937	TGT	2	6	4123	4128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410023242
32	NC_018937	TGG	2	6	4181	4186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410023242
33	NC_018937	GGT	2	6	4291	4296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018937	TAT	2	6	4339	4344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018937	TGG	2	6	4382	4387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018937	TGG	2	6	4502	4507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018937	GTG	2	6	4618	4623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018937	ACC	2	6	4650	4655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_018937	GGT	2	6	4663	4668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018937	AAT	2	6	4823	4828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018937	TAT	2	6	4959	4964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410023243
42	NC_018937	TTA	2	6	5014	5019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410023243
43	NC_018937	ATT	2	6	5472	5477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410023244
44	NC_018937	TGG	2	6	5570	5575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410023244
45	NC_018937	ATA	2	6	5691	5696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410023244
46	NC_018937	TCT	2	6	5709	5714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023244
47	NC_018937	GTT	2	6	5772	5777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410023244
48	NC_018937	TAA	2	6	5841	5846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410023244
49	NC_018937	TTA	2	6	5899	5904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410023244
50	NC_018937	GTG	2	6	5968	5973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410023244
51	NC_018937	GTT	2	6	5988	5993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410023244
52	NC_018937	CAA	2	6	6036	6041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410023244
53	NC_018937	AGT	2	6	6200	6205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410023244
54	NC_018937	CAG	2	6	6320	6325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410023244
55	NC_018937	GTT	2	6	6372	6377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410023244
56	NC_018937	CTT	2	6	6566	6571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023244
57	NC_018937	TAG	8	24	6593	6616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410023244
58	NC_018937	TTA	2	6	6625	6630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410023244
59	NC_018937	TGT	2	6	6645	6650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410023244
60	NC_018937	TTG	2	6	6717	6722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410023244
61	NC_018937	GTT	2	6	6786	6791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410023244
62	NC_018937	CCG	2	6	6920	6925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410023244
63	NC_018937	GCT	2	6	7035	7040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410023244
64	NC_018937	GTT	2	6	7065	7070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410023244
65	NC_018937	GGT	2	6	7408	7413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018937	GAT	2	6	7579	7584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018937	CAT	2	6	7606	7611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410023245
68	NC_018937	TCT	2	6	7673	7678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023245
69	NC_018937	AAT	2	6	7771	7776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410023245
70	NC_018937	CTT	2	6	7779	7784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023245
71	NC_018937	CAT	2	6	7869	7874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410023245
72	NC_018937	ATG	2	6	7922	7927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410023245
73	NC_018937	TCA	2	6	7946	7951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410023245
74	NC_018937	CCG	2	6	8000	8005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410023245
75	NC_018937	CTT	2	6	8019	8024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023245
76	NC_018937	CAT	2	6	8052	8057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410023245
77	NC_018937	CAT	2	6	8223	8228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410023245
78	NC_018937	GTG	2	6	8255	8260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410023245
79	NC_018937	TTC	2	6	8335	8340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023245
80	NC_018937	TAA	2	6	8343	8348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410023245
81	NC_018937	CCG	2	6	8354	8359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410023245
82	NC_018937	CAC	2	6	8455	8460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410023245
83	NC_018937	GAT	2	6	8497	8502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410023245
84	NC_018937	TAG	2	6	8536	8541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410023245
85	NC_018937	ACA	2	6	8678	8683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410023245
86	NC_018937	CTT	2	6	8709	8714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023245
87	NC_018937	TCT	2	6	8819	8824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023245
88	NC_018937	TAA	2	6	8862	8867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410023245
89	NC_018937	CTT	2	6	8940	8945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023245
90	NC_018937	GCA	2	6	8993	8998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410023245
91	NC_018937	CTT	2	6	9018	9023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023245
92	NC_018937	TAA	3	9	9254	9262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018937	ACA	2	6	9340	9345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410023246
94	NC_018937	TCT	2	6	9374	9379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023246
95	NC_018937	CTT	2	6	9456	9461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023246
96	NC_018937	GAT	3	9	9544	9552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410023246
97	NC_018937	TCT	2	6	9572	9577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023246
98	NC_018937	CTA	2	6	9588	9593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410023246
99	NC_018937	TTA	2	6	9675	9680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018937	TAA	2	6	9735	9740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018937	ATT	2	6	9754	9759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018937	TTA	2	6	9818	9823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018937	GAA	2	6	9895	9900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018937	TTG	2	6	10015	10020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410023247
105	NC_018937	GAA	2	6	10031	10036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410023247
106	NC_018937	TTA	2	6	10210	10215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410023247
107	NC_018937	AGA	2	6	10225	10230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410023247
108	NC_018937	ACC	2	6	10233	10238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410023247
109	NC_018937	AAG	2	6	10266	10271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410023247
110	NC_018937	ATT	2	6	10299	10304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410023247
111	NC_018937	CAT	2	6	10480	10485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410023247
112	NC_018937	GTG	2	6	10514	10519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410023247
113	NC_018937	ATG	2	6	10794	10799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410023247
114	NC_018937	AGG	2	6	10859	10864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410023247
115	NC_018937	AAC	2	6	10886	10891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410023247
116	NC_018937	AGA	2	6	11272	11277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410023247
117	NC_018937	TTG	2	6	11285	11290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410023247
118	NC_018937	GAC	2	6	11372	11377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410023247
119	NC_018937	TTA	3	9	11393	11401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410023247
120	NC_018937	TTG	2	6	11450	11455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410023247
121	NC_018937	TGT	2	6	11636	11641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410023248
122	NC_018937	TGT	2	6	11804	11809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410023248
123	NC_018937	AAG	2	6	11963	11968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410023248
124	NC_018937	GGT	2	6	12049	12054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410023248
125	NC_018937	GTT	2	6	12078	12083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410023248
126	NC_018937	TTG	2	6	12140	12145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410023248
127	NC_018937	TGG	3	9	12374	12382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410023248
128	NC_018937	GAA	3	9	12391	12399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410023248
129	NC_018937	TGG	2	6	12473	12478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410023248
130	NC_018937	AGA	2	6	12495	12500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410023248
131	NC_018937	AGG	2	6	12717	12722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018937	TTA	2	6	12804	12809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410023249
133	NC_018937	GAA	2	6	12821	12826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410023249
134	NC_018937	GTT	2	6	12888	12893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410023249
135	NC_018937	ATT	2	6	12911	12916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410023249
136	NC_018937	CGC	2	6	13063	13068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410023249
137	NC_018937	AAT	2	6	13193	13198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410023249
138	NC_018937	ACC	2	6	13287	13292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410023249
139	NC_018937	GGT	2	6	13429	13434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410023249
140	NC_018937	AGA	2	6	13489	13494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410023249
141	NC_018937	ACC	2	6	13607	13612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_018937	ATA	2	6	13655	13660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018937	GTG	2	6	13915	13920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410023250
144	NC_018937	GAA	2	6	14006	14011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410023251
145	NC_018937	GAA	2	6	14332	14337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410023252
146	NC_018937	AAC	2	6	14338	14343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410023252
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151	NC_018937	TAG	2	6	14870	14875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410023252
152	NC_018937	ATT	2	6	14927	14932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410023252
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154	NC_018937	ACC	2	6	15365	15370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410023252
155	NC_018937	ATT	2	6	15488	15493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410023252
156	NC_018937	AAG	2	6	15521	15526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410023252
157	NC_018937	ATG	2	6	15625	15630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410023252
158	NC_018937	CTT	2	6	15795	15800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023252
159	NC_018937	AAG	2	6	15836	15841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410023252
160	NC_018937	ATG	2	6	16013	16018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410023252
161	NC_018937	TAT	2	6	16099	16104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410023252
162	NC_018937	AGA	2	6	16122	16127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410023252
163	NC_018937	GTG	3	9	16249	16257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410023252
164	NC_018937	GAG	2	6	16602	16607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410023252
165	NC_018937	CTG	2	6	16702	16707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_018937	TAT	2	6	16959	16964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410023253
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169	NC_018937	ATT	2	6	17230	17235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410023253
170	NC_018937	TAT	2	6	17331	17336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410023253
171	NC_018937	ACA	2	6	17431	17436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410023253
172	NC_018937	CGG	2	6	17485	17490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410023253
173	NC_018937	GTT	2	6	17507	17512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410023253
174	NC_018937	ATC	2	6	17643	17648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410023253
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177	NC_018937	TTG	2	6	17947	17952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410023253
178	NC_018937	AGC	2	6	18182	18187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410023253
179	NC_018937	ATA	2	6	18214	18219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410023253
180	NC_018937	CCA	2	6	18284	18289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
181	NC_018937	TTG	2	6	18443	18448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410023254
182	NC_018937	GTG	2	6	18509	18514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410023254
183	NC_018937	CAT	2	6	18535	18540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410023254
184	NC_018937	TAT	2	6	18626	18631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410023254
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187	NC_018937	ATT	2	6	19124	19129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410023254
188	NC_018937	TTC	2	6	19222	19227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023254
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192	NC_018937	ATT	2	6	19657	19662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410023255
193	NC_018937	TGG	2	6	20004	20009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410023255
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196	NC_018937	ATA	2	6	20087	20092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410023255
197	NC_018937	CTT	2	6	20201	20206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023255
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199	NC_018937	GGC	2	6	20338	20343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410023255
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250	NC_018937	TTA	2	6	25471	25476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
251	NC_018937	GTT	2	6	25684	25689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
252	NC_018937	TTG	2	6	25741	25746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
253	NC_018937	GGT	2	6	25852	25857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
254	NC_018937	TTC	2	6	26297	26302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023260
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256	NC_018937	GGC	2	6	26579	26584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410023260
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258	NC_018937	GTG	2	6	26718	26723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410023260
259	NC_018937	TCT	2	6	26889	26894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023260
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261	NC_018937	TCT	2	6	27135	27140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023260
262	NC_018937	AGA	2	6	27215	27220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410023260
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363	NC_018937	TGG	2	6	37274	37279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410023271
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365	NC_018937	CCA	2	6	37379	37384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410023271
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367	NC_018937	TCT	3	9	37462	37470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023271
368	NC_018937	TTA	2	6	37643	37648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
369	NC_018937	AGA	2	6	37779	37784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410023272
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376	NC_018937	AGA	2	6	38942	38947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410023273
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379	NC_018937	AGA	2	6	39044	39049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410023273
380	NC_018937	AGA	2	6	39053	39058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410023273
381	NC_018937	ATC	2	6	39518	39523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410023274
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