MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Rif1 chromosome

Total Repeats: 1835

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018937	CAT	2	6	185	190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018937	GGT	2	6	4291	4296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018937	TAT	2	6	4339	4344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018937	TGG	2	6	4382	4387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018937	TGG	2	6	4502	4507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018937	GTG	2	6	4618	4623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018937	ACC	2	6	4650	4655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_018937	GGT	2	6	4663	4668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018937	AAT	2	6	4823	4828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018937	GGT	2	6	7408	7413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018937	GAT	2	6	7579	7584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018937	TAA	3	9	9254	9262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018937	TTA	2	6	9675	9680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018937	TAA	2	6	9735	9740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018937	ATT	2	6	9754	9759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018937	TTA	2	6	9818	9823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018937	GAA	2	6	9895	9900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018937	AGG	2	6	12717	12722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018937	ACC	2	6	13607	13612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_018937	ATA	2	6	13655	13660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018937	CTG	2	6	16702	16707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018937	CCA	2	6	18284	18289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_018937	GGT	2	6	22807	22812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018937	TCA	2	6	22851	22856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018937	GGT	2	6	23129	23134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018937	TTA	2	6	25471	25476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018937	GTT	2	6	25684	25689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018937	TTG	2	6	25741	25746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018937	GGT	2	6	25852	25857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018937	TTA	2	6	37643	37648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018937	TAA	2	6	40609	40614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018937	TAA	2	6	42075	42080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018937	ACC	2	6	44415	44420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_018937	CTT	2	6	44423	44428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_018937	CTT	2	6	44621	44626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018937	TTA	2	6	44683	44688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018937	CAT	2	6	44708	44713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_018937	ATG	2	6	44776	44781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018937	TAG	2	6	44962	44967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018937	CAA	2	6	52309	52314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_018937	TAA	3	9	61515	61523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018937	TTA	2	6	61833	61838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018937	TAA	2	6	61862	61867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018937	AAC	2	6	61898	61903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018937	GTG	2	6	61947	61952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018937	AAT	2	6	62028	62033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018937	AGA	2	6	62096	62101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018937	AAG	2	6	62212	62217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018937	AAG	2	6	62221	62226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018937	ACG	2	6	62230	62235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_018937	GGT	2	6	67302	67307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018937	ACA	2	6	75363	75368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_018937	TTG	2	6	75390	75395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018937	ATT	3	9	78070	78078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018937	TTA	2	6	78121	78126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018937	TGG	2	6	78206	78211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018937	CTT	2	6	80483	80488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_018937	TAT	2	6	80509	80514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018937	CTT	2	6	80519	80524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_018937	TTG	2	6	80547	80552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018937	AAG	2	6	84231	84236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018937	ATC	2	6	86306	86311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_018937	ATT	2	6	88714	88719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018937	ATT	2	6	88724	88729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018937	TAA	2	6	88739	88744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018937	ATA	2	6	91544	91549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018937	CTA	2	6	95050	95055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_018937	TTA	2	6	95102	95107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018937	TCA	2	6	95113	95118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_018937	TTA	2	6	96845	96850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018937	TTG	2	6	101514	101519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018937	TTA	2	6	101627	101632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018937	TTA	2	6	102399	102404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018937	TTA	2	6	102433	102438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018937	TCA	2	6	104105	104110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018937	GTT	2	6	110832	110837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018937	ATA	2	6	110910	110915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018937	AAT	2	6	112782	112787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018937	TTA	2	6	116047	116052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018937	CCA	2	6	116182	116187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_018937	TGA	2	6	116293	116298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018937	AAG	2	6	116343	116348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018937	TGA	2	6	119658	119663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018937	TAA	2	6	119693	119698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018937	AAG	2	6	119946	119951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018937	TAT	2	6	120004	120009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018937	TTA	2	6	124643	124648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018937	TTG	2	6	129137	129142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018937	TAA	2	6	129293	129298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018937	TTA	2	6	130803	130808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018937	GTA	2	6	130811	130816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018937	TAA	2	6	130963	130968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018937	TAA	2	6	134878	134883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018937	GGT	2	6	134956	134961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018937	TTG	2	6	134978	134983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018937	GAA	2	6	135107	135112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018937	TTA	2	6	137787	137792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018937	TAG	2	6	138344	138349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018937	GAA	2	6	138401	138406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018937	AAT	2	6	139467	139472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018937	GAT	2	6	139567	139572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018937	TGA	2	6	139607	139612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018937	TGG	2	6	140177	140182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018937	GGT	2	6	140350	140355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018937	AGA	2	6	140367	140372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018937	GAA	2	6	140393	140398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018937	TTG	2	6	140411	140416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018937	ACC	2	6	141434	141439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_018937	TTG	2	6	141510	141515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018937	AAT	2	6	141554	141559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018937	ATG	2	6	141964	141969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018937	GGT	2	6	144912	144917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018937	TAA	2	6	144969	144974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018937	TAA	2	6	144990	144995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018937	TAT	2	6	146705	146710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018937	ACA	2	6	146732	146737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_018937	TAG	2	6	147274	147279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018937	AAT	2	6	149360	149365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018937	ATA	2	6	150146	150151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018937	ATT	2	6	150316	150321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018937	TTC	2	6	154664	154669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_018937	TAG	2	6	156177	156182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018937	TTA	2	6	156220	156225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018937	TTG	2	6	156295	156300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018937	TAC	2	6	156305	156310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_018937	TGA	2	6	161147	161152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018937	TAA	2	6	161184	161189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018937	TAT	2	6	162855	162860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018937	TAA	2	6	168801	168806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018937	GAT	2	6	168873	168878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018937	ATA	2	6	169940	169945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018937	ACC	2	6	169968	169973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_018937	GTA	2	6	169998	170003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018937	ATG	2	6	170065	170070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018937	ACA	2	6	170224	170229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_018937	CAC	2	6	170323	170328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_018937	CAA	2	6	170498	170503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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139	NC_018937	TGG	2	6	173476	173481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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