MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes A20 chromosome

Total Repeats: 84

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018936	AGTGTA	2	12	21850	21861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018936	ACTAAT	2	12	21878	21889	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_018936	AGTGTA	2	12	27851	27862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018936	ACTAAT	2	12	27879	27890	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_018936	TATTTT	2	12	64721	64732	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018936	AGTGTA	2	12	84656	84667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018936	ACTAAT	2	12	84684	84695	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_018936	TTCGGG	2	12	85626	85637	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_018936	ATAAAA	2	12	112783	112794	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018936	AGATAA	2	12	134822	134833	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018936	CTTTAT	2	12	160509	160520	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_018936	CTCTTT	2	12	162373	162384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_018936	GGTGTT	2	12	165439	165450	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018936	TGACAC	2	12	189236	189247	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018936	CAGTTC	2	12	193875	193886	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_018936	TTTAAA	2	12	195724	195735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018936	AGTGTA	2	12	269789	269800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018936	ACTAAT	2	12	269817	269828	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_018936	TTAAAA	2	12	291546	291557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018936	TTTAAT	2	12	308624	308635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018936	TTTTAG	2	12	321304	321315	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018936	AAGACC	2	12	336447	336458	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_018936	ATTTAA	2	12	371260	371271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018936	GTTAAA	2	12	395271	395282	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018936	TCCTTT	2	12	397336	397347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_018936	AGAAAT	2	12	404479	404490	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018936	ATTTTA	2	12	435764	435775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018936	GAGTAA	2	12	441553	441564	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018936	TAAAAA	2	12	457469	457480	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018936	AGGACT	2	12	462592	462603	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_018936	TAAAAA	2	12	482000	482011	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018936	AAAAGA	2	12	482183	482194	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018936	AAATTA	2	12	491392	491403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018936	GAAAAA	2	12	510508	510519	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018936	CCTTGT	2	12	558305	558316	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018936	TAAATA	2	12	672241	672252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018936	AGGTAA	2	12	683041	683052	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018936	TTCGGG	2	12	718114	718125	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_018936	GAAAAA	2	12	771925	771936	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018936	TTATCA	2	12	805939	805950	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_018936	TTAAAA	2	12	846544	846555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018936	TAACAA	2	12	898912	898923	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_018936	TTTAAA	2	12	960783	960794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018936	AGTCTT	2	12	963644	963655	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_018936	TTGTTT	2	12	1028156	1028167	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018936	ATATGA	2	12	1061715	1061726	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018936	AGTCTT	2	12	1077760	1077771	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_018936	TCTTTT	2	12	1105029	1105040	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_018936	CCTTGG	2	12	1137032	1137043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_018936	AAATTT	2	12	1174944	1174955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018936	TGACTT	2	12	1193574	1193585	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_018936	ATGATA	2	12	1200081	1200092	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018936	TAGAAT	2	12	1209925	1209936	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018936	AGCAGA	2	12	1238601	1238612	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_018936	TCCTTC	2	12	1279514	1279525	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_018936	AATGTT	2	12	1283193	1283204	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018936	TATTAG	2	12	1284990	1285001	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018936	TACACT	2	12	1285019	1285030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018936	CAATTC	2	12	1309547	1309558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_018936	TATTTT	2	12	1310621	1310632	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018936	AATACC	2	12	1319639	1319650	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018936	CTTTTC	2	12	1371339	1371350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_018936	ATATTT	2	12	1413764	1413775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018936	GGTTTT	2	12	1413926	1413937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018936	AACAAT	2	12	1434351	1434362	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_018936	ATTCCA	2	12	1463173	1463184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_018936	CTAGTC	2	12	1514421	1514432	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_018936	AATATT	2	12	1532928	1532939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018936	TATCAC	2	12	1543418	1543429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_018936	TTTGCT	2	12	1548673	1548684	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_018936	TAACAA	2	12	1563946	1563957	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_018936	AGAAAA	2	12	1569028	1569039	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018936	TATTAG	2	12	1575358	1575369	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018936	TACACT	2	12	1575387	1575398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_018936	GTTAAA	2	12	1590523	1590534	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018936	TTTTAT	2	12	1602715	1602726	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018936	ATGTTT	2	12	1602921	1602932	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018936	TTTTCA	2	12	1622225	1622236	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_018936	TTAATA	2	12	1754140	1754151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018936	ATTTTA	2	12	1764564	1764575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018936	TTTTCA	2	12	1771758	1771769	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_018936	TAAAAA	2	12	1783738	1783749	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018936	AATTTA	3	18	1795210	1795227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018936	GAAAAA	2	12	1833012	1833023	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.