MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus pyogenes A20 chromosome

Total Repeats: 618

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018936	TTACGT	2	12	4938	4949	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	410679700
2	NC_018936	GATTCA	2	12	6733	6744	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	410679701
3	NC_018936	ATTTTC	2	12	6979	6990	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	410679701
4	NC_018936	CTTAAC	2	12	7492	7503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410679701
5	NC_018936	TGCTTA	2	12	7966	7977	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	410679701
6	NC_018936	TAGATA	2	12	9995	10006	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	410679705
7	NC_018936	GTATTG	2	12	11068	11079	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	410679706
8	NC_018936	ATCAGA	2	12	11102	11113	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	410679706
9	NC_018936	AGATTT	2	12	11690	11701	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	410679706
10	NC_018936	TAAAAT	2	12	14007	14018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410679708
11	NC_018936	GAATCT	2	12	14734	14745	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	410679708
12	NC_018936	CTGCAA	2	12	31717	31728	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	410679710
13	NC_018936	ACTGAG	2	12	37440	37451	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	410679716
14	NC_018936	CAGGCG	2	12	37894	37905	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	410679716
15	NC_018936	ACATCG	2	12	44470	44481	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	410679720
16	NC_018936	AAAGCC	2	12	47472	47483	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	410679722
17	NC_018936	CTTTGC	2	12	47675	47686	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	410679722
18	NC_018936	AGACAG	2	12	49530	49541	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	410679724
19	NC_018936	ATAAAA	2	12	50444	50455	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	410679725
20	NC_018936	AAAAGT	2	12	53314	53325	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	410679727
21	NC_018936	CGAACA	2	12	55358	55369	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	410679728
22	NC_018936	ATAACT	2	12	55777	55788	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	410679729
23	NC_018936	AAGGAA	2	12	56283	56294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679730
24	NC_018936	GCCTTT	2	12	62285	62296	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	410679733
25	NC_018936	GGCAAC	2	12	63634	63645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410679734
26	NC_018936	AAAGGT	2	12	65160	65171	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	410679736
27	NC_018936	CTTGTT	2	12	65930	65941	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	410679737
28	NC_018936	AGCTGA	2	12	66378	66389	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	410679738
29	NC_018936	CGCAAT	2	12	67781	67792	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	410679741
30	NC_018936	ATTGAA	2	12	68193	68204	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	410679742
31	NC_018936	ACATCA	2	12	68329	68340	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	410679742
32	NC_018936	CAAAGG	2	12	72372	72383	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	410679751
33	NC_018936	AAATTA	2	12	73434	73445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410679754
34	NC_018936	GCGGTG	2	12	73947	73958	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	410679755
35	NC_018936	TAAAGA	2	12	74308	74319	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	410679756
36	NC_018936	ATTGAA	2	12	76508	76519	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	410679758
37	NC_018936	CGAAGG	2	12	99327	99338	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	410679775
38	NC_018936	CTGGTA	2	12	101324	101335	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410679775
39	NC_018936	ATATTT	2	12	102107	102118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679777
40	NC_018936	CTTTTT	2	12	103316	103327	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	410679778
41	NC_018936	AACCTT	2	12	114937	114948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410679796
42	NC_018936	CAGCAA	2	12	115691	115702	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	410679797
43	NC_018936	GATAAG	2	12	119598	119609	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	410679798
44	NC_018936	CTTATT	2	12	119729	119740	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	410679799
45	NC_018936	TTTTTA	2	12	127889	127900	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	410679809
46	NC_018936	AATAGC	2	12	130704	130715	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	410679813
47	NC_018936	ATCTTG	2	12	135207	135218	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	410679819
48	NC_018936	AAAAGC	2	12	136802	136813	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	410679819
49	NC_018936	TTTATT	2	12	136988	136999	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	410679819
50	NC_018936	ATGTCA	2	12	137139	137150	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	410679819
51	NC_018936	AAAGCT	2	12	138625	138636	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	410679822
52	NC_018936	AAGGTA	2	12	146457	146468	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	410679830
53	NC_018936	AAAACT	2	12	149072	149083	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	410679831
54	NC_018936	TATTGA	2	12	150665	150676	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	410679834
55	NC_018936	AAGGCT	2	12	154795	154806	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	410679838
56	NC_018936	CCAATC	2	12	159018	159029	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	410679842
57	NC_018936	TGCTGT	2	12	161771	161782	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	410679843
58	NC_018936	GATGTT	2	12	166465	166476	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	410679849
59	NC_018936	AGATCA	2	12	166489	166500	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	410679849
60	NC_018936	GATGTT	2	12	175813	175824	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	410679855
61	NC_018936	TCTTAT	2	12	177297	177308	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	410679857
62	NC_018936	GTGGAA	2	12	182167	182178	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	410679864
63	NC_018936	TCTTTG	2	12	184249	184260	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	410679867
64	NC_018936	TGGGAG	2	12	185994	186005	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	410679869
65	NC_018936	TGACTG	2	12	186163	186174	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410679869
66	NC_018936	TTGACC	2	12	186624	186635	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	410679870
67	NC_018936	CCTATC	2	12	187630	187641	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	410679872
68	NC_018936	ATCGGT	2	12	192536	192547	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410679878
69	NC_018936	TCAACA	2	12	194890	194901	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	410679879
70	NC_018936	TGAAAA	2	12	201920	201931	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	410679886
71	NC_018936	ATTAGC	2	12	208423	208434	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	410679892
72	NC_018936	TCATGC	2	12	215350	215361	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	410679898
73	NC_018936	TCCCAT	2	12	219287	219298	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	410679903
74	NC_018936	AAGGCC	2	12	223047	223058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410679907
75	NC_018936	TACCCA	2	12	228936	228947	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	410679913
76	NC_018936	GATACG	2	12	229964	229975	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	410679915
77	NC_018936	AGGCAA	2	12	233862	233873	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	410679919
78	NC_018936	GCAAGA	2	12	237939	237950	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	410679922
79	NC_018936	TTCGAA	2	12	239338	239349	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	410679922
80	NC_018936	TGGCAA	2	12	241979	241990	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	410679925
81	NC_018936	CCAGAA	2	12	242311	242322	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	410679925
82	NC_018936	CAGCAA	2	12	243336	243347	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	410679926
83	NC_018936	GGCTGT	2	12	248672	248683	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	410679930
84	NC_018936	AGTGAC	2	12	250547	250558	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	410679933
85	NC_018936	AGCCAA	2	12	253073	253084	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	410679936
86	NC_018936	ACTTAT	2	12	257812	257823	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	410679939
87	NC_018936	AAAAGC	2	12	258765	258776	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	410679939
88	NC_018936	GAAACA	2	12	258946	258957	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	410679939
89	NC_018936	AAAATC	2	12	263292	263303	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	410679943
90	NC_018936	TAAAAA	2	12	274394	274405	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	410679949
91	NC_018936	TCAAGA	2	12	280644	280655	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	410679957
92	NC_018936	GGGTTA	2	12	285652	285663	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	410679962
93	NC_018936	GACAAT	2	12	287688	287699	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	410679964
94	NC_018936	CCAGCT	2	12	289513	289524	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	410679965
95	NC_018936	CCAATT	2	12	298413	298424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410679974
96	NC_018936	CCAACG	2	12	298579	298590	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	410679974
97	NC_018936	ATAACC	2	12	301023	301034	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	410679975
98	NC_018936	GCACCT	2	12	303611	303622	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	410679977
99	NC_018936	AGCAGG	2	12	305461	305472	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	410679979
100	NC_018936	ATGATT	2	12	320023	320034	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	410679999
101	NC_018936	TATCGC	2	12	320256	320267	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	410679999
102	NC_018936	AAGACC	2	12	320899	320910	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	410680000
103	NC_018936	GATAAA	2	12	323927	323938	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	410680003
104	NC_018936	AAATTA	2	12	324446	324457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410680003
105	NC_018936	TGAGGT	2	12	325762	325773	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	410680005
106	NC_018936	GCAGAG	2	12	345417	345428	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	410680031
107	NC_018936	CATTAT	2	12	347706	347717	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	410680031
108	NC_018936	CAGCAA	2	12	349558	349569	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	410680031
109	NC_018936	GCTTTG	2	12	350106	350117	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	410680032
110	NC_018936	CAGAAG	2	12	359313	359324	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	410680041
111	NC_018936	GAAAAC	2	12	365315	365326	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	410680051
112	NC_018936	TTGTCT	2	12	367270	367281	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	410680052
113	NC_018936	TATTGA	2	12	371428	371439	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	410680058
114	NC_018936	AAAAGT	2	12	378550	378561	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	410680064
115	NC_018936	GCTAAA	2	12	380040	380051	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	410680066
116	NC_018936	GAAAAA	2	12	381749	381760	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	410680068
117	NC_018936	TTTACC	2	12	381968	381979	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	410680069
118	NC_018936	TCATGT	2	12	384836	384847	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	410680072
119	NC_018936	GAGAAG	2	12	396217	396228	50 %	0 %	50 %	0 %	410680088
120	NC_018936	ACGCAT	2	12	398719	398730	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	410680091
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219	NC_018936	GTTGAC	2	12	702060	702071	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410680377
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230	NC_018936	CGCTGA	2	12	737406	737417	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	410680413
231	NC_018936	TTAGGA	2	12	744888	744899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410680421
232	NC_018936	TAATGG	2	12	745141	745152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410680421
233	NC_018936	GTTATT	2	12	745467	745478	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	410680421
234	NC_018936	CTGATG	2	12	747323	747334	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410680423
235	NC_018936	ATATTC	2	12	747899	747910	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	410680423
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237	NC_018936	TGGACA	2	12	752047	752058	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	410680427
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239	NC_018936	CAGCTG	2	12	757387	757398	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	410680430
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340	NC_018936	TTAAGT	2	12	1029952	1029963	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	410680727
341	NC_018936	AAATCA	2	12	1032805	1032816	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	410680730
342	NC_018936	ATATAG	2	12	1033646	1033657	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	410680731
343	NC_018936	ATAAAG	2	12	1037162	1037173	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	410680733
344	NC_018936	ACCATA	2	12	1039336	1039347	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	410680734
345	NC_018936	ATTACG	2	12	1041348	1041359	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	410680736
346	NC_018936	ACAGCC	2	12	1044552	1044563	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	410680740
347	NC_018936	CTTGAC	2	12	1046826	1046837	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	410680742
348	NC_018936	TAACTG	2	12	1047426	1047437	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	410680742
349	NC_018936	CTATTG	2	12	1048528	1048539	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	410680743
350	NC_018936	TGCTAT	2	12	1050047	1050058	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	410680743
351	NC_018936	TTCTGG	2	12	1050742	1050753	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	410680744
352	NC_018936	TCGCCA	2	12	1051071	1051082	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	410680744
353	NC_018936	ATCCTT	2	12	1059989	1060000	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	410680754
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355	NC_018936	TCTAAC	2	12	1060940	1060951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410680755
356	NC_018936	CATACT	2	12	1061398	1061409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410680755
357	NC_018936	CAGGTA	2	12	1065461	1065472	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	410680761
358	NC_018936	ATCAAT	2	12	1068574	1068585	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	410680764
359	NC_018936	ATTCTT	2	12	1070397	1070408	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	410680765
360	NC_018936	ATTTTT	2	12	1071204	1071215	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	410680766
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362	NC_018936	TTGGTC	2	12	1079836	1079847	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	410680774
363	NC_018936	TAGCTG	2	12	1083878	1083889	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410680776
364	NC_018936	ATTGAT	2	12	1091019	1091030	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	410680784
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366	NC_018936	CTCAGT	2	12	1108163	1108174	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	410680801
367	NC_018936	ATTTTG	2	12	1116425	1116436	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	410680808
368	NC_018936	TTGCTT	2	12	1116652	1116663	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	410680808
369	NC_018936	TCTTTT	2	12	1121445	1121456	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	410680814
370	NC_018936	CTAAGG	2	12	1123933	1123944	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	410680815
371	NC_018936	AATGGT	2	12	1129234	1129245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410680821
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373	NC_018936	TCTACC	2	12	1139388	1139399	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	410680830
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377	NC_018936	TGCGAC	2	12	1162793	1162804	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	410680862
378	NC_018936	CCCATA	2	12	1163380	1163391	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	410680862
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383	NC_018936	ATTTTA	2	12	1186840	1186851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410680900
384	NC_018936	CGCAAT	2	12	1191815	1191826	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	410680904
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400	NC_018936	TTTGAT	2	12	1217080	1217091	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	410680929
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405	NC_018936	TAAGAC	2	12	1234038	1234049	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	410680945
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408	NC_018936	CATTTG	2	12	1241659	1241670	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	410680953
409	NC_018936	TGTTTC	2	12	1241826	1241837	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	410680954
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434	NC_018936	TAGCAA	2	12	1319702	1319713	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	410681016
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436	NC_018936	ATAGGT	2	12	1326086	1326097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410681021
437	NC_018936	ATCTCA	2	12	1326108	1326119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410681021
438	NC_018936	CATTAA	2	12	1326127	1326138	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	410681021
439	NC_018936	AGCATG	2	12	1326677	1326688	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	410681021
440	NC_018936	ACTGAC	2	12	1326919	1326930	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	410681021
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442	NC_018936	CTTTTT	2	12	1332180	1332191	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	410681027
443	NC_018936	TTGGTC	2	12	1337928	1337939	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	410681032
444	NC_018936	CAATCA	2	12	1342702	1342713	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	410681037
445	NC_018936	GTCACC	2	12	1346458	1346469	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	410681042
446	NC_018936	CAGAGC	2	12	1349543	1349554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410681045
447	NC_018936	CAGAGC	2	12	1349819	1349830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410681045
448	NC_018936	CCCAAT	2	12	1351057	1351068	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	410681046
449	NC_018936	GTCCGT	2	12	1352504	1352515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410681047
450	NC_018936	TGGCTA	2	12	1355622	1355633	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410681050
451	NC_018936	TGATGG	2	12	1359309	1359320	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	410681053
452	NC_018936	CTTCAG	2	12	1365291	1365302	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	410681058
453	NC_018936	TGAGCA	2	12	1365665	1365676	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	410681059
454	NC_018936	AAAGCT	2	12	1369798	1369809	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	410681064
455	NC_018936	AAGCAA	2	12	1376958	1376969	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	410681073
456	NC_018936	TAGCCA	2	12	1379553	1379564	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	410681076
457	NC_018936	ACCTTT	2	12	1380694	1380705	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	410681077
458	NC_018936	CCTTAG	2	12	1381338	1381349	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	410681077
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460	NC_018936	TTAGGA	2	12	1395333	1395344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410681093
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470	NC_018936	TTCCTT	2	12	1422412	1422423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410681129
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479	NC_018936	CAAAAG	2	12	1449860	1449871	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	410681162
480	NC_018936	CCTTTG	2	12	1451891	1451902	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	410681165
481	NC_018936	TGACAA	2	12	1454039	1454050	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	410681166
482	NC_018936	TTTGTG	2	12	1454194	1454205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410681166
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489	NC_018936	GGATAT	2	12	1466721	1466732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410681182
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