MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Streptococcus pyogenes A20 chromosome

Total Repeats: 25205

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018936	AAG	2	6	187	192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018936	ATG	2	6	290	295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679695
3	NC_018936	CTG	2	6	392	397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410679695
4	NC_018936	GAA	2	6	442	447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679695
5	NC_018936	AGC	2	6	494	499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410679695
6	NC_018936	TGC	2	6	594	599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410679695
7	NC_018936	TTA	2	6	682	687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679695
8	NC_018936	TTA	2	6	758	763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679695
9	NC_018936	TGA	2	6	843	848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679695
10	NC_018936	AAG	2	6	887	892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679695
11	NC_018936	ATA	3	9	920	928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410679695
12	NC_018936	ATC	2	6	965	970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410679695
13	NC_018936	AGA	2	6	981	986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679695
14	NC_018936	CCT	2	6	1033	1038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410679695
15	NC_018936	TGC	2	6	1224	1229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410679695
16	NC_018936	GAA	2	6	1285	1290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679695
17	NC_018936	CTA	2	6	1343	1348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410679695
18	NC_018936	TGG	2	6	1443	1448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410679695
19	NC_018936	TAA	2	6	1479	1484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410679695
20	NC_018936	CTA	4	12	1666	1677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_018936	TTA	3	9	1679	1687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018936	TTA	2	6	1691	1696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018936	ATT	2	6	1738	1743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679696
24	NC_018936	TCA	2	6	1805	1810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410679696
25	NC_018936	TTA	2	6	1937	1942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679696
26	NC_018936	ATT	2	6	1964	1969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679696
27	NC_018936	AAC	2	6	2010	2015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410679696
28	NC_018936	GTT	2	6	2021	2026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410679696
29	NC_018936	AAG	2	6	2091	2096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679696
30	NC_018936	ATT	2	6	2131	2136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679696
31	NC_018936	TAT	2	6	2143	2148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679696
32	NC_018936	GTC	2	6	2184	2189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410679696
33	NC_018936	CAG	2	6	2298	2303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410679696
34	NC_018936	CAG	2	6	2346	2351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410679696
35	NC_018936	GAT	2	6	2360	2365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679696
36	NC_018936	TTA	2	6	2474	2479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679696
37	NC_018936	GTT	2	6	2501	2506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410679696
38	NC_018936	CTT	2	6	2545	2550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410679696
39	NC_018936	GAA	2	6	2804	2809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679696
40	NC_018936	TTA	2	6	2882	2887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018936	ATA	2	6	2900	2905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018936	ATG	2	6	3067	3072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679697
43	NC_018936	AGA	2	6	3223	3228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018936	AAT	2	6	3301	3306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410679698
45	NC_018936	TCT	2	6	3373	3378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410679698
46	NC_018936	TCT	2	6	3395	3400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018936	TAA	2	6	3412	3417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018936	CAG	2	6	3460	3465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410679699
49	NC_018936	GCT	2	6	3534	3539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410679699
50	NC_018936	TGA	3	9	3770	3778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679699
51	NC_018936	AGA	2	6	4016	4021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679699
52	NC_018936	GTT	2	6	4032	4037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410679699
53	NC_018936	AAC	2	6	4055	4060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410679699
54	NC_018936	AGT	2	6	4169	4174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679699
55	NC_018936	AGA	3	9	4193	4201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679699
56	NC_018936	AGA	2	6	4229	4234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679699
57	NC_018936	AGC	2	6	4286	4291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410679699
58	NC_018936	ATC	2	6	4294	4299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410679699
59	NC_018936	CAG	2	6	4324	4329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410679699
60	NC_018936	GCT	2	6	4383	4388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410679699
61	NC_018936	TAT	2	6	4391	4396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679699
62	NC_018936	ATG	2	6	4444	4449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679699
63	NC_018936	AAG	2	6	4483	4488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679699
64	NC_018936	GAA	2	6	4503	4508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679699
65	NC_018936	TGT	2	6	4520	4525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410679699
66	NC_018936	CAT	2	6	4538	4543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410679699
67	NC_018936	GAA	2	6	4593	4598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018936	TTG	2	6	4648	4653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410679700
69	NC_018936	GAT	2	6	4752	4757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679700
70	NC_018936	TTA	2	6	4789	4794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679700
71	NC_018936	CTA	2	6	4822	4827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410679700
72	NC_018936	AAT	2	6	4836	4841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410679700
73	NC_018936	CTA	2	6	4871	4876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410679700
74	NC_018936	ATG	2	6	4909	4914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679700
75	NC_018936	CAG	2	6	4960	4965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410679700
76	NC_018936	GAC	2	6	5041	5046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410679700
77	NC_018936	TTA	2	6	5065	5070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679700
78	NC_018936	ATA	2	6	5101	5106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410679700
79	NC_018936	ATT	2	6	5221	5226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679701
80	NC_018936	ACC	2	6	5267	5272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410679701
81	NC_018936	GAT	2	6	5342	5347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679701
82	NC_018936	TGA	2	6	5422	5427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679701
83	NC_018936	TGA	2	6	5673	5678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679701
84	NC_018936	TTA	2	6	5706	5711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679701
85	NC_018936	GAT	2	6	5798	5803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679701
86	NC_018936	AAC	2	6	5850	5855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410679701
87	NC_018936	TTA	2	6	5868	5873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679701
88	NC_018936	GAT	2	6	5957	5962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679701
89	NC_018936	AGA	2	6	5977	5982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679701
90	NC_018936	ATT	2	6	6040	6045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679701
91	NC_018936	ATT	2	6	6064	6069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679701
92	NC_018936	GAT	2	6	6104	6109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679701
93	NC_018936	AGA	2	6	6169	6174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679701
94	NC_018936	ACT	2	6	6207	6212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410679701
95	NC_018936	CTT	2	6	6256	6261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410679701
96	NC_018936	AAC	2	6	6394	6399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410679701
97	NC_018936	TGA	2	6	6556	6561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679701
98	NC_018936	ACG	2	6	6610	6615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410679701
99	NC_018936	TAG	2	6	6817	6822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679701
100	NC_018936	CTG	2	6	6840	6845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410679701
101	NC_018936	TAA	2	6	6865	6870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410679701
102	NC_018936	ATG	2	6	6876	6881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679701
103	NC_018936	TGA	2	6	6934	6939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679701
104	NC_018936	AAG	2	6	6961	6966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679701
105	NC_018936	GAT	2	6	6995	7000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679701
106	NC_018936	TGA	3	9	7018	7026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679701
107	NC_018936	AGA	2	6	7045	7050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679701
108	NC_018936	TAG	2	6	7116	7121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679701
109	NC_018936	CAG	2	6	7226	7231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410679701
110	NC_018936	GTA	2	6	7299	7304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679701
111	NC_018936	ATT	2	6	7355	7360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679701
112	NC_018936	AAC	2	6	7431	7436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410679701
113	NC_018936	AAT	2	6	7616	7621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410679701
114	NC_018936	GGA	2	6	7664	7669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410679701
115	NC_018936	ATG	2	6	7824	7829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679701
116	NC_018936	ACA	2	6	7841	7846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410679701
117	NC_018936	ATC	2	6	7847	7852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410679701
118	NC_018936	GAA	2	6	7950	7955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679701
119	NC_018936	GAG	2	6	8097	8102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410679701
120	NC_018936	GAT	2	6	8267	8272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679701
121	NC_018936	AAT	2	6	8471	8476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410679701
122	NC_018936	CTT	2	6	8502	8507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410679701
123	NC_018936	ATT	2	6	8529	8534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679701
124	NC_018936	AGA	2	6	8638	8643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679701
125	NC_018936	ATA	2	6	8707	8712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410679701
126	NC_018936	AAC	2	6	8719	8724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_018936	TGC	2	6	8798	8803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_018936	TTA	2	6	8906	8911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679702
129	NC_018936	CGT	2	6	8914	8919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410679702
130	NC_018936	AAG	2	6	8930	8935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679702
131	NC_018936	GAA	2	6	9133	9138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679702
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