MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes SLCC2372 plasmid pLM1-2cUG1

Total Repeats: 23

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018889	TTTCCT	2	12	116	127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410679641
2	NC_018889	GTCGAT	2	12	602	613	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410679641
3	NC_018889	ATTTCA	2	12	910	921	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	410679641
4	NC_018889	ACAAAA	2	12	6459	6470	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	410679648
5	NC_018889	AAAGAA	2	12	10034	10045	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	410679653
6	NC_018889	TTTAAT	2	12	20886	20897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679665
7	NC_018889	ATTAAA	2	12	22488	22499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410679665
8	NC_018889	AAGATG	2	12	23221	23232	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	410679666
9	NC_018889	TGCACT	2	12	23896	23907	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	410679667
10	NC_018889	TCAGAG	2	12	26495	26506	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	410679667
11	NC_018889	CAAATT	2	12	27109	27120	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	410679668
12	NC_018889	TGAAAG	2	12	29917	29928	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	410679670
13	NC_018889	GGTTGT	2	12	30273	30284	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018889	ATGTAA	2	12	31057	31068	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018889	ACATAT	2	12	31093	31104	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_018889	GAAAAA	2	12	31875	31886	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	410679674
17	NC_018889	CTGACT	2	12	33486	33497	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	410679677
18	NC_018889	AAAATC	2	12	38128	38139	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	410679684
19	NC_018889	AATTTC	2	12	38533	38544	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	410679684
20	NC_018889	TAGAAA	2	12	39517	39528	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	410679685
21	NC_018889	GCGTCA	2	12	40257	40268	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	410679686
22	NC_018889	ATCGAG	2	12	46690	46701	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	410679691
23	NC_018889	AATAAA	2	12	49145	49156	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	410679694

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.