MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes SLCC2372 plasmid pLM1-2cUG1

Total Repeats: 37

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018889	TTTTA	2	10	679	688	20 %	80 %	0 %	0 %	410679641
2	NC_018889	ATGTT	2	10	1089	1098	20 %	60 %	20 %	0 %	410679641
3	NC_018889	CTGAA	2	10	1185	1194	40 %	20 %	20 %	20 %	410679641
4	NC_018889	AATTC	2	10	4320	4329	40 %	40 %	0 %	20 %	410679645
5	NC_018889	CCACT	2	10	6373	6382	20 %	20 %	0 %	60 %	410679648
6	NC_018889	TTATC	2	10	6634	6643	20 %	60 %	0 %	20 %	410679649
7	NC_018889	GTATT	2	10	8555	8564	20 %	60 %	20 %	0 %	410679652
8	NC_018889	GAAAA	2	10	8815	8824	80 %	0 %	20 %	0 %	410679652
9	NC_018889	AAAAG	2	10	12106	12115	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018889	GATCG	2	10	12265	12274	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_018889	CAAGA	2	10	13550	13559	60 %	0 %	20 %	20 %	410679658
12	NC_018889	GGGTG	2	10	13990	13999	0 %	20 %	80 %	0 %	410679658
13	NC_018889	TGTTC	2	10	14916	14925	0 %	60 %	20 %	20 %	410679660
14	NC_018889	TAAAA	2	10	15907	15916	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018889	GAAAA	2	10	17293	17302	80 %	0 %	20 %	0 %	410679662
16	NC_018889	ATTTT	2	10	18242	18251	20 %	80 %	0 %	0 %	410679663
17	NC_018889	ATTCA	2	10	18775	18784	40 %	40 %	0 %	20 %	410679663
18	NC_018889	TAGAA	2	10	19404	19413	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018889	GATTG	2	10	20665	20674	20 %	40 %	40 %	0 %	410679665
20	NC_018889	GTACA	2	10	21206	21215	40 %	20 %	20 %	20 %	410679665
21	NC_018889	ATGAT	2	10	22642	22651	40 %	40 %	20 %	0 %	410679666
22	NC_018889	GAAAG	2	10	22781	22790	60 %	0 %	40 %	0 %	410679666
23	NC_018889	GAAAA	2	10	22990	22999	80 %	0 %	20 %	0 %	410679666
24	NC_018889	AAGAA	2	10	23447	23456	80 %	0 %	20 %	0 %	410679666
25	NC_018889	CAAAT	2	10	23731	23740	60 %	20 %	0 %	20 %	410679667
26	NC_018889	TTTTC	2	10	24813	24822	0 %	80 %	0 %	20 %	410679667
27	NC_018889	GACTG	2	10	27498	27507	20 %	20 %	40 %	20 %	410679669
28	NC_018889	TCTTT	2	10	30796	30805	0 %	80 %	0 %	20 %	410679672
29	NC_018889	GGAAG	2	10	32303	32312	40 %	0 %	60 %	0 %	410679675
30	NC_018889	ATATT	2	10	36739	36748	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018889	TGAAA	2	10	37719	37728	60 %	20 %	20 %	0 %	410679684
32	NC_018889	ACAAA	2	10	38553	38562	80 %	0 %	0 %	20 %	410679684
33	NC_018889	AGTCA	2	10	40755	40764	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_018889	TCTCT	2	10	41008	41017	0 %	60 %	0 %	40 %	410679687
35	NC_018889	TTAAA	2	10	41574	41583	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018889	AGCTT	2	10	43947	43956	20 %	40 %	20 %	20 %	410679688
37	NC_018889	TCTAT	2	10	47358	47367	20 %	60 %	0 %	20 %	410679692

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.