MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes SLCC2372 plasmid pLM1-2cUG1

Total Repeats: 143

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018889	AGGG	2	8	166	173	25 %	0 %	75 %	0 %	410679641
2	NC_018889	CGAA	2	8	813	820	50 %	0 %	25 %	25 %	410679641
3	NC_018889	AAGC	2	8	989	996	50 %	0 %	25 %	25 %	410679641
4	NC_018889	CTTG	2	8	1109	1116	0 %	50 %	25 %	25 %	410679641
5	NC_018889	TGGA	2	8	2524	2531	25 %	25 %	50 %	0 %	410679643
6	NC_018889	GTAT	2	8	2788	2795	25 %	50 %	25 %	0 %	410679643
7	NC_018889	AAAG	2	8	3105	3112	75 %	0 %	25 %	0 %	410679644
8	NC_018889	GCTC	2	8	3268	3275	0 %	25 %	25 %	50 %	410679644
9	NC_018889	TTTC	2	8	3785	3792	0 %	75 %	0 %	25 %	410679645
10	NC_018889	AAGT	2	8	3817	3824	50 %	25 %	25 %	0 %	410679645
11	NC_018889	AACA	2	8	3968	3975	75 %	0 %	0 %	25 %	410679645
12	NC_018889	CGAT	2	8	3986	3993	25 %	25 %	25 %	25 %	410679645
13	NC_018889	CTTT	2	8	4199	4206	0 %	75 %	0 %	25 %	410679645
14	NC_018889	TTTC	2	8	4302	4309	0 %	75 %	0 %	25 %	410679645
15	NC_018889	CAAA	2	8	4542	4549	75 %	0 %	0 %	25 %	410679646
16	NC_018889	GATG	2	8	4702	4709	25 %	25 %	50 %	0 %	410679646
17	NC_018889	TTTG	2	8	4896	4903	0 %	75 %	25 %	0 %	410679646
18	NC_018889	TTTC	2	8	5212	5219	0 %	75 %	0 %	25 %	410679646
19	NC_018889	TCAT	2	8	5556	5563	25 %	50 %	0 %	25 %	410679646
20	NC_018889	CAAG	2	8	5835	5842	50 %	0 %	25 %	25 %	410679647
21	NC_018889	ATTA	2	8	5853	5860	50 %	50 %	0 %	0 %	410679647
22	NC_018889	ATAA	2	8	5868	5875	75 %	25 %	0 %	0 %	410679647
23	NC_018889	AAGA	2	8	6579	6586	75 %	0 %	25 %	0 %	410679649
24	NC_018889	CAAA	3	12	6600	6611	75 %	0 %	0 %	25 %	410679649
25	NC_018889	AAGT	2	8	6850	6857	50 %	25 %	25 %	0 %	410679649
26	NC_018889	TAAA	2	8	7448	7455	75 %	25 %	0 %	0 %	410679649
27	NC_018889	AAGA	2	8	8160	8167	75 %	0 %	25 %	0 %	410679651
28	NC_018889	CAAT	2	8	8194	8201	50 %	25 %	0 %	25 %	410679651
29	NC_018889	AAGA	2	8	9907	9914	75 %	0 %	25 %	0 %	410679653
30	NC_018889	TCGC	2	8	10371	10378	0 %	25 %	25 %	50 %	410679654
31	NC_018889	GAAA	2	8	10418	10425	75 %	0 %	25 %	0 %	410679654
32	NC_018889	ATCC	2	8	10776	10783	25 %	25 %	0 %	50 %	410679654
33	NC_018889	AAGT	2	8	11886	11893	50 %	25 %	25 %	0 %	410679656
34	NC_018889	GAAA	2	8	13468	13475	75 %	0 %	25 %	0 %	410679658
35	NC_018889	GAAA	2	8	13588	13595	75 %	0 %	25 %	0 %	410679658
36	NC_018889	ACCG	2	8	13600	13607	25 %	0 %	25 %	50 %	410679658
37	NC_018889	ATTT	2	8	13760	13767	25 %	75 %	0 %	0 %	410679658
38	NC_018889	ATGA	2	8	14260	14267	50 %	25 %	25 %	0 %	410679659
39	NC_018889	GAAA	2	8	14604	14611	75 %	0 %	25 %	0 %	410679659
40	NC_018889	TGTT	2	8	15180	15187	0 %	75 %	25 %	0 %	410679660
41	NC_018889	TTTC	2	8	15494	15501	0 %	75 %	0 %	25 %	410679661
42	NC_018889	AATA	2	8	16662	16669	75 %	25 %	0 %	0 %	410679662
43	NC_018889	TAGC	2	8	16727	16734	25 %	25 %	25 %	25 %	410679662
44	NC_018889	TCAT	2	8	16762	16769	25 %	50 %	0 %	25 %	410679662
45	NC_018889	CTTC	2	8	16942	16949	0 %	50 %	0 %	50 %	410679662
46	NC_018889	ACTT	2	8	17187	17194	25 %	50 %	0 %	25 %	410679662
47	NC_018889	AATC	2	8	17507	17514	50 %	25 %	0 %	25 %	410679662
48	NC_018889	TAAT	2	8	18438	18445	50 %	50 %	0 %	0 %	410679663
49	NC_018889	TTTC	2	8	18573	18580	0 %	75 %	0 %	25 %	410679663
50	NC_018889	CATA	2	8	18702	18709	50 %	25 %	0 %	25 %	410679663
51	NC_018889	TAAA	2	8	18865	18872	75 %	25 %	0 %	0 %	410679663
52	NC_018889	CCGG	2	8	19705	19712	0 %	0 %	50 %	50 %	410679664
53	NC_018889	TTGA	2	8	19895	19902	25 %	50 %	25 %	0 %	410679664
54	NC_018889	CCTA	2	8	19928	19935	25 %	25 %	0 %	50 %	410679664
55	NC_018889	AATC	2	8	19981	19988	50 %	25 %	0 %	25 %	410679664
56	NC_018889	TGAT	2	8	20996	21003	25 %	50 %	25 %	0 %	410679665
57	NC_018889	AGTA	2	8	21348	21355	50 %	25 %	25 %	0 %	410679665
58	NC_018889	AAAG	2	8	21967	21974	75 %	0 %	25 %	0 %	410679665
59	NC_018889	AAAG	2	8	22114	22121	75 %	0 %	25 %	0 %	410679665
60	NC_018889	GAAA	2	8	22619	22626	75 %	0 %	25 %	0 %	410679666
61	NC_018889	GAAA	2	8	22671	22678	75 %	0 %	25 %	0 %	410679666
62	NC_018889	TGGA	2	8	22957	22964	25 %	25 %	50 %	0 %	410679666
63	NC_018889	AATT	2	8	23426	23433	50 %	50 %	0 %	0 %	410679666
64	NC_018889	AAGC	2	8	24421	24428	50 %	0 %	25 %	25 %	410679667
65	NC_018889	ATTG	2	8	24499	24506	25 %	50 %	25 %	0 %	410679667
66	NC_018889	ATTC	2	8	24778	24785	25 %	50 %	0 %	25 %	410679667
67	NC_018889	AGTG	2	8	25096	25103	25 %	25 %	50 %	0 %	410679667
68	NC_018889	CTTC	2	8	25160	25167	0 %	50 %	0 %	50 %	410679667
69	NC_018889	ATTT	2	8	25342	25349	25 %	75 %	0 %	0 %	410679667
70	NC_018889	ATCA	2	8	25594	25601	50 %	25 %	0 %	25 %	410679667
71	NC_018889	GATC	2	8	25725	25732	25 %	25 %	25 %	25 %	410679667
72	NC_018889	ATTG	2	8	25873	25880	25 %	50 %	25 %	0 %	410679667
73	NC_018889	ATTG	2	8	26229	26236	25 %	50 %	25 %	0 %	410679667
74	NC_018889	TGGA	2	8	26387	26394	25 %	25 %	50 %	0 %	410679667
75	NC_018889	GTTG	2	8	26475	26482	0 %	50 %	50 %	0 %	410679667
76	NC_018889	AGAA	2	8	26551	26558	75 %	0 %	25 %	0 %	410679667
77	NC_018889	AGTT	2	8	26603	26610	25 %	50 %	25 %	0 %	410679668
78	NC_018889	TTCC	2	8	26612	26619	0 %	50 %	0 %	50 %	410679668
79	NC_018889	ATTG	2	8	26720	26727	25 %	50 %	25 %	0 %	410679668
80	NC_018889	TCAA	2	8	26936	26943	50 %	25 %	0 %	25 %	410679668
81	NC_018889	ACTC	2	8	27133	27140	25 %	25 %	0 %	50 %	410679668
82	NC_018889	TCTG	2	8	27549	27556	0 %	50 %	25 %	25 %	410679669
83	NC_018889	AGAA	2	8	28000	28007	75 %	0 %	25 %	0 %	410679670
84	NC_018889	TATT	2	8	28150	28157	25 %	75 %	0 %	0 %	410679670
85	NC_018889	AAGG	2	8	28191	28198	50 %	0 %	50 %	0 %	410679670
86	NC_018889	GATG	2	8	28493	28500	25 %	25 %	50 %	0 %	410679670
87	NC_018889	TCAA	2	8	28528	28535	50 %	25 %	0 %	25 %	410679670
88	NC_018889	GCCA	2	8	28748	28755	25 %	0 %	25 %	50 %	410679670
89	NC_018889	CATC	2	8	29194	29201	25 %	25 %	0 %	50 %	410679670
90	NC_018889	AGTG	2	8	29312	29319	25 %	25 %	50 %	0 %	410679670
91	NC_018889	GCAA	2	8	29492	29499	50 %	0 %	25 %	25 %	410679670
92	NC_018889	GGTG	2	8	29510	29517	0 %	25 %	75 %	0 %	410679670
93	NC_018889	ATTA	2	8	29929	29936	50 %	50 %	0 %	0 %	410679670
94	NC_018889	GATT	2	8	30900	30907	25 %	50 %	25 %	0 %	410679672
95	NC_018889	CTTG	2	8	30939	30946	0 %	50 %	25 %	25 %	410679672
96	NC_018889	AAAC	2	8	31197	31204	75 %	0 %	0 %	25 %	410679673
97	NC_018889	GAAT	2	8	31744	31751	50 %	25 %	25 %	0 %	410679674
98	NC_018889	TTTG	2	8	31942	31949	0 %	75 %	25 %	0 %	410679674
99	NC_018889	GAAA	2	8	32100	32107	75 %	0 %	25 %	0 %	410679674
100	NC_018889	ATTA	2	8	32126	32133	50 %	50 %	0 %	0 %	410679674
101	NC_018889	ATTT	2	8	32186	32193	25 %	75 %	0 %	0 %	410679675
102	NC_018889	AAAG	2	8	32211	32218	75 %	0 %	25 %	0 %	410679675
103	NC_018889	CTTT	2	8	32831	32838	0 %	75 %	0 %	25 %	410679676
104	NC_018889	CTTG	2	8	32865	32872	0 %	50 %	25 %	25 %	410679676
105	NC_018889	ACAT	2	8	33020	33027	50 %	25 %	0 %	25 %	410679676
106	NC_018889	GAAT	2	8	33837	33844	50 %	25 %	25 %	0 %	410679678
107	NC_018889	GAAA	2	8	34926	34933	75 %	0 %	25 %	0 %	410679680
108	NC_018889	AAAT	2	8	35184	35191	75 %	25 %	0 %	0 %	410679680
109	NC_018889	TAGG	2	8	35313	35320	25 %	25 %	50 %	0 %	410679680
110	NC_018889	ATTT	2	8	35369	35376	25 %	75 %	0 %	0 %	410679680
111	NC_018889	ATAA	2	8	35559	35566	75 %	25 %	0 %	0 %	410679682
112	NC_018889	CTTT	2	8	35676	35683	0 %	75 %	0 %	25 %	410679682
113	NC_018889	TTGA	2	8	36007	36014	25 %	50 %	25 %	0 %	410679682
114	NC_018889	CTTT	2	8	36277	36284	0 %	75 %	0 %	25 %	410679682
115	NC_018889	TTTC	2	8	36461	36468	0 %	75 %	0 %	25 %	410679683
116	NC_018889	GTTT	2	8	36625	36632	0 %	75 %	25 %	0 %	410679683
117	NC_018889	CCTT	2	8	36668	36675	0 %	50 %	0 %	50 %	410679683
118	NC_018889	TTGT	2	8	37482	37489	0 %	75 %	25 %	0 %	410679684
119	NC_018889	TCAA	2	8	37938	37945	50 %	25 %	0 %	25 %	410679684
120	NC_018889	AATA	2	8	38031	38038	75 %	25 %	0 %	0 %	410679684
121	NC_018889	AATT	2	8	38157	38164	50 %	50 %	0 %	0 %	410679684
122	NC_018889	TATG	2	8	38307	38314	25 %	50 %	25 %	0 %	410679684
123	NC_018889	TAAT	2	8	38849	38856	50 %	50 %	0 %	0 %	410679684
124	NC_018889	AAAC	2	8	39279	39286	75 %	0 %	0 %	25 %	410679685
125	NC_018889	TAAA	2	8	39418	39425	75 %	25 %	0 %	0 %	410679685
126	NC_018889	CGGT	2	8	40026	40033	0 %	25 %	50 %	25 %	410679686
127	NC_018889	TATT	2	8	40092	40099	25 %	75 %	0 %	0 %	410679686
128	NC_018889	GAAA	2	8	40422	40429	75 %	0 %	25 %	0 %	410679686
129	NC_018889	ATTT	2	8	40597	40604	25 %	75 %	0 %	0 %	410679686
130	NC_018889	TCAA	2	8	41894	41901	50 %	25 %	0 %	25 %	410679688
131	NC_018889	GATT	2	8	42312	42319	25 %	50 %	25 %	0 %	410679688
132	NC_018889	TCGA	2	8	42925	42932	25 %	25 %	25 %	25 %	410679688
133	NC_018889	AATT	2	8	43325	43332	50 %	50 %	0 %	0 %	410679688
134	NC_018889	GATG	2	8	43473	43480	25 %	25 %	50 %	0 %	410679688
135	NC_018889	AATT	2	8	44686	44693	50 %	50 %	0 %	0 %	410679689
136	NC_018889	AATG	2	8	44805	44812	50 %	25 %	25 %	0 %	410679689
137	NC_018889	GAAG	2	8	45887	45894	50 %	0 %	50 %	0 %	410679690
138	NC_018889	GGTA	2	8	46898	46905	25 %	25 %	50 %	0 %	410679691
139	NC_018889	CTTC	2	8	47323	47330	0 %	50 %	0 %	50 %	410679692
140	NC_018889	CCTC	2	8	47693	47700	0 %	25 %	0 %	75 %	410679692
141	NC_018889	TCAT	2	8	47928	47935	25 %	50 %	0 %	25 %	410679692
142	NC_018889	ATGC	2	8	48221	48228	25 %	25 %	25 %	25 %	410679692
143	NC_018889	TGAT	2	8	48237	48244	25 %	50 %	25 %	0 %	410679692

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.