MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes SLCC2372 plasmid pLM1-2cUG1

Total Repeats: 76

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018889	ACC	2	6	2135	2140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_018889	TCC	2	6	4370	4375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_018889	GAA	2	6	5727	5732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018889	TTA	2	6	5939	5944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018889	ACA	2	6	5949	5954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018889	ATT	2	6	6003	6008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018889	GAA	2	6	6102	6107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018889	ACC	2	6	7467	7472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_018889	ACC	2	6	7501	7506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_018889	ACC	2	6	7534	7539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_018889	ACC	2	6	7569	7574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_018889	ATT	2	6	7720	7725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018889	TTC	2	6	7786	7791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_018889	AGG	2	6	10264	10269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018889	GAG	2	6	11061	11066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018889	AAT	2	6	11078	11083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018889	TAT	2	6	12177	12182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018889	CTT	2	6	12279	12284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018889	TGG	2	6	12391	12396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018889	AAG	3	9	12603	12611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018889	AAG	2	6	12617	12622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018889	CTC	2	6	15391	15396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_018889	GTA	2	6	15752	15757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018889	AAT	2	6	15770	15775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018889	TAA	2	6	16092	16097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018889	ATA	2	6	16139	16144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018889	ATG	2	6	16178	16183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018889	TTG	2	6	16211	16216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018889	TAA	2	6	16248	16253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018889	CAA	2	6	19312	19317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_018889	ATT	2	6	19345	19350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018889	TAA	2	6	19557	19562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018889	TTA	2	6	20366	20371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018889	AGG	2	6	20394	20399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018889	CCT	2	6	27166	27171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_018889	TCA	2	6	27201	27206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_018889	ATT	2	6	29963	29968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018889	GAT	2	6	30371	30376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018889	TGC	2	6	30406	30411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018889	ATA	2	6	30445	30450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018889	AGG	2	6	31133	31138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018889	AGA	2	6	32539	32544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018889	AAT	2	6	33217	33222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018889	GTT	2	6	33257	33262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018889	ATG	2	6	33264	33269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018889	AGG	2	6	33307	33312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018889	TGA	2	6	34708	34713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018889	GTG	2	6	36840	36845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018889	ATA	2	6	36890	36895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018889	TTA	2	6	36896	36901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018889	TAA	2	6	36974	36979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018889	AAG	2	6	37041	37046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018889	AGG	2	6	37167	37172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018889	TAA	2	6	39832	39837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018889	CGA	2	6	39884	39889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_018889	GTA	2	6	40608	40613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018889	CGG	2	6	40741	40746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_018889	AGC	2	6	40801	40806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018889	CTA	2	6	40848	40853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_018889	TAT	2	6	40866	40871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018889	GCT	2	6	41232	41237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018889	CTT	2	6	41484	41489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_018889	CAC	2	6	41549	41554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_018889	ATT	2	6	41709	41714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018889	AAG	2	6	44115	44120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018889	GTT	2	6	44176	44181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018889	TGA	2	6	45707	45712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018889	TAT	2	6	46491	46496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018889	TAA	2	6	46549	46554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018889	ATT	2	6	46572	46577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018889	TTG	2	6	46662	46667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018889	GAG	2	6	46668	46673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018889	ATT	2	6	49727	49732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018889	GTA	2	6	49734	49739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018889	TTG	2	6	49985	49990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018889	ACA	2	6	50001	50006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.