MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes serotype 7 str. SLCC2482 plasmid pLM7UG1

Total Repeats: 23

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018888	TTTCCT	2	12	116	127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452850652
2	NC_018888	GTCGAT	2	12	602	613	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	452850652
3	NC_018888	ATTTCA	2	12	910	921	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	452850652
4	NC_018888	ACAAAA	2	12	6459	6470	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	452850659
5	NC_018888	AAAGAA	2	12	10035	10046	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	452850664
6	NC_018888	TTTAAT	2	12	20887	20898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452850676
7	NC_018888	ATTAAA	2	12	22489	22500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452850676
8	NC_018888	AAGATG	2	12	23221	23232	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	452850678
9	NC_018888	TGCACT	2	12	23896	23907	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	452850679
10	NC_018888	TCAGAG	2	12	26495	26506	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	452850679
11	NC_018888	CAAATT	2	12	27109	27120	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	452850680
12	NC_018888	TGAAAG	2	12	29917	29928	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	452850682
13	NC_018888	GGTTGT	2	12	30273	30284	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018888	ATGTAA	2	12	31057	31068	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018888	ACATAT	2	12	31093	31104	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_018888	GAAAAA	2	12	31875	31886	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	452850686
17	NC_018888	CTGACT	2	12	33486	33497	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	452850689
18	NC_018888	AAAATC	2	12	38127	38138	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	452850695
19	NC_018888	AATTTC	2	12	38532	38543	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	452850695
20	NC_018888	TAGAAA	2	12	39516	39527	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	452850696
21	NC_018888	GCGTCA	2	12	40256	40267	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	452850697
22	NC_018888	ATCGAG	2	12	46690	46701	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	452850703
23	NC_018888	AATAAA	2	12	49145	49156	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	452850706

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.