MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes serotype 7 str. SLCC2482 plasmid pLM7UG1

Total Repeats: 37

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018888	TTTTA	2	10	679	688	20 %	80 %	0 %	0 %	452850652
2	NC_018888	ATGTT	2	10	1089	1098	20 %	60 %	20 %	0 %	452850652
3	NC_018888	CTGAA	2	10	1185	1194	40 %	20 %	20 %	20 %	452850652
4	NC_018888	AATTC	2	10	4320	4329	40 %	40 %	0 %	20 %	452850656
5	NC_018888	CCACT	2	10	6373	6382	20 %	20 %	0 %	60 %	452850659
6	NC_018888	TTATC	2	10	6634	6643	20 %	60 %	0 %	20 %	452850660
7	NC_018888	GTATT	2	10	8555	8564	20 %	60 %	20 %	0 %	452850663
8	NC_018888	GAAAA	2	10	8815	8824	80 %	0 %	20 %	0 %	452850663
9	NC_018888	AAAAG	2	10	12107	12116	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018888	GATCG	2	10	12266	12275	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_018888	CAAGA	2	10	13551	13560	60 %	0 %	20 %	20 %	452850669
12	NC_018888	GGGTG	2	10	13991	14000	0 %	20 %	80 %	0 %	452850669
13	NC_018888	TGTTC	2	10	14917	14926	0 %	60 %	20 %	20 %	452850671
14	NC_018888	TAAAA	2	10	15908	15917	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018888	GAAAA	2	10	17294	17303	80 %	0 %	20 %	0 %	452850673
16	NC_018888	ATTTT	2	10	18243	18252	20 %	80 %	0 %	0 %	452850674
17	NC_018888	ATTCA	2	10	18776	18785	40 %	40 %	0 %	20 %	452850674
18	NC_018888	TAGAA	2	10	19405	19414	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018888	GATTG	2	10	20666	20675	20 %	40 %	40 %	0 %	452850676
20	NC_018888	GTACA	2	10	21207	21216	40 %	20 %	20 %	20 %	452850676
21	NC_018888	ATGAT	2	10	22643	22652	40 %	40 %	20 %	0 %	452850677
22	NC_018888	GAAAG	2	10	22782	22791	60 %	0 %	40 %	0 %	452850677
23	NC_018888	GAAAA	2	10	22990	22999	80 %	0 %	20 %	0 %	452850678
24	NC_018888	AAGAA	2	10	23447	23456	80 %	0 %	20 %	0 %	452850678
25	NC_018888	CAAAT	2	10	23731	23740	60 %	20 %	0 %	20 %	452850679
26	NC_018888	TTTTC	2	10	24813	24822	0 %	80 %	0 %	20 %	452850679
27	NC_018888	GACTG	2	10	27498	27507	20 %	20 %	40 %	20 %	452850681
28	NC_018888	TCTTT	2	10	30796	30805	0 %	80 %	0 %	20 %	452850684
29	NC_018888	GGAAG	2	10	32303	32312	40 %	0 %	60 %	0 %	452850687
30	NC_018888	ATATT	2	10	36738	36747	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018888	TGAAA	2	10	37718	37727	60 %	20 %	20 %	0 %	452850695
32	NC_018888	ACAAA	2	10	38552	38561	80 %	0 %	0 %	20 %	452850695
33	NC_018888	AGTCA	2	10	40754	40763	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_018888	TCTCT	2	10	41007	41016	0 %	60 %	0 %	40 %	452850698
35	NC_018888	TTAAA	2	10	41573	41582	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018888	AGCTT	2	10	43946	43955	20 %	40 %	20 %	20 %	452850700
37	NC_018888	TCTAT	2	10	47358	47367	20 %	60 %	0 %	20 %	452850704

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.