MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes serotype 7 str. SLCC2482 plasmid pLM7UG1

Total Repeats: 144

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018888	AGGG	2	8	166	173	25 %	0 %	75 %	0 %	452850652
2	NC_018888	CGAA	2	8	813	820	50 %	0 %	25 %	25 %	452850652
3	NC_018888	AAGC	2	8	989	996	50 %	0 %	25 %	25 %	452850652
4	NC_018888	CTTG	2	8	1109	1116	0 %	50 %	25 %	25 %	452850652
5	NC_018888	TGGA	2	8	2524	2531	25 %	25 %	50 %	0 %	452850654
6	NC_018888	GTAT	2	8	2788	2795	25 %	50 %	25 %	0 %	452850654
7	NC_018888	AAAG	2	8	3105	3112	75 %	0 %	25 %	0 %	452850655
8	NC_018888	GCTC	2	8	3268	3275	0 %	25 %	25 %	50 %	452850655
9	NC_018888	TTTC	2	8	3785	3792	0 %	75 %	0 %	25 %	452850656
10	NC_018888	AAGT	2	8	3817	3824	50 %	25 %	25 %	0 %	452850656
11	NC_018888	AACA	2	8	3968	3975	75 %	0 %	0 %	25 %	452850656
12	NC_018888	CGAT	2	8	3986	3993	25 %	25 %	25 %	25 %	452850656
13	NC_018888	CTTT	2	8	4199	4206	0 %	75 %	0 %	25 %	452850656
14	NC_018888	TTTC	2	8	4302	4309	0 %	75 %	0 %	25 %	452850656
15	NC_018888	CAAA	2	8	4542	4549	75 %	0 %	0 %	25 %	452850657
16	NC_018888	GATG	2	8	4702	4709	25 %	25 %	50 %	0 %	452850657
17	NC_018888	TTTG	2	8	4896	4903	0 %	75 %	25 %	0 %	452850657
18	NC_018888	TTTC	2	8	5212	5219	0 %	75 %	0 %	25 %	452850657
19	NC_018888	TCAT	2	8	5556	5563	25 %	50 %	0 %	25 %	452850657
20	NC_018888	CAAG	2	8	5835	5842	50 %	0 %	25 %	25 %	452850658
21	NC_018888	ATTA	2	8	5853	5860	50 %	50 %	0 %	0 %	452850658
22	NC_018888	ATAA	2	8	5868	5875	75 %	25 %	0 %	0 %	452850658
23	NC_018888	AAGA	2	8	6579	6586	75 %	0 %	25 %	0 %	452850660
24	NC_018888	CAAA	3	12	6600	6611	75 %	0 %	0 %	25 %	452850660
25	NC_018888	AAGT	2	8	6850	6857	50 %	25 %	25 %	0 %	452850660
26	NC_018888	TAAA	2	8	7448	7455	75 %	25 %	0 %	0 %	452850660
27	NC_018888	AAGA	2	8	8160	8167	75 %	0 %	25 %	0 %	452850662
28	NC_018888	CAAT	2	8	8194	8201	50 %	25 %	0 %	25 %	452850662
29	NC_018888	TCGC	2	8	10372	10379	0 %	25 %	25 %	50 %	452850665
30	NC_018888	GAAA	2	8	10419	10426	75 %	0 %	25 %	0 %	452850665
31	NC_018888	ATCC	2	8	10777	10784	25 %	25 %	0 %	50 %	452850665
32	NC_018888	AAGT	2	8	11887	11894	50 %	25 %	25 %	0 %	452850667
33	NC_018888	GAAA	2	8	13469	13476	75 %	0 %	25 %	0 %	452850669
34	NC_018888	GAAA	2	8	13589	13596	75 %	0 %	25 %	0 %	452850669
35	NC_018888	ACCG	2	8	13601	13608	25 %	0 %	25 %	50 %	452850669
36	NC_018888	ATTT	2	8	13761	13768	25 %	75 %	0 %	0 %	452850669
37	NC_018888	ATGA	2	8	14261	14268	50 %	25 %	25 %	0 %	452850670
38	NC_018888	GAAA	2	8	14605	14612	75 %	0 %	25 %	0 %	452850670
39	NC_018888	TGTT	2	8	15181	15188	0 %	75 %	25 %	0 %	452850671
40	NC_018888	TTTC	2	8	15495	15502	0 %	75 %	0 %	25 %	452850672
41	NC_018888	AATA	2	8	16663	16670	75 %	25 %	0 %	0 %	452850673
42	NC_018888	TAGC	2	8	16728	16735	25 %	25 %	25 %	25 %	452850673
43	NC_018888	TCAT	2	8	16763	16770	25 %	50 %	0 %	25 %	452850673
44	NC_018888	CTTC	2	8	16943	16950	0 %	50 %	0 %	50 %	452850673
45	NC_018888	ACTT	2	8	17188	17195	25 %	50 %	0 %	25 %	452850673
46	NC_018888	AATC	2	8	17508	17515	50 %	25 %	0 %	25 %	452850673
47	NC_018888	TAAT	2	8	18439	18446	50 %	50 %	0 %	0 %	452850674
48	NC_018888	TTTC	2	8	18574	18581	0 %	75 %	0 %	25 %	452850674
49	NC_018888	CATA	2	8	18703	18710	50 %	25 %	0 %	25 %	452850674
50	NC_018888	TAAA	2	8	18866	18873	75 %	25 %	0 %	0 %	452850674
51	NC_018888	CCGG	2	8	19706	19713	0 %	0 %	50 %	50 %	452850675
52	NC_018888	TTGA	2	8	19896	19903	25 %	50 %	25 %	0 %	452850675
53	NC_018888	CCTA	2	8	19929	19936	25 %	25 %	0 %	50 %	452850675
54	NC_018888	AATC	2	8	19982	19989	50 %	25 %	0 %	25 %	452850675
55	NC_018888	TGAT	2	8	20997	21004	25 %	50 %	25 %	0 %	452850676
56	NC_018888	AGTA	2	8	21349	21356	50 %	25 %	25 %	0 %	452850676
57	NC_018888	AAAG	2	8	21968	21975	75 %	0 %	25 %	0 %	452850676
58	NC_018888	AAAG	2	8	22115	22122	75 %	0 %	25 %	0 %	452850676
59	NC_018888	GAAA	2	8	22620	22627	75 %	0 %	25 %	0 %	452850677
60	NC_018888	GAAA	2	8	22672	22679	75 %	0 %	25 %	0 %	452850677
61	NC_018888	TGGA	2	8	22957	22964	25 %	25 %	50 %	0 %	452850678
62	NC_018888	AATT	2	8	23426	23433	50 %	50 %	0 %	0 %	452850678
63	NC_018888	AAGC	2	8	24421	24428	50 %	0 %	25 %	25 %	452850679
64	NC_018888	ATTG	2	8	24499	24506	25 %	50 %	25 %	0 %	452850679
65	NC_018888	ATTC	2	8	24778	24785	25 %	50 %	0 %	25 %	452850679
66	NC_018888	AGTG	2	8	25096	25103	25 %	25 %	50 %	0 %	452850679
67	NC_018888	CTTC	2	8	25160	25167	0 %	50 %	0 %	50 %	452850679
68	NC_018888	ATTT	2	8	25342	25349	25 %	75 %	0 %	0 %	452850679
69	NC_018888	ATCA	2	8	25594	25601	50 %	25 %	0 %	25 %	452850679
70	NC_018888	GATC	2	8	25725	25732	25 %	25 %	25 %	25 %	452850679
71	NC_018888	ATTG	2	8	25873	25880	25 %	50 %	25 %	0 %	452850679
72	NC_018888	ATTG	2	8	26229	26236	25 %	50 %	25 %	0 %	452850679
73	NC_018888	TGGA	2	8	26387	26394	25 %	25 %	50 %	0 %	452850679
74	NC_018888	GTTG	2	8	26475	26482	0 %	50 %	50 %	0 %	452850679
75	NC_018888	AGAA	2	8	26551	26558	75 %	0 %	25 %	0 %	452850679
76	NC_018888	AGTT	2	8	26603	26610	25 %	50 %	25 %	0 %	452850680
77	NC_018888	TTCC	2	8	26612	26619	0 %	50 %	0 %	50 %	452850680
78	NC_018888	ATTG	2	8	26720	26727	25 %	50 %	25 %	0 %	452850680
79	NC_018888	TCAA	2	8	26936	26943	50 %	25 %	0 %	25 %	452850680
80	NC_018888	ACTC	2	8	27133	27140	25 %	25 %	0 %	50 %	452850680
81	NC_018888	TCTG	2	8	27549	27556	0 %	50 %	25 %	25 %	452850681
82	NC_018888	AGAA	2	8	28000	28007	75 %	0 %	25 %	0 %	452850682
83	NC_018888	TATT	2	8	28150	28157	25 %	75 %	0 %	0 %	452850682
84	NC_018888	AAGG	2	8	28191	28198	50 %	0 %	50 %	0 %	452850682
85	NC_018888	GATG	2	8	28493	28500	25 %	25 %	50 %	0 %	452850682
86	NC_018888	TCAA	2	8	28528	28535	50 %	25 %	0 %	25 %	452850682
87	NC_018888	GCCA	2	8	28748	28755	25 %	0 %	25 %	50 %	452850682
88	NC_018888	CATC	2	8	29194	29201	25 %	25 %	0 %	50 %	452850682
89	NC_018888	AGTG	2	8	29312	29319	25 %	25 %	50 %	0 %	452850682
90	NC_018888	GCAA	2	8	29492	29499	50 %	0 %	25 %	25 %	452850682
91	NC_018888	GGTG	2	8	29510	29517	0 %	25 %	75 %	0 %	452850682
92	NC_018888	ATTA	2	8	29929	29936	50 %	50 %	0 %	0 %	452850682
93	NC_018888	GATT	2	8	30900	30907	25 %	50 %	25 %	0 %	452850684
94	NC_018888	CTTG	2	8	30939	30946	0 %	50 %	25 %	25 %	452850684
95	NC_018888	AAAC	2	8	31197	31204	75 %	0 %	0 %	25 %	452850685
96	NC_018888	GAAT	2	8	31744	31751	50 %	25 %	25 %	0 %	452850686
97	NC_018888	TTTG	2	8	31942	31949	0 %	75 %	25 %	0 %	452850686
98	NC_018888	GAAA	2	8	32100	32107	75 %	0 %	25 %	0 %	452850686
99	NC_018888	ATTA	2	8	32126	32133	50 %	50 %	0 %	0 %	452850686
100	NC_018888	ATTT	2	8	32186	32193	25 %	75 %	0 %	0 %	452850687
101	NC_018888	AAAG	2	8	32211	32218	75 %	0 %	25 %	0 %	452850687
102	NC_018888	CTTT	2	8	32831	32838	0 %	75 %	0 %	25 %	452850688
103	NC_018888	CTTG	2	8	32865	32872	0 %	50 %	25 %	25 %	452850688
104	NC_018888	ACAT	2	8	33020	33027	50 %	25 %	0 %	25 %	452850688
105	NC_018888	GAAT	2	8	33837	33844	50 %	25 %	25 %	0 %	452850690
106	NC_018888	GAAA	2	8	34926	34933	75 %	0 %	25 %	0 %	452850692
107	NC_018888	AAAT	2	8	35184	35191	75 %	25 %	0 %	0 %	452850692
108	NC_018888	TAGG	2	8	35313	35320	25 %	25 %	50 %	0 %	452850692
109	NC_018888	ATTT	2	8	35369	35376	25 %	75 %	0 %	0 %	452850692
110	NC_018888	ATAA	2	8	35558	35565	75 %	25 %	0 %	0 %	452850693
111	NC_018888	CTTT	2	8	35675	35682	0 %	75 %	0 %	25 %	452850693
112	NC_018888	TTGA	2	8	36006	36013	25 %	50 %	25 %	0 %	452850693
113	NC_018888	CTTT	2	8	36276	36283	0 %	75 %	0 %	25 %	452850693
114	NC_018888	TTTC	2	8	36460	36467	0 %	75 %	0 %	25 %	452850694
115	NC_018888	GTTT	2	8	36624	36631	0 %	75 %	25 %	0 %	452850694
116	NC_018888	CCTT	2	8	36667	36674	0 %	50 %	0 %	50 %	452850694
117	NC_018888	TTGT	2	8	37481	37488	0 %	75 %	25 %	0 %	452850695
118	NC_018888	TCAA	2	8	37937	37944	50 %	25 %	0 %	25 %	452850695
119	NC_018888	AATA	2	8	38030	38037	75 %	25 %	0 %	0 %	452850695
120	NC_018888	AATT	2	8	38156	38163	50 %	50 %	0 %	0 %	452850695
121	NC_018888	TATG	2	8	38306	38313	25 %	50 %	25 %	0 %	452850695
122	NC_018888	TAAT	2	8	38848	38855	50 %	50 %	0 %	0 %	452850695
123	NC_018888	AAAC	2	8	39278	39285	75 %	0 %	0 %	25 %	452850696
124	NC_018888	TAAA	2	8	39417	39424	75 %	25 %	0 %	0 %	452850696
125	NC_018888	CGGT	2	8	40025	40032	0 %	25 %	50 %	25 %	452850697
126	NC_018888	TATT	2	8	40091	40098	25 %	75 %	0 %	0 %	452850697
127	NC_018888	GAAA	2	8	40421	40428	75 %	0 %	25 %	0 %	452850697
128	NC_018888	ATTT	2	8	40596	40603	25 %	75 %	0 %	0 %	452850697
129	NC_018888	ATAA	2	8	41378	41385	75 %	25 %	0 %	0 %	452850699
130	NC_018888	TCAA	2	8	41893	41900	50 %	25 %	0 %	25 %	452850700
131	NC_018888	GATT	2	8	42311	42318	25 %	50 %	25 %	0 %	452850700
132	NC_018888	TCGA	2	8	42924	42931	25 %	25 %	25 %	25 %	452850700
133	NC_018888	AATT	2	8	43324	43331	50 %	50 %	0 %	0 %	452850700
134	NC_018888	GATG	2	8	43472	43479	25 %	25 %	50 %	0 %	452850700
135	NC_018888	AATT	2	8	44686	44693	50 %	50 %	0 %	0 %	452850701
136	NC_018888	AATG	2	8	44805	44812	50 %	25 %	25 %	0 %	452850701
137	NC_018888	TGAA	2	8	45715	45722	50 %	25 %	25 %	0 %	452850702
138	NC_018888	GAAG	2	8	45887	45894	50 %	0 %	50 %	0 %	452850702
139	NC_018888	GGTA	2	8	46898	46905	25 %	25 %	50 %	0 %	452850703
140	NC_018888	CTTC	2	8	47323	47330	0 %	50 %	0 %	50 %	452850704
141	NC_018888	CCTC	2	8	47693	47700	0 %	25 %	0 %	75 %	452850704
142	NC_018888	TCAT	2	8	47928	47935	25 %	50 %	0 %	25 %	452850704
143	NC_018888	ATGC	2	8	48221	48228	25 %	25 %	25 %	25 %	452850704
144	NC_018888	TGAT	2	8	48237	48244	25 %	50 %	25 %	0 %	452850704

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.