MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes serotype 7 str. SLCC2482 plasmid pLM7UG1

Total Repeats: 78

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018888	ACC	2	6	2135	2140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_018888	TCC	2	6	4370	4375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_018888	GAA	2	6	5727	5732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018888	TTA	2	6	5939	5944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018888	ACA	2	6	5949	5954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018888	ATT	2	6	6003	6008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018888	GAA	2	6	6102	6107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018888	ACC	2	6	7467	7472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_018888	ACC	2	6	7501	7506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_018888	ACC	2	6	7534	7539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_018888	ACC	2	6	7569	7574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_018888	ATT	2	6	7720	7725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018888	TTC	2	6	7786	7791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_018888	AGG	2	6	10265	10270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018888	GAG	2	6	11062	11067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018888	AAT	2	6	11079	11084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018888	TAT	2	6	12178	12183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018888	CTT	2	6	12280	12285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018888	TGG	2	6	12392	12397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018888	AAG	3	9	12604	12612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018888	AAG	2	6	12618	12623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018888	CTC	2	6	15392	15397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_018888	GTA	2	6	15753	15758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018888	AAT	2	6	15771	15776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018888	TAA	2	6	16093	16098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018888	ATA	2	6	16140	16145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018888	ATG	2	6	16179	16184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018888	TTG	2	6	16212	16217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018888	TAA	2	6	16249	16254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018888	CAA	2	6	19313	19318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_018888	ATT	2	6	19346	19351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018888	TAA	2	6	19558	19563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018888	TTA	2	6	20367	20372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018888	AGG	2	6	20395	20400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018888	CAA	2	6	22898	22903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018888	ACA	2	6	22917	22922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_018888	CCT	2	6	27166	27171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_018888	TCA	2	6	27201	27206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018888	ATT	2	6	29963	29968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018888	GAT	2	6	30371	30376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018888	TGC	2	6	30406	30411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_018888	ATA	2	6	30445	30450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018888	AGG	2	6	31133	31138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018888	AGA	2	6	32539	32544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018888	AAT	2	6	33217	33222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018888	GTT	2	6	33257	33262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018888	ATG	2	6	33264	33269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018888	AGG	2	6	33307	33312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018888	TGA	2	6	34708	34713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018888	GTG	2	6	36839	36844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018888	ATA	2	6	36889	36894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018888	TTA	2	6	36895	36900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018888	TAA	2	6	36973	36978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018888	AAG	2	6	37040	37045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018888	AGG	2	6	37166	37171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018888	TAA	2	6	39831	39836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018888	CGA	2	6	39883	39888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_018888	GTA	2	6	40607	40612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018888	CGG	2	6	40740	40745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_018888	AGC	2	6	40800	40805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_018888	CTA	2	6	40847	40852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018888	TAT	2	6	40865	40870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018888	GCT	2	6	41231	41236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018888	CTT	2	6	41483	41488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018888	CAC	2	6	41548	41553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_018888	ATT	2	6	41708	41713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018888	AAG	2	6	44114	44119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018888	GTT	2	6	44176	44181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018888	TGA	2	6	45707	45712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018888	TAT	2	6	46491	46496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018888	TAA	2	6	46549	46554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018888	ATT	2	6	46572	46577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018888	TTG	2	6	46662	46667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018888	GAG	2	6	46668	46673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018888	ATT	2	6	49727	49732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018888	GTA	2	6	49734	49739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018888	TTG	2	6	49985	49990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018888	ACA	2	6	50001	50006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.