MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes serotype 7 str. SLCC2482 plasmid pLM7UG1

Total Repeats: 102

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018888	AG	3	6	214	219	50 %	0 %	50 %	0 %	452850652
2	NC_018888	GA	3	6	220	225	50 %	0 %	50 %	0 %	452850652
3	NC_018888	GT	3	6	1350	1355	0 %	50 %	50 %	0 %	452850652
4	NC_018888	AG	3	6	1744	1749	50 %	0 %	50 %	0 %	452850652
5	NC_018888	GA	3	6	3338	3343	50 %	0 %	50 %	0 %	452850655
6	NC_018888	AT	3	6	4590	4595	50 %	50 %	0 %	0 %	452850657
7	NC_018888	AT	3	6	4802	4807	50 %	50 %	0 %	0 %	452850657
8	NC_018888	TG	3	6	4983	4988	0 %	50 %	50 %	0 %	452850657
9	NC_018888	TC	4	8	5444	5451	0 %	50 %	0 %	50 %	452850657
10	NC_018888	AG	4	8	6055	6062	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018888	GA	3	6	6721	6726	50 %	0 %	50 %	0 %	452850660
12	NC_018888	CG	3	6	7931	7936	0 %	0 %	50 %	50 %	452850661
13	NC_018888	AC	3	6	8292	8297	50 %	0 %	0 %	50 %	452850662
14	NC_018888	CA	3	6	8426	8431	50 %	0 %	0 %	50 %	452850662
15	NC_018888	AT	3	6	8634	8639	50 %	50 %	0 %	0 %	452850663
16	NC_018888	GA	3	6	9527	9532	50 %	0 %	50 %	0 %	452850663
17	NC_018888	AC	3	6	9549	9554	50 %	0 %	0 %	50 %	452850663
18	NC_018888	AG	3	6	9561	9566	50 %	0 %	50 %	0 %	452850663
19	NC_018888	TA	3	6	9581	9586	50 %	50 %	0 %	0 %	452850663
20	NC_018888	GA	3	6	9724	9729	50 %	0 %	50 %	0 %	452850663
21	NC_018888	TG	3	6	11498	11503	0 %	50 %	50 %	0 %	452850666
22	NC_018888	AT	3	6	12258	12263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018888	AT	3	6	12927	12932	50 %	50 %	0 %	0 %	452850669
24	NC_018888	AT	3	6	13971	13976	50 %	50 %	0 %	0 %	452850669
25	NC_018888	AG	4	8	14372	14379	50 %	0 %	50 %	0 %	452850670
26	NC_018888	AG	3	6	14756	14761	50 %	0 %	50 %	0 %	452850671
27	NC_018888	TA	3	6	14783	14788	50 %	50 %	0 %	0 %	452850671
28	NC_018888	AT	3	6	15077	15082	50 %	50 %	0 %	0 %	452850671
29	NC_018888	CT	3	6	15821	15826	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_018888	AG	3	6	15999	16004	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018888	TA	3	6	16276	16281	50 %	50 %	0 %	0 %	452850673
32	NC_018888	AT	3	6	16430	16435	50 %	50 %	0 %	0 %	452850673
33	NC_018888	AT	3	6	16449	16454	50 %	50 %	0 %	0 %	452850673
34	NC_018888	AC	3	6	16550	16555	50 %	0 %	0 %	50 %	452850673
35	NC_018888	AT	3	6	16599	16604	50 %	50 %	0 %	0 %	452850673
36	NC_018888	TA	3	6	16642	16647	50 %	50 %	0 %	0 %	452850673
37	NC_018888	AT	4	8	17557	17564	50 %	50 %	0 %	0 %	452850673
38	NC_018888	TC	3	6	17994	17999	0 %	50 %	0 %	50 %	452850673
39	NC_018888	TA	3	6	18028	18033	50 %	50 %	0 %	0 %	452850673
40	NC_018888	AT	3	6	18539	18544	50 %	50 %	0 %	0 %	452850674
41	NC_018888	AT	3	6	18593	18598	50 %	50 %	0 %	0 %	452850674
42	NC_018888	AT	3	6	18741	18746	50 %	50 %	0 %	0 %	452850674
43	NC_018888	AT	3	6	20262	20267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018888	TA	3	6	20328	20333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018888	CA	3	6	20851	20856	50 %	0 %	0 %	50 %	452850676
46	NC_018888	TA	4	8	23104	23111	50 %	50 %	0 %	0 %	452850678
47	NC_018888	AT	3	6	23375	23380	50 %	50 %	0 %	0 %	452850678
48	NC_018888	TC	3	6	24449	24454	0 %	50 %	0 %	50 %	452850679
49	NC_018888	CT	3	6	25934	25939	0 %	50 %	0 %	50 %	452850679
50	NC_018888	TA	3	6	25998	26003	50 %	50 %	0 %	0 %	452850679
51	NC_018888	GT	3	6	26238	26243	0 %	50 %	50 %	0 %	452850679
52	NC_018888	GT	3	6	26304	26309	0 %	50 %	50 %	0 %	452850679
53	NC_018888	TC	3	6	28182	28187	0 %	50 %	0 %	50 %	452850682
54	NC_018888	GT	3	6	28945	28950	0 %	50 %	50 %	0 %	452850682
55	NC_018888	GA	3	6	29153	29158	50 %	0 %	50 %	0 %	452850682
56	NC_018888	TC	3	6	30138	30143	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_018888	TA	3	6	30743	30748	50 %	50 %	0 %	0 %	452850683
58	NC_018888	TA	3	6	30754	30759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018888	AT	3	6	31121	31126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018888	TA	3	6	31736	31741	50 %	50 %	0 %	0 %	452850686
61	NC_018888	GC	3	6	31929	31934	0 %	0 %	50 %	50 %	452850686
62	NC_018888	TG	3	6	32688	32693	0 %	50 %	50 %	0 %	452850688
63	NC_018888	AG	4	8	32941	32948	50 %	0 %	50 %	0 %	452850688
64	NC_018888	GA	3	6	33519	33524	50 %	0 %	50 %	0 %	452850689
65	NC_018888	AT	3	6	33526	33531	50 %	50 %	0 %	0 %	452850689
66	NC_018888	TA	3	6	33874	33879	50 %	50 %	0 %	0 %	452850690
67	NC_018888	GA	3	6	34772	34777	50 %	0 %	50 %	0 %	452850692
68	NC_018888	GA	3	6	35505	35510	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018888	CT	3	6	36691	36696	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_018888	AT	4	8	37048	37055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018888	TA	4	8	37059	37066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018888	TA	3	6	37132	37137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018888	TA	3	6	37999	38004	50 %	50 %	0 %	0 %	452850695
74	NC_018888	GC	3	6	38085	38090	0 %	0 %	50 %	50 %	452850695
75	NC_018888	AT	3	6	38272	38277	50 %	50 %	0 %	0 %	452850695
76	NC_018888	AG	3	6	38653	38658	50 %	0 %	50 %	0 %	452850695
77	NC_018888	AT	3	6	39682	39687	50 %	50 %	0 %	0 %	452850696
78	NC_018888	GC	3	6	41189	41194	0 %	0 %	50 %	50 %	452850698
79	NC_018888	AT	3	6	42737	42742	50 %	50 %	0 %	0 %	452850700
80	NC_018888	TA	3	6	43979	43984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018888	AG	3	6	44300	44305	50 %	0 %	50 %	0 %	452850701
82	NC_018888	TA	3	6	44458	44463	50 %	50 %	0 %	0 %	452850701
83	NC_018888	AT	3	6	44479	44484	50 %	50 %	0 %	0 %	452850701
84	NC_018888	TA	3	6	44845	44850	50 %	50 %	0 %	0 %	452850701
85	NC_018888	AT	3	6	45272	45277	50 %	50 %	0 %	0 %	452850701
86	NC_018888	TA	3	6	45690	45695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018888	TA	3	6	45817	45822	50 %	50 %	0 %	0 %	452850702
88	NC_018888	TA	3	6	46039	46044	50 %	50 %	0 %	0 %	452850702
89	NC_018888	AG	3	6	46103	46108	50 %	0 %	50 %	0 %	452850702
90	NC_018888	AT	3	6	46462	46467	50 %	50 %	0 %	0 %	452850702
91	NC_018888	TA	3	6	46595	46600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018888	GA	3	6	46954	46959	50 %	0 %	50 %	0 %	452850703
93	NC_018888	AT	3	6	48880	48885	50 %	50 %	0 %	0 %	452850706
94	NC_018888	AG	3	6	49190	49195	50 %	0 %	50 %	0 %	452850706
95	NC_018888	TA	3	6	49571	49576	50 %	50 %	0 %	0 %	452850706
96	NC_018888	TC	3	6	49595	49600	0 %	50 %	0 %	50 %	452850706
97	NC_018888	AT	3	6	49611	49616	50 %	50 %	0 %	0 %	452850706
98	NC_018888	TA	3	6	49720	49725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018888	AT	3	6	49811	49816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018888	AT	3	6	49843	49848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018888	TA	4	8	49882	49889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018888	TA	3	6	49932	49937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.