MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii HLJ01 chromosome

Total Repeats: 654

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018887	TGACCA	2	12	2427	2438	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	410678751
2	NC_018887	TTTTTA	2	12	2874	2885	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	410678751
3	NC_018887	TTAAAC	2	12	3072	3083	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	410678751
4	NC_018887	GGATTA	2	12	3588	3599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678752
5	NC_018887	AAGAAA	2	12	7133	7144	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	410678755
6	NC_018887	CAATAG	2	12	8632	8643	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	410678757
7	NC_018887	CAATAA	2	12	9055	9066	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	410678757
8	NC_018887	TCTATT	2	12	9087	9098	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	410678757
9	NC_018887	AAAAAT	2	12	9462	9473	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	410678758
10	NC_018887	AATAAA	2	12	9495	9506	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	410678758
11	NC_018887	TAAAGA	2	12	9921	9932	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	410678758
12	NC_018887	TAAAAA	2	12	9965	9976	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	410678758
13	NC_018887	AGACAA	2	12	11114	11125	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	410678760
14	NC_018887	CAGATA	2	12	11161	11172	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	410678760
15	NC_018887	AAATTA	2	12	13479	13490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678763
16	NC_018887	ATTCAT	2	12	15194	15205	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	410678765
17	NC_018887	GAAAAA	2	12	15840	15851	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018887	TAAAGG	2	12	16305	16316	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	410678767
19	NC_018887	AACTAT	2	12	19051	19062	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	410678770
20	NC_018887	ATTTTA	2	12	22137	22148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018887	GTAAAT	2	12	26391	26402	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	410678777
22	NC_018887	TAACCT	2	12	27624	27635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678779
23	NC_018887	TCAAAC	2	12	28744	28755	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	410678781
24	NC_018887	ATTTAA	2	12	32169	32180	50 %	50 %	0 %	0 %	410678785
25	NC_018887	TATCAA	2	12	32829	32840	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	410678785
26	NC_018887	TAAAAA	2	12	36544	36555	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	410678787
27	NC_018887	AATATT	2	12	38458	38469	50 %	50 %	0 %	0 %	410678789
28	NC_018887	ATTTTT	2	12	38701	38712	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	410678789
29	NC_018887	TAAATT	2	12	38965	38976	50 %	50 %	0 %	0 %	410678789
30	NC_018887	AATATA	2	12	39877	39888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678790
31	NC_018887	AAAATC	2	12	41081	41092	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	410678791
32	NC_018887	CAAAAA	2	12	42430	42441	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	410678793
33	NC_018887	TCAATA	2	12	42524	42535	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	410678794
34	NC_018887	ATTAAA	2	12	42830	42841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678794
35	NC_018887	TAAATT	2	12	43772	43783	50 %	50 %	0 %	0 %	410678795
36	NC_018887	AATTAA	2	12	45363	45374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678795
37	NC_018887	TATATC	2	12	47579	47590	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	410678799
38	NC_018887	ATTTTT	2	12	47616	47627	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	410678799
39	NC_018887	AAATAA	2	12	48360	48371	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	410678800
40	NC_018887	TAAAAA	2	12	49631	49642	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	410678802
41	NC_018887	TCAAAT	2	12	51415	51426	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	410678805
42	NC_018887	TTTATT	2	12	54017	54028	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	410678807
43	NC_018887	TTTAAA	2	12	54429	54440	50 %	50 %	0 %	0 %	410678807
44	NC_018887	TAAATT	2	12	55630	55641	50 %	50 %	0 %	0 %	410678808
45	NC_018887	TTAAAA	2	12	57297	57308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678811
46	NC_018887	AAATTT	2	12	57318	57329	50 %	50 %	0 %	0 %	410678811
47	NC_018887	AAAAAT	2	12	57638	57649	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	410678811
48	NC_018887	CAAAAG	2	12	59141	59152	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	410678814
49	NC_018887	AATCAA	2	12	59191	59202	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	410678814
50	NC_018887	TAAATT	2	12	62663	62674	50 %	50 %	0 %	0 %	410678817
51	NC_018887	TTTAAG	2	12	63371	63382	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	410678818
52	NC_018887	GATATT	2	12	64151	64162	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	410678819
53	NC_018887	AAAAAT	2	12	67817	67828	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	410678822
54	NC_018887	TATTTT	2	12	69362	69373	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	410678822
55	NC_018887	ATAAAA	2	12	69578	69589	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	410678823
56	NC_018887	TAATTT	2	12	69720	69731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678823
57	NC_018887	GAAATT	2	12	71390	71401	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	410678825
58	NC_018887	AATTGA	2	12	72127	72138	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	410678825
59	NC_018887	AATAGA	2	12	73262	73273	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	410678827
60	NC_018887	TGAATA	2	12	74266	74277	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	410678828
61	NC_018887	TTGCTA	2	12	76174	76185	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	410678830
62	NC_018887	TGGAAT	2	12	77371	77382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678831
63	NC_018887	TAAGCT	2	12	77529	77540	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	410678831
64	NC_018887	AAAAGA	2	12	77620	77631	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	410678831
65	NC_018887	TTTAGA	2	12	77754	77765	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	410678832
66	NC_018887	CATTTG	2	12	78434	78445	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	410678832
67	NC_018887	AGGAAT	2	12	80168	80179	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	410678834
68	NC_018887	TTAAAT	2	12	80272	80283	50 %	50 %	0 %	0 %	410678834
69	NC_018887	TTTTAT	2	12	80640	80651	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	410678834
70	NC_018887	ATAAAA	2	12	80714	80725	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	410678834
71	NC_018887	TACAAA	2	12	81259	81270	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	410678835
72	NC_018887	AAAGAA	2	12	81727	81738	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	410678836
73	NC_018887	AATACT	2	12	85779	85790	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	410678838
74	NC_018887	ATTAAA	2	12	86847	86858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018887	AGATAA	2	12	87930	87941	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	410678841
76	NC_018887	ATAAAA	2	12	88217	88228	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	410678841
77	NC_018887	TTAAAC	2	12	88619	88630	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	410678841
78	NC_018887	CAATTT	2	12	88638	88649	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	410678841
79	NC_018887	ATTTTT	2	12	89615	89626	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	410678842
80	NC_018887	CAGAAA	2	12	90624	90635	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	410678843
81	NC_018887	TCTTTC	2	12	95320	95331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678848
82	NC_018887	GAAATA	2	12	96250	96261	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	410678848
83	NC_018887	AACATA	2	12	98487	98498	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	410678850
84	NC_018887	TGGACT	2	12	100048	100059	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410678851
85	NC_018887	CAATAA	2	12	101302	101313	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_018887	AAAACT	2	12	101397	101408	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_018887	GAAATA	2	12	105240	105251	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	410678857
88	NC_018887	TTGCTG	2	12	105853	105864	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	410678859
89	NC_018887	GGAATT	2	12	108532	108543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678861
90	NC_018887	ATTAAA	2	12	109535	109546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018887	TAAACT	2	12	111747	111758	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	410678865
92	NC_018887	CAATAT	2	12	111797	111808	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	410678866
93	NC_018887	AAATAG	2	12	114397	114408	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	410678868
94	NC_018887	AGATCA	2	12	117712	117723	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	410678872
95	NC_018887	AATTTC	2	12	119721	119732	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	410678875
96	NC_018887	TAATTT	2	12	120030	120041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678875
97	NC_018887	CTTTCT	2	12	123509	123520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678879
98	NC_018887	CATTTC	2	12	124205	124216	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	410678880
99	NC_018887	AATTCT	2	12	124783	124794	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	410678881
100	NC_018887	ATCTGA	2	12	128087	128098	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	410678884
101	NC_018887	ATTTTT	2	12	132538	132549	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	410678887
102	NC_018887	ATTTCC	2	12	134930	134941	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	410678888
103	NC_018887	TTAAAA	2	12	135241	135252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678888
104	NC_018887	AATAAA	4	24	135626	135649	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	410678888
105	NC_018887	AAACTA	2	12	136999	137010	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	410678889
106	NC_018887	CCTATA	2	12	138391	138402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_018887	TCCACT	2	12	138647	138658	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	410678892
108	NC_018887	ATTTTA	2	12	139581	139592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678892
109	NC_018887	CTTATT	2	12	142511	142522	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	410678893
110	NC_018887	AAAACT	2	12	142536	142547	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	410678893
111	NC_018887	TGGAAT	2	12	142650	142661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678894
112	NC_018887	AAAAGA	2	12	143827	143838	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	410678894
113	NC_018887	ATTAAA	2	12	143846	143857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678894
114	NC_018887	AATCAA	2	12	145887	145898	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	410678897
115	NC_018887	TCTAAA	2	12	146185	146196	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	410678898
116	NC_018887	TTTCAT	2	12	146993	147004	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	410678898
117	NC_018887	CATTGC	2	12	147380	147391	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	410678899
118	NC_018887	GTCTGA	2	12	148022	148033	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410678899
119	NC_018887	ATAGCA	2	12	148438	148449	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_018887	TCAACT	2	12	149426	149437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678900
121	NC_018887	CAAGAA	2	12	152338	152349	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	410678903
122	NC_018887	TTGGAA	2	12	152437	152448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678903
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460	NC_018887	TGATCG	3	18	645736	645753	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410679396
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462	NC_018887	TTTTGT	2	12	646374	646385	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	410679396
463	NC_018887	TCAATC	2	12	646585	646596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
464	NC_018887	ATCTTT	2	12	648246	648257	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	410679399
465	NC_018887	AAATTT	2	12	649701	649712	50 %	50 %	0 %	0 %	410679400
466	NC_018887	ATTTTC	2	12	652238	652249	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	410679402
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473	NC_018887	GTATTT	2	12	667757	667768	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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