MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii HLJ01 chromosome

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018887	GAAAAA	2	12	15840	15851	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018887	ATTTTA	2	12	22137	22148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018887	ATTAAA	2	12	86847	86858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018887	CAATAA	2	12	101302	101313	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_018887	AAAACT	2	12	101397	101408	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_018887	ATTAAA	2	12	109535	109546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018887	CCTATA	2	12	138391	138402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018887	ATAGCA	2	12	148438	148449	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_018887	ATTAAA	2	12	174737	174748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018887	TTAAAA	2	12	202954	202965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018887	AAAATA	2	12	203762	203773	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018887	TAAATA	2	12	244263	244274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018887	GCAAAC	2	12	311319	311330	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_018887	TAATAG	2	12	353967	353978	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018887	TTAAAA	2	12	357756	357767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018887	AAAAAC	2	12	377853	377864	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_018887	AAATTT	2	12	388932	388943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018887	TAAAAA	2	12	393270	393281	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018887	CCTTTC	2	12	408619	408630	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_018887	TTAATA	2	12	410806	410817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018887	TTCAAA	2	12	416869	416880	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_018887	ATTAGT	2	12	435611	435622	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018887	TCGCTT	2	12	437807	437818	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_018887	ATTAGT	2	12	438847	438858	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018887	TCGCTT	2	12	441043	441054	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_018887	AATAAA	2	12	444265	444276	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018887	TGCAAT	2	12	444313	444324	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_018887	AATTGC	2	12	444331	444342	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_018887	TTCGCC	2	12	447298	447309	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
30	NC_018887	CTATTA	2	12	460130	460141	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_018887	ATAAGG	2	12	494097	494108	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018887	AGGTCT	2	12	506678	506689	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_018887	AATAAG	2	12	549788	549799	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018887	TAAATT	2	12	579114	579125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018887	TAATTA	2	12	592107	592118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018887	AATTTT	2	12	613057	613068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018887	TCAATC	2	12	646585	646596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_018887	GTATTT	2	12	667757	667768	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018887	TTGTTT	2	12	679748	679759	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018887	TCTTTA	2	12	690183	690194	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_018887	TTTAAT	2	12	707375	707386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018887	ATTATA	2	12	733010	733021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018887	AATTTT	2	12	759672	759683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018887	TTTATG	2	12	777441	777452	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018887	TATTTT	2	12	777485	777496	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018887	TTCAAT	2	12	783733	783744	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_018887	AAATTA	2	12	795267	795278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018887	GTTTTA	2	12	821112	821123	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018887	TAATGT	2	12	830741	830752	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018887	GTTCAA	2	12	833336	833347	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_018887	TTTTTC	2	12	854354	854365	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_018887	TATTTT	2	12	888248	888259	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018887	TTTTCA	2	12	905399	905410	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.