MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii HLJ01 chromosome

Total Repeats: 13121

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018887	TAT	3	9	69	77	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018887	TTA	3	9	125	133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678749
3	NC_018887	CAA	2	6	363	368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678749
4	NC_018887	TTC	2	6	461	466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678749
5	NC_018887	ACT	2	6	497	502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678749
6	NC_018887	AAC	2	6	517	522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678749
7	NC_018887	TAA	2	6	586	591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678749
8	NC_018887	CAA	2	6	726	731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018887	CTA	2	6	747	752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678750
10	NC_018887	ATA	2	6	859	864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678750
11	NC_018887	ATA	2	6	961	966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678750
12	NC_018887	AGC	2	6	972	977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410678750
13	NC_018887	TCC	2	6	1071	1076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410678750
14	NC_018887	TCC	2	6	1173	1178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410678750
15	NC_018887	CTA	2	6	1378	1383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678750
16	NC_018887	ACT	2	6	1384	1389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678750
17	NC_018887	TCA	2	6	1399	1404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678750
18	NC_018887	CAA	2	6	1409	1414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678750
19	NC_018887	ATC	2	6	1536	1541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678750
20	NC_018887	ATT	2	6	1560	1565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678750
21	NC_018887	TCA	2	6	1646	1651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678750
22	NC_018887	TAG	2	6	1837	1842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678751
23	NC_018887	ATT	2	6	1850	1855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678751
24	NC_018887	CTC	2	6	1860	1865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410678751
25	NC_018887	TAT	2	6	2072	2077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678751
26	NC_018887	TCA	2	6	2079	2084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678751
27	NC_018887	GAA	2	6	2178	2183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678751
28	NC_018887	TCC	2	6	2186	2191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410678751
29	NC_018887	CTC	2	6	2239	2244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410678751
30	NC_018887	AGA	2	6	2285	2290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678751
31	NC_018887	ATT	3	9	2459	2467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678751
32	NC_018887	TAT	2	6	2470	2475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678751
33	NC_018887	ATC	2	6	2555	2560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678751
34	NC_018887	AAG	2	6	2977	2982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678751
35	NC_018887	TAA	2	6	2991	2996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678751
36	NC_018887	CTT	2	6	3001	3006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678751
37	NC_018887	TAA	2	6	3298	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018887	ATT	2	6	3318	3323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018887	TAT	2	6	3329	3334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018887	AAT	2	6	3338	3343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018887	TAA	2	6	3532	3537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678752
42	NC_018887	ATT	2	6	3553	3558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678752
43	NC_018887	ATT	2	6	3621	3626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678752
44	NC_018887	TAA	2	6	3649	3654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678752
45	NC_018887	TGG	2	6	3806	3811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410678752
46	NC_018887	ATA	2	6	3840	3845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678752
47	NC_018887	ATA	2	6	3859	3864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678752
48	NC_018887	TAA	2	6	3880	3885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678752
49	NC_018887	TGA	2	6	3914	3919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678752
50	NC_018887	ATA	2	6	3951	3956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678752
51	NC_018887	AAT	2	6	4091	4096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678752
52	NC_018887	CTA	2	6	4248	4253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678752
53	NC_018887	ATC	2	6	4362	4367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678752
54	NC_018887	TAA	2	6	4393	4398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678752
55	NC_018887	ATG	2	6	4459	4464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678752
56	NC_018887	GAT	2	6	4557	4562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678752
57	NC_018887	TAC	2	6	4651	4656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_018887	ATT	2	6	4675	4680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018887	ACT	2	6	4725	4730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678753
60	NC_018887	ACA	2	6	4766	4771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678753
61	NC_018887	ATC	2	6	4795	4800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678753
62	NC_018887	TAA	2	6	4891	4896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678753
63	NC_018887	AGG	2	6	4984	4989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410678753
64	NC_018887	TAA	2	6	5011	5016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678753
65	NC_018887	TTG	2	6	5022	5027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410678753
66	NC_018887	TAA	2	6	5064	5069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678753
67	NC_018887	CTA	2	6	5117	5122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678753
68	NC_018887	TAA	2	6	5128	5133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678753
69	NC_018887	TAA	2	6	5139	5144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678753
70	NC_018887	ATA	2	6	5161	5166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678753
71	NC_018887	ATA	2	6	5187	5192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018887	CAC	2	6	5200	5205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_018887	TTC	2	6	5237	5242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018887	TAC	2	6	5320	5325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678754
75	NC_018887	TCA	2	6	5372	5377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678754
76	NC_018887	TCT	2	6	5407	5412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678754
77	NC_018887	CTT	2	6	5491	5496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678754
78	NC_018887	CTT	2	6	5520	5525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678754
79	NC_018887	TCA	2	6	5651	5656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678754
80	NC_018887	CCA	2	6	5715	5720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410678754
81	NC_018887	CTT	2	6	5789	5794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678754
82	NC_018887	TTA	2	6	6053	6058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678754
83	NC_018887	TAA	2	6	6168	6173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678754
84	NC_018887	CTT	2	6	6189	6194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678754
85	NC_018887	TAC	2	6	6211	6216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678754
86	NC_018887	ACC	2	6	6345	6350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410678755
87	NC_018887	CAG	2	6	6554	6559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410678755
88	NC_018887	TTA	2	6	6620	6625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678755
89	NC_018887	AGC	2	6	6755	6760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410678755
90	NC_018887	ATT	2	6	6798	6803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678755
91	NC_018887	TAG	2	6	6830	6835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678755
92	NC_018887	ACA	3	9	6902	6910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678755
93	NC_018887	ACT	2	6	6916	6921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678755
94	NC_018887	AAT	2	6	6942	6947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678755
95	NC_018887	TAA	2	6	7004	7009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678755
96	NC_018887	ATA	2	6	7048	7053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678755
97	NC_018887	TAG	2	6	7072	7077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678755
98	NC_018887	TAA	2	6	7108	7113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678755
99	NC_018887	ATA	2	6	7145	7150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678755
100	NC_018887	TAA	2	6	7160	7165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678755
101	NC_018887	GCT	2	6	7404	7409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_018887	TAA	2	6	7433	7438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018887	ATT	2	6	7605	7610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678756
104	NC_018887	TCT	2	6	7709	7714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678756
105	NC_018887	TTA	2	6	7726	7731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678756
106	NC_018887	ATT	2	6	7953	7958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678756
107	NC_018887	CTT	2	6	7968	7973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678756
108	NC_018887	TCA	2	6	7990	7995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678756
109	NC_018887	TAT	2	6	8054	8059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678756
110	NC_018887	TCA	2	6	8209	8214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678756
111	NC_018887	TGC	2	6	8224	8229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410678756
112	NC_018887	TAT	2	6	8351	8356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018887	CTA	2	6	8529	8534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678757
114	NC_018887	ATT	2	6	8575	8580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678757
115	NC_018887	TAA	2	6	8674	8679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678757
116	NC_018887	GAA	2	6	8727	8732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678757
117	NC_018887	GTT	2	6	8742	8747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410678757
118	NC_018887	ATA	2	6	8835	8840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678757
119	NC_018887	ACG	2	6	8917	8922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410678757
120	NC_018887	TAA	2	6	8929	8934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678757
121	NC_018887	GAA	2	6	9075	9080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678757
122	NC_018887	AAT	2	6	9177	9182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678758
123	NC_018887	TAA	2	6	9209	9214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678758
124	NC_018887	TGA	2	6	9225	9230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678758
125	NC_018887	AAC	2	6	9309	9314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678758
126	NC_018887	TAA	2	6	9432	9437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678758
127	NC_018887	AAT	2	6	9438	9443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678758
128	NC_018887	ATT	2	6	9444	9449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678758
129	NC_018887	TTA	2	6	9679	9684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678758
130	NC_018887	AGT	2	6	9783	9788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678758
131	NC_018887	GTA	2	6	9826	9831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678758
132	NC_018887	AAT	2	6	9867	9872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678758
133	NC_018887	TAA	2	6	9894	9899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678758
134	NC_018887	TAA	2	6	9938	9943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678758
135	NC_018887	ACA	2	6	10070	10075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678758
136	NC_018887	AAT	2	6	10155	10160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678758
137	NC_018887	ATA	2	6	10203	10208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678759
138	NC_018887	TAT	2	6	10307	10312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678759
139	NC_018887	TAA	2	6	10414	10419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678759
140	NC_018887	AGA	2	6	10628	10633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678760
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142	NC_018887	GCA	2	6	10770	10775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410678760
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152	NC_018887	ATA	2	6	11581	11586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678761
153	NC_018887	ATT	2	6	11646	11651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678761
154	NC_018887	ACT	2	6	11759	11764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678761
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159	NC_018887	TAT	2	6	12342	12347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678762
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163	NC_018887	CAA	3	9	12514	12522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678762
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165	NC_018887	ATA	2	6	12704	12709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678762
166	NC_018887	ATA	2	6	12716	12721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678762
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171	NC_018887	ATA	2	6	12942	12947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678763
172	NC_018887	ATA	2	6	12960	12965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678763
173	NC_018887	AAC	2	6	13141	13146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678763
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188	NC_018887	TAC	2	6	13894	13899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678764
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210	NC_018887	TAA	2	6	15080	15085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678765
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213	NC_018887	ACC	2	6	15306	15311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410678765
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215	NC_018887	CTT	2	6	15343	15348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678766
216	NC_018887	TTA	2	6	15441	15446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678766
217	NC_018887	ATT	2	6	15465	15470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678766
218	NC_018887	TTA	2	6	15513	15518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678766
219	NC_018887	GAA	2	6	15674	15679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
220	NC_018887	TAT	2	6	15890	15895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
221	NC_018887	CTT	2	6	16027	16032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678767
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225	NC_018887	TAT	2	6	16194	16199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678767
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237	NC_018887	ATA	2	6	16759	16764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678767
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239	NC_018887	AAT	2	6	16842	16847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678768
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241	NC_018887	CAA	2	6	17124	17129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678768
242	NC_018887	TAT	2	6	17186	17191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678768
243	NC_018887	CTG	2	6	17292	17297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410678768
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245	NC_018887	AAT	2	6	17508	17513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678768
246	NC_018887	ATT	2	6	17547	17552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678768
247	NC_018887	ACT	2	6	17574	17579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678768
248	NC_018887	TCA	2	6	17605	17610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678768
249	NC_018887	ATT	2	6	17718	17723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678768
250	NC_018887	ATA	2	6	17860	17865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678769
251	NC_018887	CAA	2	6	18125	18130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678769
252	NC_018887	AAT	2	6	18218	18223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678769
253	NC_018887	CAA	3	9	18282	18290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678769
254	NC_018887	TAA	2	6	18296	18301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678769
255	NC_018887	TCA	2	6	18350	18355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678770
256	NC_018887	AGA	2	6	18364	18369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678770
257	NC_018887	ATT	2	6	18406	18411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678770
258	NC_018887	CAA	2	6	18435	18440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678770
259	NC_018887	TCA	2	6	18522	18527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678770
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263	NC_018887	CAA	2	6	18924	18929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678770
264	NC_018887	CTT	2	6	18933	18938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678770
265	NC_018887	TCA	2	6	19112	19117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678770
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273	NC_018887	TCC	2	6	19735	19740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410678770
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280	NC_018887	TTC	2	6	20441	20446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678771
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