MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii HLJ01 chromosome

Total Repeats: 1057

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018887	TAT	3	9	69	77	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018887	CAA	2	6	726	731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018887	TAA	2	6	3298	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018887	ATT	2	6	3318	3323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018887	TAT	2	6	3329	3334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018887	AAT	2	6	3338	3343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018887	TAC	2	6	4651	4656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018887	ATT	2	6	4675	4680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018887	ATA	2	6	5187	5192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018887	CAC	2	6	5200	5205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_018887	TTC	2	6	5237	5242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018887	GCT	2	6	7404	7409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_018887	TAA	2	6	7433	7438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018887	TAT	2	6	8351	8356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018887	GAA	2	6	15674	15679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018887	TAT	2	6	15890	15895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018887	TCC	2	6	19987	19992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_018887	AAT	2	6	20041	20046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018887	TTA	2	6	25655	25660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018887	TAT	2	6	25661	25666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018887	TAA	2	6	25698	25703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018887	TAA	2	6	25737	25742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018887	AAT	2	6	25751	25756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018887	TAA	3	9	31547	31555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018887	TTA	2	6	32110	32115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018887	TAT	2	6	32123	32128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018887	AAC	2	6	39654	39659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018887	TAA	2	6	39663	39668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018887	TAA	2	6	39679	39684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018887	ACT	2	6	39689	39694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_018887	TAT	2	6	39756	39761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018887	ATT	2	6	40707	40712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018887	TTC	2	6	40715	40720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018887	AAT	2	6	40753	40758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018887	TAA	2	6	45386	45391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018887	TAA	2	6	45410	45415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018887	TCC	2	6	46385	46390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_018887	TAA	2	6	46475	46480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018887	ATG	2	6	46573	46578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018887	ATA	2	6	46607	46612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018887	TCT	2	6	46619	46624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_018887	CAA	2	6	46893	46898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_018887	ACA	2	6	47076	47081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_018887	TAC	2	6	47083	47088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018887	TAA	2	6	47119	47124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018887	TAC	2	6	47186	47191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018887	ATT	2	6	47205	47210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018887	ATT	2	6	47235	47240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018887	ATT	2	6	47260	47265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018887	ATT	2	6	47329	47334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018887	TTG	2	6	47546	47551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018887	TAA	2	6	50008	50013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018887	ATT	2	6	50029	50034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018887	TTA	2	6	52393	52398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018887	TCC	2	6	53431	53436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_018887	ATT	2	6	53464	53469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018887	TAA	3	9	53481	53489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018887	TAA	3	9	57191	57199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018887	TAT	2	6	57949	57954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018887	TAA	2	6	58362	58367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018887	ATT	3	9	59023	59031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018887	AAT	2	6	63016	63021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018887	GGA	2	6	70128	70133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018887	AAG	2	6	70225	70230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018887	TTA	2	6	70231	70236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018887	CAA	2	6	70286	70291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_018887	ATT	2	6	70320	70325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018887	TAG	2	6	70343	70348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018887	AGA	2	6	70415	70420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018887	ATA	2	6	72814	72819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018887	ATT	2	6	79349	79354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018887	TAA	2	6	79358	79363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018887	ATT	2	6	79405	79410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018887	ATT	2	6	80805	80810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018887	TAT	2	6	80887	80892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018887	TAA	2	6	80898	80903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018887	ATA	2	6	86863	86868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018887	TAA	2	6	94017	94022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018887	TTA	2	6	94031	94036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018887	AAT	2	6	94062	94067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018887	TAT	2	6	94071	94076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018887	TAA	2	6	94094	94099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018887	AAT	2	6	94118	94123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018887	CTT	2	6	94125	94130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018887	ATT	2	6	94152	94157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018887	ATA	2	6	94162	94167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018887	ATA	2	6	98604	98609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018887	ATA	2	6	98665	98670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018887	ATT	2	6	98674	98679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018887	TAA	2	6	98732	98737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018887	CAA	2	6	112681	112686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_018887	CAA	2	6	112726	112731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_018887	AAT	2	6	112767	112772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018887	TAT	2	6	114632	114637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018887	TCC	2	6	116685	116690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_018887	CTC	2	6	118804	118809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_018887	TAA	2	6	120449	120454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018887	CCT	2	6	120467	120472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_018887	CTT	2	6	120522	120527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_018887	ATA	2	6	120538	120543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018887	ATT	2	6	120601	120606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018887	TAA	2	6	120619	120624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018887	ATA	2	6	120776	120781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018887	CTC	2	6	120955	120960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_018887	CCA	2	6	130989	130994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_018887	TAT	2	6	133713	133718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018887	ATA	2	6	133753	133758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018887	ATA	3	9	133763	133771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018887	AAT	2	6	133818	133823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018887	TAA	3	9	133856	133864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018887	CCT	2	6	137633	137638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_018887	TAT	2	6	137660	137665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018887	CCT	2	6	137695	137700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_018887	ATC	2	6	137757	137762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_018887	ATT	2	6	137765	137770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018887	ATA	2	6	137786	137791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018887	ATT	2	6	137891	137896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018887	CTT	2	6	137905	137910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_018887	CTA	2	6	137962	137967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_018887	ATT	2	6	138380	138385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018887	CAA	2	6	141640	141645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_018887	CCT	2	6	143876	143881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_018887	TTA	2	6	143882	143887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018887	TAT	2	6	144012	144017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018887	ACA	2	6	144063	144068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_018887	CTC	2	6	147183	147188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_018887	ATT	2	6	147239	147244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018887	TAA	2	6	147300	147305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018887	TCC	2	6	148347	148352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_018887	ATT	2	6	148366	148371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018887	TAA	2	6	150490	150495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018887	ATA	2	6	150511	150516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018887	TAA	2	6	150521	150526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018887	TAA	2	6	151882	151887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018887	ATC	2	6	152113	152118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_018887	CCT	2	6	153361	153366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_018887	AAT	2	6	156090	156095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018887	ATG	2	6	157736	157741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018887	ACT	2	6	158188	158193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_018887	TAT	2	6	158227	158232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018887	TAG	2	6	158233	158238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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