MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii HLJ01 chromosome

Total Repeats: 12064

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018887	TTA	3	9	125	133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678749
2	NC_018887	CAA	2	6	363	368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678749
3	NC_018887	TTC	2	6	461	466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678749
4	NC_018887	ACT	2	6	497	502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678749
5	NC_018887	AAC	2	6	517	522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678749
6	NC_018887	TAA	2	6	586	591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678749
7	NC_018887	CTA	2	6	747	752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678750
8	NC_018887	ATA	2	6	859	864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678750
9	NC_018887	ATA	2	6	961	966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678750
10	NC_018887	AGC	2	6	972	977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410678750
11	NC_018887	TCC	2	6	1071	1076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410678750
12	NC_018887	TCC	2	6	1173	1178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410678750
13	NC_018887	CTA	2	6	1378	1383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678750
14	NC_018887	ACT	2	6	1384	1389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678750
15	NC_018887	TCA	2	6	1399	1404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678750
16	NC_018887	CAA	2	6	1409	1414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678750
17	NC_018887	ATC	2	6	1536	1541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678750
18	NC_018887	ATT	2	6	1560	1565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678750
19	NC_018887	TCA	2	6	1646	1651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678750
20	NC_018887	TAG	2	6	1837	1842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678751
21	NC_018887	ATT	2	6	1850	1855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678751
22	NC_018887	CTC	2	6	1860	1865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410678751
23	NC_018887	TAT	2	6	2072	2077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678751
24	NC_018887	TCA	2	6	2079	2084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678751
25	NC_018887	GAA	2	6	2178	2183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678751
26	NC_018887	TCC	2	6	2186	2191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410678751
27	NC_018887	CTC	2	6	2239	2244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410678751
28	NC_018887	AGA	2	6	2285	2290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678751
29	NC_018887	ATT	3	9	2459	2467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678751
30	NC_018887	TAT	2	6	2470	2475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678751
31	NC_018887	ATC	2	6	2555	2560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678751
32	NC_018887	AAG	2	6	2977	2982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678751
33	NC_018887	TAA	2	6	2991	2996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678751
34	NC_018887	CTT	2	6	3001	3006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678751
35	NC_018887	TAA	2	6	3532	3537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678752
36	NC_018887	ATT	2	6	3553	3558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678752
37	NC_018887	ATT	2	6	3621	3626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678752
38	NC_018887	TAA	2	6	3649	3654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678752
39	NC_018887	TGG	2	6	3806	3811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410678752
40	NC_018887	ATA	2	6	3840	3845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678752
41	NC_018887	ATA	2	6	3859	3864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678752
42	NC_018887	TAA	2	6	3880	3885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678752
43	NC_018887	TGA	2	6	3914	3919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678752
44	NC_018887	ATA	2	6	3951	3956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678752
45	NC_018887	AAT	2	6	4091	4096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678752
46	NC_018887	CTA	2	6	4248	4253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678752
47	NC_018887	ATC	2	6	4362	4367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678752
48	NC_018887	TAA	2	6	4393	4398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678752
49	NC_018887	ATG	2	6	4459	4464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678752
50	NC_018887	GAT	2	6	4557	4562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678752
51	NC_018887	ACT	2	6	4725	4730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678753
52	NC_018887	ACA	2	6	4766	4771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678753
53	NC_018887	ATC	2	6	4795	4800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678753
54	NC_018887	TAA	2	6	4891	4896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678753
55	NC_018887	AGG	2	6	4984	4989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410678753
56	NC_018887	TAA	2	6	5011	5016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678753
57	NC_018887	TTG	2	6	5022	5027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410678753
58	NC_018887	TAA	2	6	5064	5069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678753
59	NC_018887	CTA	2	6	5117	5122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678753
60	NC_018887	TAA	2	6	5128	5133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678753
61	NC_018887	TAA	2	6	5139	5144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678753
62	NC_018887	ATA	2	6	5161	5166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678753
63	NC_018887	TAC	2	6	5320	5325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678754
64	NC_018887	TCA	2	6	5372	5377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678754
65	NC_018887	TCT	2	6	5407	5412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678754
66	NC_018887	CTT	2	6	5491	5496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678754
67	NC_018887	CTT	2	6	5520	5525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678754
68	NC_018887	TCA	2	6	5651	5656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678754
69	NC_018887	CCA	2	6	5715	5720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410678754
70	NC_018887	CTT	2	6	5789	5794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678754
71	NC_018887	TTA	2	6	6053	6058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678754
72	NC_018887	TAA	2	6	6168	6173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678754
73	NC_018887	CTT	2	6	6189	6194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678754
74	NC_018887	TAC	2	6	6211	6216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678754
75	NC_018887	ACC	2	6	6345	6350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410678755
76	NC_018887	CAG	2	6	6554	6559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410678755
77	NC_018887	TTA	2	6	6620	6625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678755
78	NC_018887	AGC	2	6	6755	6760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410678755
79	NC_018887	ATT	2	6	6798	6803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678755
80	NC_018887	TAG	2	6	6830	6835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678755
81	NC_018887	ACA	3	9	6902	6910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678755
82	NC_018887	ACT	2	6	6916	6921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678755
83	NC_018887	AAT	2	6	6942	6947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678755
84	NC_018887	TAA	2	6	7004	7009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678755
85	NC_018887	ATA	2	6	7048	7053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678755
86	NC_018887	TAG	2	6	7072	7077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678755
87	NC_018887	TAA	2	6	7108	7113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678755
88	NC_018887	ATA	2	6	7145	7150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678755
89	NC_018887	TAA	2	6	7160	7165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678755
90	NC_018887	ATT	2	6	7605	7610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678756
91	NC_018887	TCT	2	6	7709	7714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678756
92	NC_018887	TTA	2	6	7726	7731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678756
93	NC_018887	ATT	2	6	7953	7958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678756
94	NC_018887	CTT	2	6	7968	7973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678756
95	NC_018887	TCA	2	6	7990	7995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678756
96	NC_018887	TAT	2	6	8054	8059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678756
97	NC_018887	TCA	2	6	8209	8214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678756
98	NC_018887	TGC	2	6	8224	8229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410678756
99	NC_018887	CTA	2	6	8529	8534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678757
100	NC_018887	ATT	2	6	8575	8580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678757
101	NC_018887	TAA	2	6	8674	8679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678757
102	NC_018887	GAA	2	6	8727	8732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678757
103	NC_018887	GTT	2	6	8742	8747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410678757
104	NC_018887	ATA	2	6	8835	8840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678757
105	NC_018887	ACG	2	6	8917	8922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410678757
106	NC_018887	TAA	2	6	8929	8934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678757
107	NC_018887	GAA	2	6	9075	9080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678757
108	NC_018887	AAT	2	6	9177	9182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678758
109	NC_018887	TAA	2	6	9209	9214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678758
110	NC_018887	TGA	2	6	9225	9230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678758
111	NC_018887	AAC	2	6	9309	9314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678758
112	NC_018887	TAA	2	6	9432	9437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678758
113	NC_018887	AAT	2	6	9438	9443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678758
114	NC_018887	ATT	2	6	9444	9449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678758
115	NC_018887	TTA	2	6	9679	9684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678758
116	NC_018887	AGT	2	6	9783	9788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678758
117	NC_018887	GTA	2	6	9826	9831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678758
118	NC_018887	AAT	2	6	9867	9872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678758
119	NC_018887	TAA	2	6	9894	9899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678758
120	NC_018887	TAA	2	6	9938	9943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678758
121	NC_018887	ACA	2	6	10070	10075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678758
122	NC_018887	AAT	2	6	10155	10160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678758
123	NC_018887	ATA	2	6	10203	10208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678759
124	NC_018887	TAT	2	6	10307	10312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678759
125	NC_018887	TAA	2	6	10414	10419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678759
126	NC_018887	AGA	2	6	10628	10633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678760
127	NC_018887	AGT	2	6	10647	10652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678760
128	NC_018887	GCA	2	6	10770	10775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410678760
129	NC_018887	ATA	2	6	10867	10872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678760
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131	NC_018887	TGT	2	6	10933	10938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410678760
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158	NC_018887	ATA	2	6	12960	12965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678763
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246	NC_018887	AAT	2	6	18654	18659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678770
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248	NC_018887	CTT	2	6	18933	18938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678770
249	NC_018887	TCA	2	6	19112	19117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678770
250	NC_018887	AGC	2	6	19432	19437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410678770
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252	NC_018887	ACC	2	6	19456	19461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410678770
253	NC_018887	AAT	4	12	19462	19473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678770
254	NC_018887	TAA	2	6	19501	19506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678770
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256	NC_018887	AGA	2	6	19549	19554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678770
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258	NC_018887	CTT	2	6	20125	20130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678771
259	NC_018887	CTT	2	6	20294	20299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678771
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262	NC_018887	TTC	2	6	20441	20446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678771
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