MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_9p

Total Repeats: 101

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018886	AGA	2	6	183	188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683890
2	NC_018886	AGA	3	9	264	272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683890
3	NC_018886	GGA	2	6	324	329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410683890
4	NC_018886	GAT	2	6	361	366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683890
5	NC_018886	GAC	2	6	415	420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683890
6	NC_018886	TAA	2	6	466	471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410683890
7	NC_018886	TCA	2	6	564	569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410683890
8	NC_018886	GAA	2	6	572	577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683890
9	NC_018886	AAC	2	6	584	589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410683890
10	NC_018886	ATT	2	6	699	704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410683890
11	NC_018886	AAG	2	6	732	737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683890
12	NC_018886	AAG	2	6	882	887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683890
13	NC_018886	GTC	2	6	918	923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683890
14	NC_018886	ATT	2	6	943	948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410683890
15	NC_018886	ATT	2	6	1017	1022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410683890
16	NC_018886	TAT	3	9	1172	1180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410683891
17	NC_018886	ATT	2	6	1286	1291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410683891
18	NC_018886	TAA	2	6	1393	1398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018886	GCA	2	6	1456	1461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_018886	CTA	2	6	1573	1578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_018886	GAT	2	6	1672	1677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018886	TTG	2	6	1985	1990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018886	ATG	2	6	2145	2150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018886	TTA	2	6	2294	2299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410683892
25	NC_018886	ATA	2	6	2603	2608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018886	ATT	2	6	2671	2676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018886	GTA	2	6	2760	2765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683893
28	NC_018886	ATA	2	6	2803	2808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410683893
29	NC_018886	TAA	2	6	2852	2857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410683893
30	NC_018886	TCT	2	6	2880	2885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410683893
31	NC_018886	GAT	2	6	2961	2966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683893
32	NC_018886	AAT	2	6	2977	2982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410683893
33	NC_018886	ATG	2	6	3016	3021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018886	TAG	2	6	3221	3226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018886	TGA	2	6	3246	3251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018886	ATT	2	6	3488	3493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410683894
37	NC_018886	ATT	2	6	3528	3533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410683894
38	NC_018886	AAC	2	6	3573	3578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410683894
39	NC_018886	AGA	3	9	3581	3589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683894
40	NC_018886	TAT	2	6	3606	3611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410683894
41	NC_018886	TAT	2	6	3723	3728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410683894
42	NC_018886	AGA	2	6	3812	3817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683894
43	NC_018886	TGA	2	6	3824	3829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683894
44	NC_018886	TAT	2	6	3870	3875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410683894
45	NC_018886	TCA	2	6	3881	3886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410683894
46	NC_018886	TTA	2	6	3891	3896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410683894
47	NC_018886	AGA	2	6	4022	4027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683894
48	NC_018886	TAA	2	6	4046	4051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410683894
49	NC_018886	TCT	2	6	4151	4156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410683894
50	NC_018886	AAG	2	6	4174	4179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683894
51	NC_018886	TTA	2	6	4200	4205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410683894
52	NC_018886	GAA	2	6	4419	4424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683894
53	NC_018886	GAA	2	6	4443	4448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683894
54	NC_018886	TTA	2	6	4506	4511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410683894
55	NC_018886	ATG	2	6	4529	4534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683894
56	NC_018886	ACA	2	6	4571	4576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410683895
57	NC_018886	AAT	2	6	4598	4603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410683895
58	NC_018886	ATG	2	6	4617	4622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683895
59	NC_018886	ATT	2	6	4640	4645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410683895
60	NC_018886	CAA	2	6	4646	4651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410683895
61	NC_018886	CAA	2	6	4686	4691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018886	ATT	2	6	4716	4721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018886	TAT	2	6	4754	4759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018886	AAT	2	6	4768	4773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018886	GGA	2	6	4867	4872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410683896
66	NC_018886	AAT	2	6	4903	4908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410683896
67	NC_018886	AAC	2	6	4930	4935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410683896
68	NC_018886	ATA	2	6	4939	4944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410683896
69	NC_018886	GAA	2	6	5023	5028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683896
70	NC_018886	TTG	2	6	5057	5062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410683896
71	NC_018886	TAA	2	6	5073	5078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410683896
72	NC_018886	ATG	2	6	5099	5104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683896
73	NC_018886	ACA	2	6	5124	5129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410683896
74	NC_018886	TGG	2	6	5235	5240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410683896
75	NC_018886	AAG	2	6	5273	5278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683896
76	NC_018886	TTA	2	6	5343	5348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410683896
77	NC_018886	ATT	2	6	5501	5506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410683897
78	NC_018886	TAG	2	6	5520	5525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683897
79	NC_018886	TAT	2	6	5619	5624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018886	GAC	2	6	5771	5776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_018886	CAC	2	6	5990	5995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_018886	TGA	2	6	6254	6259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018886	AGT	2	6	6326	6331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018886	TTG	2	6	6430	6435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410683898
85	NC_018886	TAG	2	6	6464	6469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683898
86	NC_018886	GTG	2	6	6533	6538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410683898
87	NC_018886	ATG	2	6	6599	6604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018886	CGG	2	6	6836	6841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018886	ATT	2	6	7044	7049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410683899
90	NC_018886	TGT	2	6	7172	7177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410683899
91	NC_018886	TTG	2	6	7178	7183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410683899
92	NC_018886	TGA	2	6	7322	7327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683899
93	NC_018886	GTG	2	6	7477	7482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410683899
94	NC_018886	ACA	2	6	7535	7540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410683899
95	NC_018886	AGA	2	6	7547	7552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683899
96	NC_018886	GTC	2	6	7724	7729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683899
97	NC_018886	AGA	2	6	7742	7747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683899
98	NC_018886	TGA	3	9	8018	8026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683899
99	NC_018886	GAA	2	6	8070	8075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683899
100	NC_018886	CAA	2	6	8076	8081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410683899
101	NC_018886	GAG	2	6	8508	8513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.