MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_7p

Total Repeats: 74

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018882	AGA	2	6	183	188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514403574
2	NC_018882	CAA	2	6	357	362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514403574
3	NC_018882	GAA	2	6	383	388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514403574
4	NC_018882	TAA	2	6	466	471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514403574
5	NC_018882	TAA	2	6	478	483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514403574
6	NC_018882	ATT	2	6	484	489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514403574
7	NC_018882	TCA	2	6	564	569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514403574
8	NC_018882	GAA	2	6	572	577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514403574
9	NC_018882	AAC	2	6	584	589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514403574
10	NC_018882	GAA	2	6	734	739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514403574
11	NC_018882	TAT	3	9	1016	1024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514403574
12	NC_018882	GAA	2	6	1198	1203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018882	TGA	2	6	1302	1307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018882	GCA	2	6	1389	1394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018882	TGA	2	6	1517	1522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018882	TAC	2	6	1531	1536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018882	TGT	2	6	1919	1924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018882	ATG	2	6	2078	2083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018882	TGA	2	6	2114	2119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018882	TTA	2	6	2226	2231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514403575
21	NC_018882	AGT	2	6	2452	2457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514403576
22	NC_018882	TAG	2	6	2522	2527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514403576
23	NC_018882	GTT	2	6	2543	2548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514403576
24	NC_018882	CAA	2	6	2783	2788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018882	AAT	2	6	2800	2805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018882	ATA	2	6	2920	2925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018882	AGT	2	6	3076	3081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514403577
28	NC_018882	AAT	2	6	3294	3299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514403577
29	NC_018882	ATG	2	6	3333	3338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018882	TGG	2	6	3598	3603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018882	TGA	2	6	3607	3612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018882	CAC	2	6	3785	3790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_018882	AGT	2	6	4003	4008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018882	GAG	2	6	4100	4105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018882	ATG	2	6	4156	4161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018882	TTC	2	6	4206	4211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_018882	CGG	2	6	4361	4366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_018882	GAA	2	6	4444	4449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018882	ATT	2	6	4567	4572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514403578
40	NC_018882	TGT	2	6	4695	4700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514403578
41	NC_018882	TTG	2	6	4701	4706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514403578
42	NC_018882	TGA	2	6	4845	4850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514403578
43	NC_018882	GTG	2	6	5000	5005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514403578
44	NC_018882	CAA	2	6	5059	5064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514403578
45	NC_018882	AGA	2	6	5214	5219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514403578
46	NC_018882	TCT	2	6	5248	5253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514403578
47	NC_018882	GAT	2	6	5317	5322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514403578
48	NC_018882	TGA	3	9	5541	5549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514403578
49	NC_018882	GAA	2	6	5593	5598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514403578
50	NC_018882	CAA	2	6	5599	5604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514403578
51	NC_018882	GAA	2	6	5624	5629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514403578
52	NC_018882	ATT	2	6	5677	5682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514403579
53	NC_018882	CAA	2	6	5687	5692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514403579
54	NC_018882	AAT	2	6	5762	5767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514403579
55	NC_018882	TGA	2	6	5815	5820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514403579
56	NC_018882	TGT	2	6	5947	5952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514403579
57	NC_018882	AAT	2	6	5976	5981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514403579
58	NC_018882	AGG	2	6	5990	5995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018882	ATA	2	6	6052	6057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018882	TGA	2	6	6160	6165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514403580
61	NC_018882	TTC	2	6	6190	6195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514403580
62	NC_018882	CTA	2	6	6213	6218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514403580
63	NC_018882	AAT	2	6	6356	6361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514403580
64	NC_018882	TAA	2	6	6439	6444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514403580
65	NC_018882	TCC	2	6	6560	6565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_018882	TTC	2	6	6713	6718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514403581
67	NC_018882	AGT	2	6	6761	6766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514403581
68	NC_018882	TCC	2	6	6873	6878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_018882	TCT	2	6	7001	7006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_018882	TAT	3	9	7044	7052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018882	GTT	2	6	7358	7363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514403582
72	NC_018882	AAT	2	6	7407	7412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514403582
73	NC_018882	TCT	2	6	7502	7507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514403582
74	NC_018882	CGG	2	6	7611	7616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514403582

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.