MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_7p

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018882	AGA	2	6	183	188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514403574
2	NC_018882	CAA	2	6	357	362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514403574
3	NC_018882	GAA	2	6	383	388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514403574
4	NC_018882	TAA	2	6	466	471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514403574
5	NC_018882	TAA	2	6	478	483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514403574
6	NC_018882	ATT	2	6	484	489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514403574
7	NC_018882	TCA	2	6	564	569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514403574
8	NC_018882	GAA	2	6	572	577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514403574
9	NC_018882	AAC	2	6	584	589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514403574
10	NC_018882	GAA	2	6	734	739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514403574
11	NC_018882	TAT	3	9	1016	1024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514403574
12	NC_018882	TTA	2	6	2226	2231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514403575
13	NC_018882	AGT	2	6	2452	2457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514403576
14	NC_018882	TAG	2	6	2522	2527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514403576
15	NC_018882	GTT	2	6	2543	2548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514403576
16	NC_018882	AGT	2	6	3076	3081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514403577
17	NC_018882	AAT	2	6	3294	3299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514403577
18	NC_018882	ATT	2	6	4567	4572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514403578
19	NC_018882	TGT	2	6	4695	4700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514403578
20	NC_018882	TTG	2	6	4701	4706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514403578
21	NC_018882	TGA	2	6	4845	4850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514403578
22	NC_018882	GTG	2	6	5000	5005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514403578
23	NC_018882	CAA	2	6	5059	5064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514403578
24	NC_018882	AGA	2	6	5214	5219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514403578
25	NC_018882	TCT	2	6	5248	5253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514403578
26	NC_018882	GAT	2	6	5317	5322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514403578
27	NC_018882	TGA	3	9	5541	5549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514403578
28	NC_018882	GAA	2	6	5593	5598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514403578
29	NC_018882	CAA	2	6	5599	5604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514403578
30	NC_018882	GAA	2	6	5624	5629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514403578
31	NC_018882	ATT	2	6	5677	5682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514403579
32	NC_018882	CAA	2	6	5687	5692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514403579
33	NC_018882	AAT	2	6	5762	5767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514403579
34	NC_018882	TGA	2	6	5815	5820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514403579
35	NC_018882	TGT	2	6	5947	5952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514403579
36	NC_018882	AAT	2	6	5976	5981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514403579
37	NC_018882	TGA	2	6	6160	6165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514403580
38	NC_018882	TTC	2	6	6190	6195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514403580
39	NC_018882	CTA	2	6	6213	6218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514403580
40	NC_018882	AAT	2	6	6356	6361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514403580
41	NC_018882	TAA	2	6	6439	6444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514403580
42	NC_018882	TTC	2	6	6713	6718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514403581
43	NC_018882	AGT	2	6	6761	6766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514403581
44	NC_018882	GTT	2	6	7358	7363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514403582
45	NC_018882	AAT	2	6	7407	7412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514403582
46	NC_018882	TCT	2	6	7502	7507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514403582
47	NC_018882	CGG	2	6	7611	7616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514403582

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.