MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_8p

Total Repeats: 133

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018881	TAA	2	6	47	52	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018881	AGG	2	6	60	65	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018881	GAA	2	6	75	80	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678744
4	NC_018881	AAG	2	6	133	138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678744
5	NC_018881	ACA	3	9	221	229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678744
6	NC_018881	GAG	2	6	240	245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410678744
7	NC_018881	CAA	2	6	258	263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678744
8	NC_018881	ACA	4	12	278	289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678744
9	NC_018881	TAA	2	6	320	325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678744
10	NC_018881	AGG	2	6	366	371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018881	GAT	2	6	385	390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018881	GAT	2	6	502	507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018881	ACA	2	6	589	594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_018881	GAA	2	6	730	735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678745
15	NC_018881	TCT	2	6	881	886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678745
16	NC_018881	TAA	2	6	1078	1083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018881	GTT	2	6	1143	1148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018881	TAT	2	6	1164	1169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018881	TTA	2	6	1177	1182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018881	TAA	2	6	1259	1264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018881	TAA	3	9	1432	1440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018881	GTT	2	6	1481	1486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018881	CGG	2	6	1518	1523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410678746
24	NC_018881	GAA	2	6	1567	1572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678746
25	NC_018881	GCA	2	6	1617	1622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410678746
26	NC_018881	TGA	2	6	1703	1708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678746
27	NC_018881	TAT	2	6	1920	1925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678746
28	NC_018881	TAG	2	6	1978	1983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678746
29	NC_018881	TAA	2	6	2012	2017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678746
30	NC_018881	TTA	2	6	2098	2103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678746
31	NC_018881	ATT	2	6	2170	2175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678746
32	NC_018881	GAA	2	6	2180	2185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678746
33	NC_018881	GTT	2	6	2414	2419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410678746
34	NC_018881	TGA	2	6	2420	2425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678746
35	NC_018881	GAA	3	9	2433	2441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678746
36	NC_018881	CAA	2	6	2485	2490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678746
37	NC_018881	AGA	2	6	2525	2530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678746
38	NC_018881	TTA	2	6	2533	2538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678746
39	NC_018881	GAT	2	6	2610	2615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678746
40	NC_018881	TGA	2	6	2699	2704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678746
41	NC_018881	TTA	2	6	2733	2738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678746
42	NC_018881	ATT	2	6	2765	2770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678746
43	NC_018881	TTG	2	6	2895	2900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410678746
44	NC_018881	TAA	2	6	2990	2995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678746
45	NC_018881	ATT	2	6	3015	3020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678746
46	NC_018881	TGA	2	6	3052	3057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678746
47	NC_018881	TAT	2	6	3061	3066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678746
48	NC_018881	ATT	2	6	3090	3095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678746
49	NC_018881	TGA	2	6	3104	3109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678746
50	NC_018881	TTC	2	6	3134	3139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678746
51	NC_018881	ATG	2	6	3271	3276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678746
52	NC_018881	TAA	2	6	3380	3385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678746
53	NC_018881	ATT	2	6	3412	3417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678746
54	NC_018881	TTG	2	6	3496	3501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410678746
55	NC_018881	ATG	2	6	3505	3510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678746
56	NC_018881	TAA	2	6	3677	3682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678746
57	NC_018881	TAT	2	6	3685	3690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678746
58	NC_018881	GAA	2	6	3710	3715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678746
59	NC_018881	AAT	2	6	3801	3806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678746
60	NC_018881	TTC	2	6	3883	3888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_018881	GAA	2	6	3897	3902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018881	TAT	2	6	3939	3944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018881	TGT	2	6	3994	3999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018881	AGA	2	6	4025	4030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018881	AAT	2	6	4040	4045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018881	TGA	2	6	4058	4063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018881	ACA	2	6	4064	4069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_018881	ATC	2	6	4225	4230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_018881	GTC	2	6	4243	4248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_018881	TAA	2	6	4286	4291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678747
71	NC_018881	TTA	2	6	4518	4523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678747
72	NC_018881	AGA	2	6	4576	4581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678747
73	NC_018881	TTG	2	6	4585	4590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410678747
74	NC_018881	AGA	2	6	4631	4636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678747
75	NC_018881	CTT	2	6	4645	4650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678747
76	NC_018881	TGA	2	6	4655	4660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678747
77	NC_018881	GAT	3	9	4686	4694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678747
78	NC_018881	GAA	2	6	4748	4753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678747
79	NC_018881	TTG	2	6	4777	4782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410678747
80	NC_018881	TAT	2	6	5034	5039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018881	TTG	2	6	5088	5093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018881	TAG	2	6	5100	5105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018881	TCT	2	6	5117	5122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_018881	ATT	2	6	5192	5197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018881	CTT	2	6	5205	5210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_018881	TAT	2	6	5300	5305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018881	AGA	2	6	5309	5314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018881	TGA	3	9	5372	5380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018881	ATT	2	6	5382	5387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018881	GAA	2	6	5418	5423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018881	ATG	2	6	5524	5529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018881	ATA	2	6	5536	5541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018881	ATT	2	6	5583	5588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018881	AGA	2	6	5592	5597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018881	TTA	2	6	5729	5734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018881	TGT	2	6	5802	5807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018881	AAG	2	6	5836	5841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018881	TGA	2	6	5846	5851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018881	AGC	2	6	5864	5869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_018881	ATT	2	6	5877	5882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018881	CTA	2	6	5963	5968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_018881	ATC	2	6	6025	6030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_018881	TGT	2	6	6045	6050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018881	CAA	2	6	6155	6160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_018881	ACC	2	6	6184	6189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_018881	ACC	2	6	6195	6200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_018881	TAA	2	6	6204	6209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018881	TCA	2	6	6517	6522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_018881	CTT	2	6	6559	6564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_018881	AAT	2	6	6681	6686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018881	GCA	2	6	6940	6945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018881	AAG	2	6	7000	7005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018881	AGA	2	6	7223	7228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018881	AAG	2	6	7270	7275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018881	TCA	2	6	7291	7296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_018881	AAG	2	6	7362	7367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018881	AAT	2	6	7600	7605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018881	TAT	2	6	7622	7627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018881	TTA	2	6	7710	7715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678748
120	NC_018881	ACA	2	6	7724	7729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678748
121	NC_018881	AGC	2	6	7735	7740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410678748
122	NC_018881	TAT	2	6	7778	7783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678748
123	NC_018881	CTT	2	6	7813	7818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678748
124	NC_018881	TTA	3	9	7877	7885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678748
125	NC_018881	AGA	2	6	7912	7917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678748
126	NC_018881	TTG	2	6	7929	7934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410678748
127	NC_018881	ATA	2	6	8001	8006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678748
128	NC_018881	AAT	2	6	8045	8050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678748
129	NC_018881	TGA	2	6	8056	8061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678748
130	NC_018881	GAT	2	6	8101	8106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678748
131	NC_018881	TGG	2	6	8178	8183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410678748
132	NC_018881	TAA	2	6	8191	8196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678748
133	NC_018881	TGG	2	6	8204	8209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410678748

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.