MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_8p

Total Repeats: 71

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018881	GAA	2	6	75	80	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678744
2	NC_018881	AAG	2	6	133	138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678744
3	NC_018881	ACA	3	9	221	229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678744
4	NC_018881	GAG	2	6	240	245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410678744
5	NC_018881	CAA	2	6	258	263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678744
6	NC_018881	ACA	4	12	278	289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678744
7	NC_018881	TAA	2	6	320	325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678744
8	NC_018881	GAA	2	6	730	735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678745
9	NC_018881	TCT	2	6	881	886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678745
10	NC_018881	CGG	2	6	1518	1523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410678746
11	NC_018881	GAA	2	6	1567	1572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678746
12	NC_018881	GCA	2	6	1617	1622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410678746
13	NC_018881	TGA	2	6	1703	1708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678746
14	NC_018881	TAT	2	6	1920	1925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678746
15	NC_018881	TAG	2	6	1978	1983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678746
16	NC_018881	TAA	2	6	2012	2017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678746
17	NC_018881	TTA	2	6	2098	2103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678746
18	NC_018881	ATT	2	6	2170	2175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678746
19	NC_018881	GAA	2	6	2180	2185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678746
20	NC_018881	GTT	2	6	2414	2419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410678746
21	NC_018881	TGA	2	6	2420	2425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678746
22	NC_018881	GAA	3	9	2433	2441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678746
23	NC_018881	CAA	2	6	2485	2490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678746
24	NC_018881	AGA	2	6	2525	2530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678746
25	NC_018881	TTA	2	6	2533	2538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678746
26	NC_018881	GAT	2	6	2610	2615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678746
27	NC_018881	TGA	2	6	2699	2704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678746
28	NC_018881	TTA	2	6	2733	2738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678746
29	NC_018881	ATT	2	6	2765	2770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678746
30	NC_018881	TTG	2	6	2895	2900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410678746
31	NC_018881	TAA	2	6	2990	2995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678746
32	NC_018881	ATT	2	6	3015	3020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678746
33	NC_018881	TGA	2	6	3052	3057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678746
34	NC_018881	TAT	2	6	3061	3066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678746
35	NC_018881	ATT	2	6	3090	3095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678746
36	NC_018881	TGA	2	6	3104	3109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678746
37	NC_018881	TTC	2	6	3134	3139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678746
38	NC_018881	ATG	2	6	3271	3276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678746
39	NC_018881	TAA	2	6	3380	3385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678746
40	NC_018881	ATT	2	6	3412	3417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678746
41	NC_018881	TTG	2	6	3496	3501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410678746
42	NC_018881	ATG	2	6	3505	3510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678746
43	NC_018881	TAA	2	6	3677	3682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678746
44	NC_018881	TAT	2	6	3685	3690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678746
45	NC_018881	GAA	2	6	3710	3715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678746
46	NC_018881	AAT	2	6	3801	3806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678746
47	NC_018881	TAA	2	6	4286	4291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678747
48	NC_018881	TTA	2	6	4518	4523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678747
49	NC_018881	AGA	2	6	4576	4581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678747
50	NC_018881	TTG	2	6	4585	4590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410678747
51	NC_018881	AGA	2	6	4631	4636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678747
52	NC_018881	CTT	2	6	4645	4650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678747
53	NC_018881	TGA	2	6	4655	4660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678747
54	NC_018881	GAT	3	9	4686	4694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678747
55	NC_018881	GAA	2	6	4748	4753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678747
56	NC_018881	TTG	2	6	4777	4782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410678747
57	NC_018881	TTA	2	6	7710	7715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678748
58	NC_018881	ACA	2	6	7724	7729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678748
59	NC_018881	AGC	2	6	7735	7740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410678748
60	NC_018881	TAT	2	6	7778	7783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678748
61	NC_018881	CTT	2	6	7813	7818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678748
62	NC_018881	TTA	3	9	7877	7885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678748
63	NC_018881	AGA	2	6	7912	7917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678748
64	NC_018881	TTG	2	6	7929	7934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410678748
65	NC_018881	ATA	2	6	8001	8006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678748
66	NC_018881	AAT	2	6	8045	8050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678748
67	NC_018881	TGA	2	6	8056	8061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678748
68	NC_018881	GAT	2	6	8101	8106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678748
69	NC_018881	TGG	2	6	8178	8183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410678748
70	NC_018881	TAA	2	6	8191	8196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678748
71	NC_018881	TGG	2	6	8204	8209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410678748

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.