MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_78p

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018879	ATACAT	2	12	215	226	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018879	TTAAAA	2	12	2984	2995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678640
3	NC_018879	CGTATT	2	12	4928	4939	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	410678643
4	NC_018879	TTCATA	2	12	5064	5075	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	410678643
5	NC_018879	ACTTTT	2	12	8178	8189	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	410678647
6	NC_018879	AGCTGC	2	12	10917	10928	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018879	CTTTAG	2	12	11828	11839	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	410678654
8	NC_018879	AACAAA	2	12	12357	12368	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_018879	CAAATA	2	12	12696	12707	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	410678655
10	NC_018879	ATTTAG	2	12	16516	16527	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018879	CATTAA	2	12	18142	18153	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	410678659
12	NC_018879	ACTAAA	2	12	18235	18246	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	410678659
13	NC_018879	TTTCAT	2	12	22363	22374	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	410678668
14	NC_018879	ATTAAA	2	12	26627	26638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678679
15	NC_018879	ACAAAA	2	12	26680	26691	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	410678679
16	NC_018879	AAACCA	2	12	27163	27174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018879	TCCTGT	2	12	28442	28453	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	410678682
18	NC_018879	CATCTT	2	12	29916	29927	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	410678684
19	NC_018879	CAAATT	2	12	32145	32156	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	410678686
20	NC_018879	AACTTG	2	12	34061	34072	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	410678688
21	NC_018879	ACCAAA	2	12	38041	38052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678690
22	NC_018879	TGCTGT	2	12	38218	38229	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	410678690
23	NC_018879	CATTGC	2	12	39808	39819	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	410678692
24	NC_018879	TCCTGT	2	12	41810	41821	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	410678694
25	NC_018879	CTGATC	2	12	44659	44670	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	410678696
26	NC_018879	TCTTTT	2	12	46674	46685	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	410678699
27	NC_018879	ATTTTT	2	12	51098	51109	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	410678702
28	NC_018879	TTTGTT	2	12	51384	51395	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	410678704
29	NC_018879	TTTTTA	2	12	54339	54350	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	410678705
30	NC_018879	TAATCA	2	12	55426	55437	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_018879	AGCTGC	2	12	60897	60908	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018879	ATATGG	2	12	65674	65685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678717
33	NC_018879	CTTCAC	2	12	70206	70217	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	410678721
34	NC_018879	CTTTCT	2	12	70543	70554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678722
35	NC_018879	ATGAAT	2	12	70958	70969	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	410678723

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.